cluster # 5344

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Schistosoma mansoni
cluster # 5344 cluster # 5344 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5344#0 length = 664 sequences # 3

consensusID : consensus_5344#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 664
fasta sequence

                              [GATTGTTTACCA-TCACCAGG-ACATTGTCCAAAACATTTTGGACATTTGCCACCTTTTATTTCCTATAGCAAAATTGACGAGGAATTTTTTAAAAAATTGGATGATTATATACATGAATTTGAAAATTCAAAAATTAAATTTACTGAAGCTGATAGTAGTACTGTTAGTAGTACAACAATAACTAATGATAATCCTATTCATAATTGTAGTGATAACGATGATGAGGGTAAAAATGATGCCGAAACAAAATCTAAACTCTTACAATCTTCTCTATTATCTTCGTTAATGGTTCGATCATGTAATGATGCCTTGGATTCGATATCATTAAACAGACTTGACTTAATACACCAACAACAATGTCAGAATTCAGGGAGTCATAGTAGTTGTAGTAATCATTCACACTTAACAGATTTCTCTTCAACTTCATCGACACAATCTGCAAAACATTATTCAAATTCAGTTGGTGTTGCTGGTGGTATAGGTCCATTTTTGTCCATACTCTTAAATCGTTTGGCTAATATGCACAATAATTGTTTTTTTACTAATCTCCTTCTAACCGATATATTTGCTGCATTGGCCTCTTATCCATGTCCACTGTTATATGAATTCTTATTG-AATCCAATTGGTTTAAGTATAAAACCATCAGTTAATACTCTTTATAAAG]

[+] EMBL CD113344             [GATTGTTAACCACTCACCAGGCACATTGCCCAAAACATTTTGGACATTTGCCACCTTTTATTTGCTATAGCAACATTGACGAGGAATTTTTTAAAAAATAGGATGAATATATACATGAACGTGAAAACCCAAAAATGAAATTTACTGAAGCTGATAGTAGTACTGTTAGTAGTACAACAATAACTAATGATAATCCTATTCATAATTGTAGTGATAACGATGATGAGGGTAAAAATGATGCCGAAACAAAATCTAAACTCTTACAATCTTCTCTATTATCTTCGTTAATGGTTCGATCATGTAATGATGCCTTGGATTCGATATCATTAAACAGACTTGACTTAATACACCAACAACAATGTCAGAATTCAGGGAGTCATAGTAGTTGTAGTAATCATTCACACTTAACAGATTTCTCTTCAACTTCATCGACACAATCTGCAAAACATTATTCAAATTCAGTTGGTGTTGCTGGTGGTATAGGTCCATTTTTGTCCATACTCTTAAATCGTTTGGCTAATATGCACAATAATTGTTTTTTTACTAATCTCCTTCTAACCGATATATTTGCTGCATTGGCCTCTTATCCATGTCCACTGTTATATGAATTCTTATTGAAATCC ATTGGTNTAAGTATAAAACCATCAGTTAATACTCNTTATAAA ]
[-] EMBL CD113308             [ ATTGTTTACCA TCACCAGG ACATTGTCCAAAACATTTTGGACATGTGCCACCTTTTATTTCCTATAGCAAAATTGACGAGGAATTTTTTAAAAAATTGGATGATTATATACATGAATTTGAAAATTCAAAAATTAAATTTACTGAAGCTGATAGTAGTACTGTTAGTAGTACAACAATAACTAATGATAATCCTATTCATAATTGTAGTGATAACGATGATGAGGGTAAAAATGATGCCGAAACAAAATCTAAACTCTTACAATCTTCTCTATTATCTTCGTTAATGGTTCGATCATGTAATGATGCCTTGGATTCGATATCATTAAACAGACTTGACTTAATACACCAACAACAATGTCAGAATTCAGGGAGTCATAGTAGTTGTAGTAATCATTCACACTTAACAGATTTCTCTTCAACTTCATCGACACAATCTGCAAAACATTATTCAAATTCAGTTGGTGTTGCTGGTGGTATAGGTCCATTTTTGTCCATACTCTTAAATCGTTTGGCTAATATGCACAATAATTGTTTTTTTACTAATCTCCTTCTAACCGATATATTTGCTGCATTGGCCTCTTATCCATGTCCACTGTTATATGAATTCTTATTG AATCCAATTGGTTTAAGTATAAAACCATCAGTTAATACTCTTTATAAAG]
[-] EMBL CD113298             [ ATTGTTTACCA TCACCAGG ACATTGTCCAAAACATTTTGGACATTTGCCACCTTTTATTTCCCATAGCAAAATTGACGAGGAATTTTTTAAAAAATTGGATGATTATATACATGAATTTGAAAATTCAAAAATTAAATTTACTGAAGCTGATAGTAGTACTGTTAGTAGTACAACAATAACTAATGATAATCCTATTCATAATTGTAGTGATAACGATGATGAGGGTAAAAATGATGCCGAAACAAAATCTAAACTCTTACAATCTTCTCTATTATCTTCGTTAATGGTTCGATCATGTAATGATGCCTTGGATTCGATATCATTAAACAGACTTGACTTAATACACCAACAACAATGTCAGAATTCAGGGAGTCATAGTAGTTGTAGTAATCATTCACACTTAACAGATTTCTCTTCAACTTCATCGACACAATCTGCAAAACATTATTCAAATTCAGTTGGTGTTGCTGGTGGTATAGGTCCATTTTTGTCCATACTCTTAAATCGTTTGGCTAATATGCACAATAATTGTTTTTTTACTAATCTCCTTCTAACCGATATATTTGCTGCATTGTCCTCTTATCCATGTCCACTGTTATATGAATTCTTATTG AATCCAATTGGTTTAAGTATAAAACCATCAGTTAATACTCTTTATAAAG]




>consensus_5344#0
GATTGTTTACCATCACCAGGACATTGTCCAAAACATTTTGGACATTTGCCACCTTTTATT
TCCTATAGCAAAATTGACGAGGAATTTTTTAAAAAATTGGATGATTATATACATGAATTT
GAAAATTCAAAAATTAAATTTACTGAAGCTGATAGTAGTACTGTTAGTAGTACAACAATA
ACTAATGATAATCCTATTCATAATTGTAGTGATAACGATGATGAGGGTAAAAATGATGCC
GAAACAAAATCTAAACTCTTACAATCTTCTCTATTATCTTCGTTAATGGTTCGATCATGT
AATGATGCCTTGGATTCGATATCATTAAACAGACTTGACTTAATACACCAACAACAATGT
CAGAATTCAGGGAGTCATAGTAGTTGTAGTAATCATTCACACTTAACAGATTTCTCTTCA
ACTTCATCGACACAATCTGCAAAACATTATTCAAATTCAGTTGGTGTTGCTGGTGGTATA
GGTCCATTTTTGTCCATACTCTTAAATCGTTTGGCTAATATGCACAATAATTGTTTTTTT
ACTAATCTCCTTCTAACCGATATATTTGCTGCATTGGCCTCTTATCCATGTCCACTGTTA
TATGAATTCTTATTGAATCCAATTGGTTTAAGTATAAAACCATCAGTTAATACTCTTTAT
AAAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case