cluster # 5433

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Schistosoma mansoni
cluster # 5433 cluster # 5433 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5433#0 length = 854 sequences # 3

consensusID : consensus_5433#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 854
fasta sequence

                              [GTAACTGGATACTAATCTAATATGAACTACTGTAAAAATGAAATATAATACTATAGAAAAATAATAAGAGGTTAAGTGAACAGTAAAATACATGGGTGAATACCGGGTATGCTACAAAAAATAACTAGTTTAATAGATCAAATGAATTACACATACGTAAAAAAAGACATCCCGGTTGAATGTTAGCTATCTGCAACACATAATGAGCTGGAATAAACAAATGCAAAAGTTGACAAAAGAAAGA-CAGTATTGCTGACATGATAATGGTCAAAAGTAAACTGGAAGAGAGTGATCACAAAACTACAGAAATTATATCATCAGAAACTATGTTTAAAGTAATCAGATAATCAACAAGAAACACTGAACTGACACTTTTAATTTTTGGTATCACCAACTTTGAAAATCACTCCCGTGATAACTTGGAAGTCCAAGAAGAGAATGTTATCGGTACAGTATTACAAACTATATTAATTTGTACTTGGAGTGAAGGATATATTCACCACATGTAAGACCTGAGAGATGGAGACTAGAAACACTTCGTAAAAAAATAAGCAACTAAGACTAATTTCCTACCTACAACAAAATTCTACTAAATGATGAGTGTAGGCACTTTTCCTACGAAAAGTTAATGAGCTTACACTTCGAGGCGTGTCCAGAGAACTAGACCTATCACATGCACTAAAACAAAGCTAGGAAATTAAGTTATAGCTGTATAATTGTTCAAGATTTTGCANACGATTTCCATGCAGATATCATGAATTGCTTAAGCACTTGATACTGGACGGGACTAACTGCAGGTTGAGTTTCTTGAACGTTTGAAGACGGGAGCATAGGAGCACTGTTGGAAAACGGCT]

[+] EMBL CD137852             [GTAACTGGATACTAATCTAATATGAACTACTGTAAAAATGAAATATAATACTATAGAAAAATAATAAGAGGTTAAGTGAACAGTAAAATACATGGGTGAATACCGGGTATGCTACAAAAAATAACTAGTTTAATAGATCAAATGAATTACACATACGTAAAAAAAGACATCCCGGTTGAATGTTAGCTATCTGCAACACATAATGAGCTGGAATAAACAAATGCAAAAGTTGACAAAAGAAAGA CAGTATTGCTGACATGATAATGGTCAAAAGTAAACTGGAAGAGAGTGATCACAAAACTACAGAAATTATATCATCAGAAACTATGTTTAAAGTAATCAGATAATCAACAAGAAACACTGAACTGACACTTTTAATTTTTGGTATCACCAACTTTGAAAATCACTCCCGTGATAACTTGGAAGTCCAAGAAGAGAATGTTATCGGTACAGTATTACAAACTATATTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL SMAA18516            [                                                                                                                                                                                          tctTCTGCAACACATAATGGGCTGGAATAAACAAATGCAAAAGTTGNCAAAAGAAAGACCAGTATTGCTGACATGATAATGGTCAAAAGTAAACTGGAAGAGAGTGATCACAAAACTCCAGAAATTATATCATCAGAAACTATGTTTAAAGTAATAAGATAATCAACAAGAAACACTGANATGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD154704             [                                                                                                                                                                                                                                                                             CAAAAGTAAACTGGAAGAGAGTGATCACAAAACTACAGAAATTATATCATCAGAAACTATGTTTAAAGTAATCAGATAATCAACAAGAAACACTGAACTGACACTTTTAATTTTTGGTATCACCAACTTTGAAAATCACTCCCGTGATAACTTGGAAGTCCAAGAAGAGAATGTTATCGGTACAGTATTACAAACTATATTAATTTGTACTTGGAGTGAAGGATATATTCACCACATGTAAGACCTGAGAGATGGAGACTAGAAACACTTCGTAAAAAAATAAGCAACTAAGACTAATTTCCTACCTACAACAAAATTCTACTAAATGATGAGTGTAGGCACTTTTCCTACGAAAAGTTAATGAGCTTACACTTCGAGGCGTGTCCAGAGAACTAGACCTATCACATGCACTAAAACAAAGCTAGGAAATTAAGTTATAGCTGTATAATTGTTCAAGATTTTGCANACGATTTCCATGCAGATATCATGAATTGCTTAAGCACTTGATACTGGACGGGACTAACTGCAGGTTGAGTTTCTTGAACGTTTGAAGACGGGAGCATAGGAGCACTGTTGGAAAACGGCT]




>consensus_5433#0
GTAACTGGATACTAATCTAATATGAACTACTGTAAAAATGAAATATAATACTATAGAAAA
ATAATAAGAGGTTAAGTGAACAGTAAAATACATGGGTGAATACCGGGTATGCTACAAAAA
ATAACTAGTTTAATAGATCAAATGAATTACACATACGTAAAAAAAGACATCCCGGTTGAA
TGTTAGCTATCTGCAACACATAATGAGCTGGAATAAACAAATGCAAAAGTTGACAAAAGA
AAGACAGTATTGCTGACATGATAATGGTCAAAAGTAAACTGGAAGAGAGTGATCACAAAA
CTACAGAAATTATATCATCAGAAACTATGTTTAAAGTAATCAGATAATCAACAAGAAACA
CTGAACTGACACTTTTAATTTTTGGTATCACCAACTTTGAAAATCACTCCCGTGATAACT
TGGAAGTCCAAGAAGAGAATGTTATCGGTACAGTATTACAAACTATATTAATTTGTACTT
GGAGTGAAGGATATATTCACCACATGTAAGACCTGAGAGATGGAGACTAGAAACACTTCG
TAAAAAAATAAGCAACTAAGACTAATTTCCTACCTACAACAAAATTCTACTAAATGATGA
GTGTAGGCACTTTTCCTACGAAAAGTTAATGAGCTTACACTTCGAGGCGTGTCCAGAGAA
CTAGACCTATCACATGCACTAAAACAAAGCTAGGAAATTAAGTTATAGCTGTATAATTGT
TCAAGATTTTGCANACGATTTCCATGCAGATATCATGAATTGCTTAAGCACTTGATACTG
GACGGGACTAACTGCAGGTTGAGTTTCTTGAACGTTTGAAGACGGGAGCATAGGAGCACT
GTTGGAAAACGGCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case