These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5325#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 1033 fasta sequence [AAATACCTTAAATTATGAACTTCAAATTAAGAATTGGTGGATTCAAGAAATATGCGGCATACCAGTCGTTTCAATCTAAATCAATATTTAAATAAAAAAATGACATGTCGTGATAATGTAATGCAGTTCATGACTCACCGTATTGTCTAGTTGCATTTAGATCCGGTTCAGATTTTCGATAACAGTTATATTTAAATGAATCATCCGTAAACGGTACACATAAATTATGCAACTGACGTGAAATTACATTTGAATTTAATTTCTGACT--TAAACAGTAATGGTTTATTCTTGTCCGATGGAGAGTTAGTTTCGATTGGCAAAGGTGGCAAAAGACCAGCCCAACATGATTGTGCACATATCATATCCCAGCTTACATGATGTCCATAATCACCGTTCATTAATTTAGTTACTTGTTCAGCTGACAATTGTCTCCTATCAGTGCATTCTTCCAGACACCGATTAAATGACTTTTCCATATGAAATAGACGAGGTGCAAACCAAGTCACTTCTTCATTAATAATTGATTCCATTTGTTCCGGAGTTAATGCATCAGACTTTCTACAGCTAGGTCCTCTTATGGTAGCCATTGTGTTAAAAAAACGACTTAAGACTAAGAACATCTCTTTTGGTTACTTCGGATACCAAAGCTCCCAGGAGAGATTTTAATTTCCCCGACGTGGTTATTTCTGTATCAAGACCAGTTAAAACAGATGCACGAAAAGCCCGATGAATAAGCTGACGAATTTTTAGAGGTAGACCTTGACGTCCTGGTAATAAACCATCTGATAAGGCGAATGCTAAAGCACGACTATGATCGACCAATACTCGATAGGCGGTATCTCGATGCCACATATCAATAAGATCGTTATCCATGTTAAAATTTTTCCAAGACTGATCTAGGGCGAGATGTGATTTTGAGCAGACAGCAGAAGATGAAGATTTTCCAGATATTTTGTTCCACAGAGAAGATAGAGTAATTTCTGAGTGATCTTTGTCTGTTTTAATTTCACCATCTTGTAGAGGATTGGATAAA] [+] EMBL CD155823 [AAATACCTTAAATTATGAACTTCAAATTAAGAATTGGTGGATTCAAGAAATATGCGGCATACCAGTCGTTTCAATCTAAATCAATATTTAAATAAAAAAATGACATGTCGTGATAATGTAATGCAGTTCATGACTCACCGTATTGTCTAGTTGCATTTAGATCCGGTTCAGATTTTCGATAACAGTTATATTTAAATGAATCATCCGTAAACGGTACACATAAATTATGCAACTGACGTGAAATTACATTTGAATTTAATTTCTGACTTCTAAACAGTAATGGTTTATTCTTGTCCGATGGAGAGTTAGTTTCGATTGGCAAAGGTGGCAAAAGACCAGCCCAACATGATTGTGCACATATCATATCCCAGCTTACATGATGTCCATAATCACCGTTCATTAATTTAGTTACTTGTTCAGC ] [+] EMBL CD061772 [ ctggacgTTCTGACT TAAACAGTAATGGTTTATTCTTGTCCGATGGAGAGTTAGTTTCGATTGGCAAAGGTGGCAAAAGACCAGCCCAACATGATTGTGCACATATCATATCCCAGCTTACATGATGTCCATAATCACCGTTCATTAATTTAGTTACTTGTTCAGCTGACAATTGTCTCCTATCAGTGCATTCTTCCAGACACCGATTAAATGACTTTTCCATATGAAATAGACGAGGTGCAAACCAAGTCACTTCTTCATTAATAATTGATTCCATTTGTTCCGGAGTTAATGCATCAGACTTTCTACAGCTAGGTCCTCTTATGGTAGCCATTGTGTTAAAAAAACGACTTAAGACTAAGAACATCTCTTTTGGTTACTTCGGATACCAAAGCTCCCAGGAGAGATTTTAATTTCCCCGACGTGGTTATTTCTGTATCAAGACCAGTTAAAACAGATGCACGAAAAGCCCGATGAATAAGCTGACGAATTTTTAGAGGTAGACCTTGACGTCCTGGTAATAAACCATCTGATAAGGCG ] [+] EMBL CD112205 [ TGTT AAAAAACGACTTAAGACTAAGAACATCTCTTTTGGTTACTTCGGATACCAAAGCTCCCAGGAGAGATTTTAATTTCCCCGACGTGGTTATTTCTGTATCAAGACCAGTTAAAACAGATGCACGAAAAGCCCGATGAATAAGCTGACGAATTTTTAGAGGTAGACCTTGACGTCCTGGTAATAAACCATCTGATAAGGCGAATGCTAAAGCACGACTATGATCGACCAATACTCGATAGGCGGTATCTCGATGCCACATATCAATAAGATCGTTATCCATGTTAAAATTTTTCCAAGACTGATCTAGGGCGAGATGTGATTTTGAGCAGACAGCAGAAGATGAAGATTTTCCAGATATTTTGTTCCACAGAGAAGATAGAGTAATTTCTGAGTGATCTTTGTCTGTTTTAATTTCACCATCTTGTAGAGGATTGGATAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||