cluster # 5277

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Schistosoma mansoni
cluster # 5277 cluster # 5277 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5277#0 length = 867 sequences # 3

consensusID : consensus_5277#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 867
fasta sequence

                              [GCTGGAGTTGTCATACCATGGACATTTGTTTACGATCATGTTCTAACCACTCTGTATTATTTGAATGATCAAAATTCAATTGGAGATATAAACAATCAAGATATCTCTTGGCTTCCATCTTTAATTGGATTCGGTTTGCTATTTGGTCAGTTGTTTTATGGTCTGATAACTTCTCAGTTTGGTGACATCGGTACCTGTTTTAAAAATAACAATCAAGATTCCAAAGTTGAAAATGGTAGCACTTGTTGTCAACGAAATTGCTTTCAATCCATCAATAAAAAATGTCCATCGTCAAAGTATCAATTTCATTTAGCAATCTTCCTGATAACACTTCTTTTAAATAGCGCATGTACACTAACTTTAGCTTTAGTCCCATTATGGTCTGTTCAAAGTGAATCAAAGCACTTCGAATTATTCTCGCATCAAGAAGGAAAATTATTAGCGTTGGCTTGCTTCTTTGTCGGCATATCGAATGGTGGATTGTACGTCGTGTTTCCGCAGTTAATCATTGATATTGTTGGTACTGAATTATGGTCTTCTGGACTTGGCTTATTTTTAACTTTTAACGGTCTTATGAATTTGTGTGGAACTAATATTGGAGGCAAAATATATGACACTAGAGGTTCATATCAAATGGCACTTTTAATCGCCGCATTTCTGTCGCTATTTGCTTTTCTTTTGGTCGTCATGAAGGAGATATTCACGTGGTTAATGAAGAGATCTACGTTATCTGCCAATTCTGATTAAATGCAAAGACAAATTTAAATATGATTTTATTTATACTAAGGATTTAAGTGACATTCTAGAAGTCTCTTTTTTTTTACTGCATATTGTATTGTTCACTAGTAAACTATTTAAAGATGGCCT]

[+] EMBL CD078711             [GCTGGAGTTGTCATACCATGGACATTTGTTTACGATCATGTTCTAACCACTCTGTATTATTTGAATGATCAAAATTCAATTGGAGATATAAACAATCAAGATATCTCTTGGCTTCCATCTTTAATTGGATTCGGTTTGCTATTTGGTCAGTTGTTTTATGGTCTGATAACTTCTCAGTTTGGTGACATCGGTACCTGTTTTAAAAATAACAATCAAGATTCCAAAGTTGAAAATGGTAGCACTTGTTGTCAACGAAATTGCTTTCAATCCATCAATAAAAAATGTCCATCGTCAAAGTATCAATTTCATTTAGCAATCTTCCTGATAACACTTCTTTTAAATAGCGCATGTACACTAACTTTAGCTTTAGTCCCATTATGGTCTGTTCAAAGTGAATCAAAGCACTTCGAATTATTCTCGCATCAAGAAGGAAAATTATTAGCGTTGGCTTGCTTCTTTGTCGGCATATCGAATGGTGGATTGTACGTCGTGTTTCCGCAGTTAATCATTGATATTGTTGGTACTGAATTATGGTCTTCTGGACTTGGCTTATTTTTAACTNTTAACGGTCTTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD073174             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGTACACTAACTTTAGCTTTAGTCCCATTATGGTCTGTTCAAAGTGAATCAAAGCACTTCGAATTATTCTCGCATCAAGAAGGAAAATTATTAGCGTTGGCTTGCTTCTTTGTCGGCATATCGAATGGTGGATTGTACGTCGTGTTTCCGCAGTTAATCATTGATATTGTTGGTACTGAATTATGGTCTTCTGGACTTGGCTTATTTTTAACTTTTAACGGTCTTATGAATTTGTGTGGAACTAATATTGGAGGCAAAATATATGACACTAGAGGTTCATATCAAATGGCACTTTTAATCGCCGCATTTCTGTCGCTATTTGCTTTTCTTTTGGTCGTCATGAAGGAGATATTCACGTGGTTAATGAAGAGATCTACGTTATCTGCCAATTCTGATTAAATGCAAAGACAAATTTAAATATGATTTTATTTATACTAAGGATTTAAGTGACATTCTAGAAGTCTCTTTTTTTTTACTGCATATTGTATTGTTCACTAGTAAACTATTTAAAGATGGCCT]
[-] EMBL AW016998             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTTGGCTTGCTTCTTTGTCGGCATATCGAATGGTGGATTGTACGTCATGTTTCCGCAGTTAATCATTGATATTGTTGGTACTGAATTATGGTCTTCTGGACTTGGCTTATTTTTAACTTTTAACGGTCTTATGAATTTGTTTGGAACTAATATTGGAGGCAAAATATATGACACTAGAGGTTCATATCAAATGGCACTTTTAATCGCCGCATTTCTGTCGCTATTTGCTTTTCTTTTGGTCGTCATGAAGGAGATATTCACGTGGTTAATGAAGAGATCTACGTTATCTGCCAATTCTGATTAAATGCAAAGACAAATTTAAATATGATTTTATTTATACTAAGGATTTAAGTGACA                                                                   ]




>consensus_5277#0
GCTGGAGTTGTCATACCATGGACATTTGTTTACGATCATGTTCTAACCACTCTGTATTAT
TTGAATGATCAAAATTCAATTGGAGATATAAACAATCAAGATATCTCTTGGCTTCCATCT
TTAATTGGATTCGGTTTGCTATTTGGTCAGTTGTTTTATGGTCTGATAACTTCTCAGTTT
GGTGACATCGGTACCTGTTTTAAAAATAACAATCAAGATTCCAAAGTTGAAAATGGTAGC
ACTTGTTGTCAACGAAATTGCTTTCAATCCATCAATAAAAAATGTCCATCGTCAAAGTAT
CAATTTCATTTAGCAATCTTCCTGATAACACTTCTTTTAAATAGCGCATGTACACTAACT
TTAGCTTTAGTCCCATTATGGTCTGTTCAAAGTGAATCAAAGCACTTCGAATTATTCTCG
CATCAAGAAGGAAAATTATTAGCGTTGGCTTGCTTCTTTGTCGGCATATCGAATGGTGGA
TTGTACGTCGTGTTTCCGCAGTTAATCATTGATATTGTTGGTACTGAATTATGGTCTTCT
GGACTTGGCTTATTTTTAACTTTTAACGGTCTTATGAATTTGTGTGGAACTAATATTGGA
GGCAAAATATATGACACTAGAGGTTCATATCAAATGGCACTTTTAATCGCCGCATTTCTG
TCGCTATTTGCTTTTCTTTTGGTCGTCATGAAGGAGATATTCACGTGGTTAATGAAGAGA
TCTACGTTATCTGCCAATTCTGATTAAATGCAAAGACAAATTTAAATATGATTTTATTTA
TACTAAGGATTTAAGTGACATTCTAGAAGTCTCTTTTTTTTTACTGCATATTGTATTGTT
CACTAGTAAACTATTTAAAGATGGCCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case