These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5291#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 568 fasta sequence [TTTCGGGCGACTTAAGTGCATTGGCCTTGTTCTGGTAAT-CAAGAATGTAAAGGATACTTCATTTATCCACA-GGGAAGAAATGCTCATCAGCTAGGATGTAATTATGCATTAAAACATCGAATAAGAA-GATGGACAGTTGGACTTAAAAAAAAATGTGGATTCATTCGAGAAAGGAATTATTTTATGAATGATGATGAAATAGG-TTGTGTTAAACTATCACGTAT-GGGTGTTATAACATACTGTAGGAAATTAGATTGAAGTCCATTTTGTTTTTAACGTACCACCGAACACAATATTAATTAGTTTAGTTGTTTTTTTACAGTTTTCAAGCTGTCACCTAAAAAAAATAGTCTTTAATAAAATGATAAATTAAAGACTTTTCAATAATCTCTTTCTTATGGATAAAAAATTGATCAGTATATGACCAAAGAGTGAGATCAAAAATATTGATTATCCAGTGGATATATATATCTATATACATATATATTACAAAACGATGTTACTCTGTACATTTAGACTAATGGTAAGTCACATTAAGGTGTTTGAAATCTACTATTCATTACTAAGT] [+] EMBL AW063004 [TTTCGGGCGACTTAAGTGCATTGGCCTTGTTCTGGTAAT CCAGAATGTAAAGGATACTTCATTTATCCACAGGGGAAGAAATGCTCATCAGCTAGGATGTAATTATGCATTAAAACATCGAATAAGAAGGATGGACAGTTGGACTT AAAAAAAATGTGGATTCATTCGAGAAAGGAATTATTTTATGAATGATGATGAAATAGGTTTGTGTTAAACTATCACGTATGGGGTGTTATAACATACTGTAGGAAATTAGATTGAAGTCCATTTTGTTTTTAACGTACCACCGAACACAATATTAATTAGTTTAGTTGTTTTTTTACAGTTTTCAAGCTGTCACCTAAAAAAAATAGTCTTTAATAAAATGATAAATTAAAGACTTTTCAATAATCTCTTTCTTATGGATAAAAAATTGATCAGTATATGACCAAAGAGTGAGATCAAAAATATTGATTATCCAGTGGATATATATATCTATATACATATATATTACAAAACGATGTTACTCTGTACATTTAGACTAATGGTAAGTCACATTAAGGTGTTTGAAATCTACTATTCATTACTAAGT] [+] EMBL AI820453 [ TGTTCTGGTAATGCAAGAATGTAAAGGATACTTCATTTATCCACA GGGAAGAAATGCTCATCAGCTAGGATGTAATTATGCATTAAAACATCGAATAAGAA GATGGACAGTTGGACTTAAAAAAAAATGTGGATTCATTCGAGAAAGGAATTATTTTATGAATGATGATGAAATAGG TTGTGTTAAACTATCACGTAT GGGTGTTATAACATACTGTAGGAAATTAGATTGAAGTCCATTTTGTTTTTAACGTACCACCGAACACAATATTAATTAGTTTAGTTGTTTTTTTTCAGTTTTCAAGCTGTCACCTAAAAAAAATAGTCTTTAATAAAATGATAAATTAAAG ] [+] EMBL AI882640 [ TGTTCTGGTAAT NNAGAATGTAAAGGATACTTCATTTATCCACA GGGAAGAAATGCTCATCAGCTAGGATGTAATTATGCATTAAAACATCGAATAAGAA GATGGACAGTTGGACTTAAAAAAAAATGTGGATTCATTCGAGAAAGGAATTATTTTATGAATGATGATGAAATAGG TTGTGTTAAACTATCACGTAT GGGTGTTATAACATACTGTAGGAAATTAGATTGAAGTCCATTTTGTTTTTAACGTACCACCGACCACAATATTAATTAGTTTAGTTGTTTTTTT CAG TTTCCAGCTGTCA CT AAAAAAATAGTCTTTAAT AAATGAT AATTAAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||