cluster # 5354

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Schistosoma mansoni
cluster # 5354 cluster # 5354 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5354#0 length = 420 sequences # 3

consensusID : consensus_5354#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 420
fasta sequence

                              [TGTCCACTCACTAAATTTTCTGTTCTGTTATGCCAAAATGTGTCCTTGACGTCGAAAAGAACGGATGGATCACGGACTACAGATACTAATTTAACAACTCTATTTCTCTGGAATATTTTTGATACATTAAGTTTGTCATCGTTTGGAAATTTGTTACGACATCTGCTGGTTTCGTCGCCATTTTAAATTCTTATCATTTAAAGAGCACTTGAACGATGAGCAACATTCCAGTCTAAGGTGGTTAAAAGTTGATAATTAAAACTTCTAGATAATGATTTGTCATCATGGTTTGTTTGAGAATAAAATTTTTCAATGCTAATTTATGCATACACATTTCATCGGTGCAAATTATACGAGTTTTTATTCCAGTACATAAAAACACTTTTGTGGTAATGAGTTTCCGGCTCTAAATATCTAAAT]

[+] EMBL CD089497             [TGTCCACTCACTAAATTTTCTGTTCTGTTATGCCAAAATGTGTCCTTGACGTCGAAAAGAACGGATGGATCACGGACTACAGATACTAATTTAACAACTCTATTTCTCTGGAATATTTTTGATACATTAAGTTTGTCATCGTTTGGAAATTTGTTACGACATCTGCTGGTTTCGTCGCCATTTTAAATTCTTATCATTTAAAGAGCACTTGAACGATGAGCAACATTCCAGTCTAAGGTGGTTAAAAGTCGATAATTAAAACTTCTAGATAATGATTTGTCATCATGGTTTGTTTGAGAATAAAATTTTTC                                                                                                             ]
[+] EMBL CD089565             [ GTCCACTCACTAAATTTTCTGTTCTGTTATGCCAAAATGTGTCCTTGACGTCGAAAAAAACGGATGGATCACGGACTACAGATACTAATTTAACAACTCTATTTCTCTGGAATATTTTTGATACATTAAGTTTGTCATCGTTTGGAAATTTGTTACGACATCTGCTGGTTTCGTCGCCATTTTAAATTCTTATCATTTAAAGAGCACTTGAACGATGAGCAACATTCCAGTCTAAGGTGGTTAAAAGTTGATAATTAAAACTTCTACATAATGATTTGTCATCATGGTTTGTTTGAGAATAAAATT                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD089616             [                TTTCTGTTCTGTTATGCCAAAATGTGTCCTTGACGTCGAAAAGAACGGATGGATCACGGACTACAGATACTAATTTAACAACTCTATTTCTCTGGAATATTTTTGATACATTAAGTTTGTCATCGTTTGGAAATTTGTTACGACATCTGCTGGTTTCGTCGCCATTTTAAATTCTTATCATTTAAAGAGCACTTGAACGATGAGCAACATTCCAGTCTAAGGTGGTTAAAAGTTGATAATTAAAACTTCTAGATAATGATTTGTCATCATGGTTTGTTTGAGAATAAAATTTTTCAATGCTAATTTATGCATACACATTTCATCGGTGCAAATTATACGAGTTTTTATTCCAGTACATAAAAACACTTTTGTGGTAATGAGTTTCCGGCTCTAAATATCTAAAT]




>consensus_5354#0
TGTCCACTCACTAAATTTTCTGTTCTGTTATGCCAAAATGTGTCCTTGACGTCGAAAAGA
ACGGATGGATCACGGACTACAGATACTAATTTAACAACTCTATTTCTCTGGAATATTTTT
GATACATTAAGTTTGTCATCGTTTGGAAATTTGTTACGACATCTGCTGGTTTCGTCGCCA
TTTTAAATTCTTATCATTTAAAGAGCACTTGAACGATGAGCAACATTCCAGTCTAAGGTG
GTTAAAAGTTGATAATTAAAACTTCTAGATAATGATTTGTCATCATGGTTTGTTTGAGAA
TAAAATTTTTCAATGCTAATTTATGCATACACATTTCATCGGTGCAAATTATACGAGTTT
TTATTCCAGTACATAAAAACACTTTTGTGGTAATGAGTTTCCGGCTCTAAATATCTAAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case