cluster # 5463

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Schistosoma mansoni
cluster # 5463 cluster # 5463 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5463#0 length = 712 sequences # 3

consensusID : consensus_5463#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 712
fasta sequence

                              [TGTTTGCATTCATTTAGTATTTGTTGGGACAATAATCGTTCTGTAATTGGTAGTATGTAAATATGTATCTATTTAAAAAGGAATACAGTTCTTTCGGTAGTTAATCTTCGAAGTTTCCATCATAGAAATGCAATTGTATGAACAGATACAATACGGAATGCCTGGTAGTTTGAAGATAAGTCTCAGCTAGTTATTTGTTTCTGTGTAAACCTGTAGTTACTCGCATCAAGAGATAGCAGCTGCCTGGTCTTATGTTTTAGATGACTGACTAAGCTGCCCCACGAGTTCCAGTCAATTGACCTTGTGTTTTCAAATTCATATTGTGTTCACTGAAAATGGCAGCCAGAGTCAAACTTGCCTATTTCTTGCTTTCTCTAGACTGCAAGTAATTATGGGTTTCTCAATTATTTTAAAATGTTTATTCATATTGAGTATTTGTATTTGTTTCTCACCCAGGTTCTAACCAATCAAAACAAACTATAGCTTTATCTACCATAGGATCGGTA-TTTCGGTCC-TTTTAATAACAATTGAAAACAGTGAAATCTGATTTGACCTTATTCATTCACCCCTTTAAGTATGTCAACAAAGCGTGGAATTTTTTATTTCTGCAGTAAACAATAGCTAAATTTCTCTCAGACATCTTTCAAACCATAACAAGTCATTAGACTCGTCACAATGAGACAGCTACATAATGATCTTGCCGAACTGTTAC]

[-] EMBL CD189229             [TGTTTGCATTCATTTAGTATTTGTTGGGACAATAATCGTTCTGTAATTGGTAGTATGTAAATATGTATCTATTTAAAAAGGAATACAGTTCTTTCGGTAGTTAATCTTCGAAGTTTCCATCATAGAAATGCAATTGTATGAACAGATACAATACGGAATGCCTGGTAGTTTGAAGATAAGTCTCAGCTAGTTATTTGTTTCTGTGTAAACCTGTAGTTACTCGCATCAAGAGATAGCAGCTGCCTGGTCTTATGTTTTAGATGACTGACTAAGCTGCCCCACGAGTTCCAGTCAATTGACCTTGTGTTTTCAAATTCATATTGTGTTCACTGAAAATGGCAGCCAGAGTCAAACTTGCCTATTTCTTGCTTTCTCTAGACTGCAAGTAATTATGGGTTTCTCAATTATTTTAAAATGTTTATTCATATTGAGTATTTGTATTT                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD111737             [                 cctcctcgGGGACAATAATCGTTCTGTAATTGGTAGTATGTAAATATGTATCTATTTAAAAAGGAATACAGTTCTTTCGGTAGTTAATCTTCGAAGTTTCCATCATAGAAATGCAATTGTATGAGCAGATACAATACGGAATGCCTGGTAGTTTGAAGATAAGTCTCAGCTAGTTATTTGTTTCTGTGTAAACCTGTAGTTACTCGCATCAAGAGATAGCAGCTGCCTGGTCTTATGTTTTAGATGACTGACTAAGCTGCCCCACGAGTTCCAGTCAATTGACCTTGTGTTTTCAAATTCATATTGTGTTCACCGAAAATGGCAGCCAGAGTCAAACTTGCCTATTTCTTGCTTTCTCTAGACTGCAAGTAATTATGGGTTTCTCACTTATTTTAAAATGTTTATTCATATTGAGTATTTGTATTTGTTTCTCACCCAGGTTCTAACCAATCAAAACAAACTATAGCTTTATCTACCATAGGATCGGTA TTTCGGTCC TTTTAATAACA                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD200754             [                                                                                                                                                                                                                                                    TGATCTTATGTTTTAGATGACTGACTAAGCTGCCCCACGAGTTCCAGTCACTTGACCTTGTGTTTTCAAATTCATATTGTGTCCACTGAACATGGCAGCCAGAGTCAAACTTGCCTATTTCTTGCTTTCTCTAGACTGCAAGTAATTATGGTCATAGCTGTTACCTGAAAANGTTTATTCATATTGAGTATTTGTATTTGTTTCTCACCCAGGTTCTAACCAATCAAAACAAACTATAGCTTTATCTACCATAGGATCGGTATTTTCGGTCCTTTTTAATAACAATTGAAAACAGTGAAATCTGATTTGACCTTATTCATTCACCCCTTTAAGTATGTCAACAAAGCGTGGAATTTTTTATTTCTGCAGTAAACAATAGCTAAATTTCTCTCAGACATCTTTCAAACCATAACAAGTCATTAGACTCGTCACAATGAGACAGCTACATAATGATCTTGCCGAACTGTTAC]




>consensus_5463#0
TGTTTGCATTCATTTAGTATTTGTTGGGACAATAATCGTTCTGTAATTGGTAGTATGTAA
ATATGTATCTATTTAAAAAGGAATACAGTTCTTTCGGTAGTTAATCTTCGAAGTTTCCAT
CATAGAAATGCAATTGTATGAACAGATACAATACGGAATGCCTGGTAGTTTGAAGATAAG
TCTCAGCTAGTTATTTGTTTCTGTGTAAACCTGTAGTTACTCGCATCAAGAGATAGCAGC
TGCCTGGTCTTATGTTTTAGATGACTGACTAAGCTGCCCCACGAGTTCCAGTCAATTGAC
CTTGTGTTTTCAAATTCATATTGTGTTCACTGAAAATGGCAGCCAGAGTCAAACTTGCCT
ATTTCTTGCTTTCTCTAGACTGCAAGTAATTATGGGTTTCTCAATTATTTTAAAATGTTT
ATTCATATTGAGTATTTGTATTTGTTTCTCACCCAGGTTCTAACCAATCAAAACAAACTA
TAGCTTTATCTACCATAGGATCGGTATTTCGGTCCTTTTAATAACAATTGAAAACAGTGA
AATCTGATTTGACCTTATTCATTCACCCCTTTAAGTATGTCAACAAAGCGTGGAATTTTT
TATTTCTGCAGTAAACAATAGCTAAATTTCTCTCAGACATCTTTCAAACCATAACAAGTC
ATTAGACTCGTCACAATGAGACAGCTACATAATGATCTTGCCGAACTGTTAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case