Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5290 cluster # 5290       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5290#0 length = 622 sequences # 3  

consensusID : consensus_5290#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 622
fasta sequence
                              [TCCCTATAATTAAATTCCCATTCNTGCCATGCATTTTTTAATTCATTACTTAAACTATCAAAACGTTCATCCCAATTTACTGTACAACCTAATTCTACTGCA-ATATCATATAAAGCACGTTCAGCAAAATAAGCTAATGGTCTATTATTCATAGCATG-TTC-TTGTAT-TTGTCTAATCAATGCTGAATATGATCTTGAACAACGATCAGCATCTAAAGCACGAAAATCACCTTGACTATGATGTGATTGATGTGGATGATAATTATGTAATGAACGATGTGAATGTGTTTTTGCTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATATATCTGATGATGAAATTCTACTTTGATTATCTTCTAAATTTATATTACTTACACTACTACTTAAATTACAATTATAAGTAGAATTATTTATATCAATTTGATTTTTATTCTGTTCATCTAATGCTGATCTTATTAATTTACAAGCATTTAATGATTTAACTAAATCTAATAAATTTTTGAACGGAATTTTTAAATACATTAAATTCATTCCACATAAAATAGTCAATATCGGAAGTGTCCAAATTGAATTCAACTTTCCATTCACATATATCACTTATTCAACACATCATATTATCCATC]

[-] EMBL CD077649             [TCCCTATAATTAAATTCCCATTCNTGCCATGCATTTTTTAATTCATTACTTAAACTATCAAAACGTTCATCCCAATTTACTGTACAACCTAATTCTACTGCA ATATCATATAAAGCACGTTCAGCAAAATAAGCTAATGGTCTATTATTCATAGCATG TTC TTGTAT TTGTCTAATCAATGCTGAATATGATCTTGAACAACGATCAGCATCTAAAGCACGAAAATCACCTTGACTATGATGTGATTGATGTGGATGATAATTATGTAATGAACGATGTGAATGTGTTTTTGCTGCTGCTGCTGCTGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL AI559032             [     ATAATT AATTCCCATTCTTGCCATGCATTTTTTAATTCATTACTTAAACTATCTAAACGTTCATCCCAATTTACTGTACAACCTAATTCTACTGCACATATCATATAAAGCACGTTCAGCAAAATAAGCTAATGGTCTATTATTCATAGCATGTTTCTTTGTATATTGTCTAATCAATGCTGGATATGATCTCGGACAACGATCAGCATCTAAAGCACTGAAATCACCTTGACTATGATGTGATTGATGTGGATGATAATTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD195421             [                                                                                                                                                                                                                              ACGAAAATCACCTTGACTAT ATGTGATTGATGTGGATGATAATTATGTAATGAACGATGTGAATGTGTTTTTGCTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATATATCTGATGATGAAATTCTACTTTGATTATCTTCTAAATTTATATTACTTACACTACTACTTAAATTACAATTATAAGTAGAATTATTTATATCAATTTGATTTTTATTCTGTTCATCTAATGCTGATCTTATTAATTTACAAGCATTTAATGATTTAACTAAATCTAATAAATTTTTGAACGGAATTTTTAAATACATTAAATTCATTCCACATAAAATAGTCAATATCGGAAGTGTCCAAATTGAATTCAACTTTCCATTCACATATATCACTTATTCAACACATCATATTATCCATC]


>consensus_5290#0 TCCCTATAATTAAATTCCCATTCNTGCCATGCATTTTTTAATTCATTACTTAAACTATCA AAACGTTCATCCCAATTTACTGTACAACCTAATTCTACTGCAATATCATATAAAGCACGT TCAGCAAAATAAGCTAATGGTCTATTATTCATAGCATGTTCTTGTATTTGTCTAATCAAT GCTGAATATGATCTTGAACAACGATCAGCATCTAAAGCACGAAAATCACCTTGACTATGA TGTGATTGATGTGGATGATAATTATGTAATGAACGATGTGAATGTGTTTTTGCTGCTGCT GCTGCTGATGATGATGATGATATATCTGATGATGAAATTCTACTTTGATTATCTTCTAAA TTTATATTACTTACACTACTACTTAAATTACAATTATAAGTAGAATTATTTATATCAATT TGATTTTTATTCTGTTCATCTAATGCTGATCTTATTAATTTACAAGCATTTAATGATTTA ACTAAATCTAATAAATTTTTGAACGGAATTTTTAAATACATTAAATTCATTCCACATAAA ATAGTCAATATCGGAAGTGTCCAAATTGAATTCAACTTTCCATTCACATATATCACTTAT TCAACACATCATATTATCCATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)