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Schistosoma mansoni
cluster # 5449 cluster # 5449       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5449#0 length = 620 sequences # 3  

consensusID : consensus_5449#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 620
fasta sequence
                              [CGATAAAATGTTATTGACCTCTAACGAAGGTTGACTAACATGACTATTTAACATTGTTAATTGAGCCACATGTATATTTCCACTGAATGTAGTAATAAAACTATAATAACTATCAATGTATGAACGATCTTTGACCCGAGTCTCTCCTAAGACATTGGCATTTATAGTAGGCGATGAGAAAATATACGGTGGTAATTTAACAGATAACCAGTCAACTTCTAATACTTTAAGACGTGGTGAACAGAACTTGAAATCTTCGTTCTTTAAATAAAATAAAGCGCGACGTGGTATATTCACAATTGCTGCTATCAGTAAACCTTCATTTGCAGAAGATGACTCGTTCAATGACGCTGTTGTGCTATGTGAATGATAGCTAACAAAATTTAATGCAATATGTAAAAGATCAGTATACAAGAAATTTATGTCATTCACATTGGATCGACTAATCGCTGAAGTTAAAATAATTGGATCTGTATAAACTATGGGATGTAGACGAATATCCATTTCACTATGTGTTGGTAATTGATTGTCAGTAGATGCCCAACGTATAGATTTAAATAAATTCTTATCAAGATCTCTTTGAGATAAAGTATTTCGATCTAGAATGATATCTGGAATTT]

[+] EMBL CD178267             [CGATAAAATGTTATTGACCTCTAACGAAGGTTGACTAACATGACTATTTAACATTGTTAATTGAGCCACATGTATATTTCCACTGAATGTAGTAATAAAACTATAATAACTATCAATGTATGAACGATCTTTGACCCGAGTCTCTCCTAAGACATTGGCATTTATAGTAGGCGATGAGAAAATATACGGTGGTAATTTAACAGATAACCAGTCAACTTCTAATACTTTAAGACGTGGTGAACAGAACTTGAAATCTTCGTTCTTTAAATAAAATAAAGCGCGACGTGGTATATTCACAATTGCTGCTATCAGTAAACCTTCATTTGCAGAAGATGACTCGTTCAATGACGCTGTTGTGCTATGTGAATGATAGCTAACAAAATTTAATGCAATATGTAAAAGATCAGTATACAAGAAATTTATGTCATTCACATTGGATCGACTAATCGCTGAAGTTAAAATAATTGGATCTGTATAAACTATGGGATGTAGACGAATATCCATTTCACTATGTGTTGGTAATTGATTGTCAGTAGATGCCCAACGTATAGATTTAAATAAATTCTTATCAAGATCTCTTTGAGATAAAGTATTTCGATCTAGAATGATATCTGGAATTT]
[+] EMBL CD111911             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGAAGCTGACTCGTTCAATGACGCTGTTGTGCTATGTGAATGATAGCTAACAAAATTTAATGCAATATGTAAAAGATCAGTATACAAGAAATTTATGTCATTCACATTGGATCGACTAATCGCTGAAGTTAAAATAATTGGATCTGTATAAACTATGGGATGTAGACGAATATCCATTTCACTATGTGTTGGTAATTGATTGTCAGTAGATGCCCAACGTATAGATTTAAATAAATTCTTATCAAG                                               ]
[+] EMBL CD181494             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGACGCTGTTGTGCTATGTGAATGATAGCTAACAAAATTTAATGCAATATGTAAAAGATCAGTATACAAGAAATTTATGTCATTCACATTGGATCGACTAATCGCTGAAGTTAAAATAATTGGATCTGTATAAACTATGGGATGTAGACGAATATCCATTTCACTATGTGTTGGTAATTGATTGTCAGTAGATGCCCAACGTATAGATTTAAATAAATTCTTATCAAGATCTCTT                                        ]


>consensus_5449#0 CGATAAAATGTTATTGACCTCTAACGAAGGTTGACTAACATGACTATTTAACATTGTTAA TTGAGCCACATGTATATTTCCACTGAATGTAGTAATAAAACTATAATAACTATCAATGTA TGAACGATCTTTGACCCGAGTCTCTCCTAAGACATTGGCATTTATAGTAGGCGATGAGAA AATATACGGTGGTAATTTAACAGATAACCAGTCAACTTCTAATACTTTAAGACGTGGTGA ACAGAACTTGAAATCTTCGTTCTTTAAATAAAATAAAGCGCGACGTGGTATATTCACAAT TGCTGCTATCAGTAAACCTTCATTTGCAGAAGATGACTCGTTCAATGACGCTGTTGTGCT ATGTGAATGATAGCTAACAAAATTTAATGCAATATGTAAAAGATCAGTATACAAGAAATT TATGTCATTCACATTGGATCGACTAATCGCTGAAGTTAAAATAATTGGATCTGTATAAAC TATGGGATGTAGACGAATATCCATTTCACTATGTGTTGGTAATTGATTGTCAGTAGATGC CCAACGTATAGATTTAAATAAATTCTTATCAAGATCTCTTTGAGATAAAGTATTTCGATC TAGAATGATATCTGGAATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)