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Schistosoma mansoni
cluster # 5327 cluster # 5327       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5327#0 length = 993 sequences # 3  

consensusID : consensus_5327#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 993
fasta sequence
                              [ACTATAATTTTTAATGAGACTAGAAAAATACAAATCTTAGGGGGACTGAAATAAACTCTGCATAGGTTGTTGGTGTTGTTGTTGTTATTGTTATGGGTAGTTATCACAATATTCTACTGCTTCTGCAGACTAACTGGAATCAATTTTTTGTAAAAAAAAAATGCAATATACACAAAATTACATAATGGACCCTTTTATTCTGATTAAAATATACGATCATTAATATTAGATGAATCTTGATCTGGTGGAAGACCACGATAACGTTGATATGATTGATTAATAATTGGTTGATTTGGCACTGGTCCTGGAACCATAACATTTAGACCTCGCCTAGTTGGGAAATTAGCATTAGCAATATGACGATAATTATTTGCTAATCCACGTCTAGCTCTATTAGCTTGTCCTAAATATTCTAAAAATGAAGCACCATTCTTTGAAAGGCAACTTAAATCACCAGGAGGTGGATCTTCATGAAAAAAAACATGTGATAAAGCTTGATCAGCATTAAGACGTTTATTTGGATCTAATACTAATAATTTATCAATTAAATCAACAGCTGATGGACATGAAATTTGTGGTGTTAATTTTTCTTTAACATGACGTTTAACATCTTTAGGTAATTTTATTTTTTTGATAAGTTTCTAAATTTTGAACAGTTGGCCAAACCTCCGGTGTAATAGAACCACATAGTTGAATAATTAAATTAAGTTGAAGAAGTTCATTTTCACCTTGCATAATTGGGTAGTTTGTCCANAGCTCAGCCATAATGCATCCAGCACCCCATATATCTACCGGTCTTCCATAATAACGATCATTGAGCAAGATTTCTGGAGGTCGATACCATAAAGTTACTACGCGACCAGTATAACGAGAAGCACGGTCAGGTCGAATAGAACTGGCAGTAAGCCTTGCCAAACCAAAATCTGCTATTTTTAAAACACCTTCACGATCAATTAGTATGTTAGATGTTTTTAAGTCACGATGAAGAACATT]

[-] EMBL CD083533             [ACTATAATTTTTAATGAGACTAGAAAAATACAAATCTTAGGGGGACTGAAATAAACTCTGCATAGGTTGTTGGTGTTGTTGTTGTTATTGTTATGGGTAGTTATCACAATATTCTACTGCTTCTGCAGACTAACTGGAATCAATTTTTTGTAAAAAAAAAATGCAATATACACAAAATTACATAATGGACCCTTTTATTCTGATTAAAATATACGATCATTAATATTAGATGAATCTTGATCTGGTGGAAGACCACGATAACGTTGATATGATTGATTAATAATTGGTTGATTTGGCACTGGTCCTGGAACCATAACATTTAGACCTCGCCTAGTTGGGAAATTAGCATTAGCAATATGACGATAATTATTTGCTAATCCACGTCTAGCTCTATTAGCTTGTCCTAAATATTCTAAAAATGAAGCACCATTCTTTGAAAGGCAACTTAAATCACCAGGAGGTGGATCTTCATGAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD201367             [                                                                                                                                                                                                                    ACGATCATTAATATTAGATGAATCTTGATCTGGTGGAAGACCACGATAACGTTGATATGATTGATTAATAATTGGTTGATTTGGCACTGGTCCTGGAACCATAACATTTAGACCTCGCCTAGTTGGGAAATTAGCATTAGCAATATGACGATAATTATTTGCTAATCCACGTCTAGCTCTATTAGCTTGTCCTAAATATTCTAAAAATGAAGCACCATTCTTTGAAAGGCAACTTAAATCACCAGGAGGTGGATCTTCATGAAAAAAATCATGTGATAAAGCTTGATCAGCATTAAGACGTTTATTTGGATCTAATACTAATAATTTATCAATTAAATCAACAGCTGATGGACATGAAATTTGTGGTGTTAATTTTTCTTTAACATGACGTTTAACATCTTTAGGTAATTTTATTTTTTTGATAAGTTTCTAAATTTTGAACAGTTGGCCAAACCTCCGGTGTAATAGAACCACATAGTTGAATAATTAAATTAAGTTGAAGAAGTTCATTTTCACCTTGCATAATTGGGTAGTTTGTCCANAGCTCAGCCATAATGCATCCA                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD134213             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTTGAATAATTAAATTAAGTTGAAGAAGTTCATTTTCACCTTGCATAATTGGGTAGTTTGTCCAAAGCTCAGCCATAATGCATCCAGCACCCCATATATCTACCGGTCTTCCATAATAACGATCATTGAGCAAGATTTCTGGAGGTCGATACCATAAAGTTACTACGCGACCAGTATAACGAGAAGCACGGTCAGGTCGAATAGAACTGGCAGTAAGCCTTGCCAAACCAAAATCTGCTATTTTTAAAACACCTTCACGATCAATTAGTATGTTAGATGTTTTTAAGTCACGATGAAGAACATT]


>consensus_5327#0 ACTATAATTTTTAATGAGACTAGAAAAATACAAATCTTAGGGGGACTGAAATAAACTCTG CATAGGTTGTTGGTGTTGTTGTTGTTATTGTTATGGGTAGTTATCACAATATTCTACTGC TTCTGCAGACTAACTGGAATCAATTTTTTGTAAAAAAAAAATGCAATATACACAAAATTA CATAATGGACCCTTTTATTCTGATTAAAATATACGATCATTAATATTAGATGAATCTTGA TCTGGTGGAAGACCACGATAACGTTGATATGATTGATTAATAATTGGTTGATTTGGCACT GGTCCTGGAACCATAACATTTAGACCTCGCCTAGTTGGGAAATTAGCATTAGCAATATGA CGATAATTATTTGCTAATCCACGTCTAGCTCTATTAGCTTGTCCTAAATATTCTAAAAAT GAAGCACCATTCTTTGAAAGGCAACTTAAATCACCAGGAGGTGGATCTTCATGAAAAAAA ACATGTGATAAAGCTTGATCAGCATTAAGACGTTTATTTGGATCTAATACTAATAATTTA TCAATTAAATCAACAGCTGATGGACATGAAATTTGTGGTGTTAATTTTTCTTTAACATGA CGTTTAACATCTTTAGGTAATTTTATTTTTTTGATAAGTTTCTAAATTTTGAACAGTTGG CCAAACCTCCGGTGTAATAGAACCACATAGTTGAATAATTAAATTAAGTTGAAGAAGTTC ATTTTCACCTTGCATAATTGGGTAGTTTGTCCANAGCTCAGCCATAATGCATCCAGCACC CCATATATCTACCGGTCTTCCATAATAACGATCATTGAGCAAGATTTCTGGAGGTCGATA CCATAAAGTTACTACGCGACCAGTATAACGAGAAGCACGGTCAGGTCGAATAGAACTGGC AGTAAGCCTTGCCAAACCAAAATCTGCTATTTTTAAAACACCTTCACGATCAATTAGTAT GTTAGATGTTTTTAAGTCACGATGAAGAACATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)