cluster # 5398

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Schistosoma mansoni
cluster # 5398 cluster # 5398 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5398#0 length = 590 sequences # 3

consensusID : consensus_5398#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 590
fasta sequence

                              [AATATCGGTCAAGTTGATATCCCTTTAAATCAAGTTCCACAAACTGGCAATCCAAATTTCGACCTATCACGGTTATGTTATTCCGATTTGAAATCAAAACGAAAAAATTCTAATGCACATGGACGTTTAGTTTATTGGATTTGGGCTATTGACTATTGGCCTCCAGGAACTCAAGCTAATACTACACACCATTCTAAATCATTACGTGGTTCACTTACACATCTTGGTTCGAAAATACGTTCCAAATCTAAGCATAGATCTAAAAATGATAATGATTACACTAATGGTTATCAACAAAGTGGAATTAATGGTTCATCTTCTACTTTACAAGTACCCGGTATGTCATATAATCCATTTGAAAATGATGGTACTGTAAGTGAATTCAGTGGACCAATGGGTTTACCACCAATGTATCAATCACATTCAAATAGTCCATATGCTCAATCAGAATTTGGTGGATCACTTGCAGGCAGTGTANAATCAACTAAACAAAAAAATATGTTGAAAAAATTTAAATCGAAACTTTCACACAGTACACTTAATTTGGCTGAAGCGGCAGCTAAAAAAGCAGCTGGGAAAGATCCTTATTT]

[+] EMBL CD156790             [AATATCGGTCAAGTTGATATCCCTTTAAATCAAGTTCCACAAACTGGCAATCCAAATTTCGACCTATCACGGTTATGTTATTCCGATTTGAAATCAAAACGAAAAAATTCTAATGCACATGGACGTTTAGTTTATTGGATTTGGGCTATTGACTATTGGCCTCCAGGAACTCAAGCTAATACTACACACCATTCTAAATCATTACGTGGTTCACTTACACATCTTGGTTCGAAAATACGTTCCAAATCTAAGCATAGATCTAAAAATGATAATGATTACACTAATGGTTATCAACAAAGTGGAATTAATGGTTCATCTTCTACTTTACAAGTACCCGGTATGTCATATAATCCATTTGAAAATGATGGTACTGTAAGTGAATTCAGTGGACCAATGGGTTTACCACCAATGTATCAATCACATTCAAATAGTCCATATGCTCAATCAGAATTTGGTGGATCACTTGCAGGCAGTGTANAATCAACTAAACAAAAAAATATGTTGAAAAAATTTAAATCGAAACTTTCACACAGTACACTTAATTTGGCTGAAGCGGCAGCTAAAAAAGCAGCTGGGAAAGATCCTTATTT]
[+] EMBL CD156697             [AATATCGGTCAAGTTGATATCCCTTTAAATCAAGTTCCACAAACTGGCAATCCAAATTTCGACCTATCACGGTTATGTTATTCCGATTTGAAATCAAAACGAAAAAATTCTAATGCACATGGACGTTTAGTTTATTGGATTTGGGCTATTGACTATTGGCCTCCAGGAACTCAAGCTAATACTACACACCATTCTAAATCATTACGTGGTTCACTTACACATCTTGGTTCGAAAATACGTTCCAAATCTAAGCATAGATCTAAAAATGATAATGATTACACTAATGGTTATCAACAAAGTGGAATTAATGGTTCATCTTCTACTTTACAAGTACCCGGTATGTCATATAATCCATTTGAAAATGATGGTACTGTAAGTGAATTCAGTGGACCAATGGGTTTACCACCAATGTATCAATCACATTCAAATAGTCCATATGCTCAATCAGAATTTGGTGGATCACTTGCAGGCAGTGTA AATCAACTAAACAAAAAA                                                                                              ]
[+] EMBL CD193360             [                                                                                                                                                                                    ACTACACACCATTCTAAATCATTACGTGGTTCACTTACACATCTTGGTTCGAAAATACGTTCCAAATCTAAGCATAGATCTAAAAATGATAATGATTACACTAATGGTTATCAACAAAGTGGAATTAATGGTTCATCTTCTACTTTACAAGTACCCGGTATGTCATATAATCCATTTGAAAATGATGGTACTGT                                                                                                                                                                                                                        ]




>consensus_5398#0
AATATCGGTCAAGTTGATATCCCTTTAAATCAAGTTCCACAAACTGGCAATCCAAATTTC
GACCTATCACGGTTATGTTATTCCGATTTGAAATCAAAACGAAAAAATTCTAATGCACAT
GGACGTTTAGTTTATTGGATTTGGGCTATTGACTATTGGCCTCCAGGAACTCAAGCTAAT
ACTACACACCATTCTAAATCATTACGTGGTTCACTTACACATCTTGGTTCGAAAATACGT
TCCAAATCTAAGCATAGATCTAAAAATGATAATGATTACACTAATGGTTATCAACAAAGT
GGAATTAATGGTTCATCTTCTACTTTACAAGTACCCGGTATGTCATATAATCCATTTGAA
AATGATGGTACTGTAAGTGAATTCAGTGGACCAATGGGTTTACCACCAATGTATCAATCA
CATTCAAATAGTCCATATGCTCAATCAGAATTTGGTGGATCACTTGCAGGCAGTGTANAA
TCAACTAAACAAAAAAATATGTTGAAAAAATTTAAATCGAAACTTTCACACAGTACACTT
AATTTGGCTGAAGCGGCAGCTAAAAAAGCAGCTGGGAAAGATCCTTATTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case