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Schistosoma mansoni
cluster # 5277 cluster # 5277       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5277#0 length = 867 sequences # 3  

consensusID : consensus_5277#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 867
fasta sequence
                              [GCTGGAGTTGTCATACCATGGACATTTGTTTACGATCATGTTCTAACCACTCTGTATTATTTGAATGATCAAAATTCAATTGGAGATATAAACAATCAAGATATCTCTTGGCTTCCATCTTTAATTGGATTCGGTTTGCTATTTGGTCAGTTGTTTTATGGTCTGATAACTTCTCAGTTTGGTGACATCGGTACCTGTTTTAAAAATAACAATCAAGATTCCAAAGTTGAAAATGGTAGCACTTGTTGTCAACGAAATTGCTTTCAATCCATCAATAAAAAATGTCCATCGTCAAAGTATCAATTTCATTTAGCAATCTTCCTGATAACACTTCTTTTAAATAGCGCATGTACACTAACTTTAGCTTTAGTCCCATTATGGTCTGTTCAAAGTGAATCAAAGCACTTCGAATTATTCTCGCATCAAGAAGGAAAATTATTAGCGTTGGCTTGCTTCTTTGTCGGCATATCGAATGGTGGATTGTACGTCGTGTTTCCGCAGTTAATCATTGATATTGTTGGTACTGAATTATGGTCTTCTGGACTTGGCTTATTTTTAACTTTTAACGGTCTTATGAATTTGTGTGGAACTAATATTGGAGGCAAAATATATGACACTAGAGGTTCATATCAAATGGCACTTTTAATCGCCGCATTTCTGTCGCTATTTGCTTTTCTTTTGGTCGTCATGAAGGAGATATTCACGTGGTTAATGAAGAGATCTACGTTATCTGCCAATTCTGATTAAATGCAAAGACAAATTTAAATATGATTTTATTTATACTAAGGATTTAAGTGACATTCTAGAAGTCTCTTTTTTTTTACTGCATATTGTATTGTTCACTAGTAAACTATTTAAAGATGGCCT]

[+] EMBL CD078711             [GCTGGAGTTGTCATACCATGGACATTTGTTTACGATCATGTTCTAACCACTCTGTATTATTTGAATGATCAAAATTCAATTGGAGATATAAACAATCAAGATATCTCTTGGCTTCCATCTTTAATTGGATTCGGTTTGCTATTTGGTCAGTTGTTTTATGGTCTGATAACTTCTCAGTTTGGTGACATCGGTACCTGTTTTAAAAATAACAATCAAGATTCCAAAGTTGAAAATGGTAGCACTTGTTGTCAACGAAATTGCTTTCAATCCATCAATAAAAAATGTCCATCGTCAAAGTATCAATTTCATTTAGCAATCTTCCTGATAACACTTCTTTTAAATAGCGCATGTACACTAACTTTAGCTTTAGTCCCATTATGGTCTGTTCAAAGTGAATCAAAGCACTTCGAATTATTCTCGCATCAAGAAGGAAAATTATTAGCGTTGGCTTGCTTCTTTGTCGGCATATCGAATGGTGGATTGTACGTCGTGTTTCCGCAGTTAATCATTGATATTGTTGGTACTGAATTATGGTCTTCTGGACTTGGCTTATTTTTAACTNTTAACGGTCTTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD073174             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGTACACTAACTTTAGCTTTAGTCCCATTATGGTCTGTTCAAAGTGAATCAAAGCACTTCGAATTATTCTCGCATCAAGAAGGAAAATTATTAGCGTTGGCTTGCTTCTTTGTCGGCATATCGAATGGTGGATTGTACGTCGTGTTTCCGCAGTTAATCATTGATATTGTTGGTACTGAATTATGGTCTTCTGGACTTGGCTTATTTTTAACTTTTAACGGTCTTATGAATTTGTGTGGAACTAATATTGGAGGCAAAATATATGACACTAGAGGTTCATATCAAATGGCACTTTTAATCGCCGCATTTCTGTCGCTATTTGCTTTTCTTTTGGTCGTCATGAAGGAGATATTCACGTGGTTAATGAAGAGATCTACGTTATCTGCCAATTCTGATTAAATGCAAAGACAAATTTAAATATGATTTTATTTATACTAAGGATTTAAGTGACATTCTAGAAGTCTCTTTTTTTTTACTGCATATTGTATTGTTCACTAGTAAACTATTTAAAGATGGCCT]
[-] EMBL AW016998             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTTGGCTTGCTTCTTTGTCGGCATATCGAATGGTGGATTGTACGTCATGTTTCCGCAGTTAATCATTGATATTGTTGGTACTGAATTATGGTCTTCTGGACTTGGCTTATTTTTAACTTTTAACGGTCTTATGAATTTGTTTGGAACTAATATTGGAGGCAAAATATATGACACTAGAGGTTCATATCAAATGGCACTTTTAATCGCCGCATTTCTGTCGCTATTTGCTTTTCTTTTGGTCGTCATGAAGGAGATATTCACGTGGTTAATGAAGAGATCTACGTTATCTGCCAATTCTGATTAAATGCAAAGACAAATTTAAATATGATTTTATTTATACTAAGGATTTAAGTGACA                                                                   ]


>consensus_5277#0 GCTGGAGTTGTCATACCATGGACATTTGTTTACGATCATGTTCTAACCACTCTGTATTAT TTGAATGATCAAAATTCAATTGGAGATATAAACAATCAAGATATCTCTTGGCTTCCATCT TTAATTGGATTCGGTTTGCTATTTGGTCAGTTGTTTTATGGTCTGATAACTTCTCAGTTT GGTGACATCGGTACCTGTTTTAAAAATAACAATCAAGATTCCAAAGTTGAAAATGGTAGC ACTTGTTGTCAACGAAATTGCTTTCAATCCATCAATAAAAAATGTCCATCGTCAAAGTAT CAATTTCATTTAGCAATCTTCCTGATAACACTTCTTTTAAATAGCGCATGTACACTAACT TTAGCTTTAGTCCCATTATGGTCTGTTCAAAGTGAATCAAAGCACTTCGAATTATTCTCG CATCAAGAAGGAAAATTATTAGCGTTGGCTTGCTTCTTTGTCGGCATATCGAATGGTGGA TTGTACGTCGTGTTTCCGCAGTTAATCATTGATATTGTTGGTACTGAATTATGGTCTTCT GGACTTGGCTTATTTTTAACTTTTAACGGTCTTATGAATTTGTGTGGAACTAATATTGGA GGCAAAATATATGACACTAGAGGTTCATATCAAATGGCACTTTTAATCGCCGCATTTCTG TCGCTATTTGCTTTTCTTTTGGTCGTCATGAAGGAGATATTCACGTGGTTAATGAAGAGA TCTACGTTATCTGCCAATTCTGATTAAATGCAAAGACAAATTTAAATATGATTTTATTTA TACTAAGGATTTAAGTGACATTCTAGAAGTCTCTTTTTTTTTACTGCATATTGTATTGTT CACTAGTAAACTATTTAAAGATGGCCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)