cluster # 5467

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Schistosoma mansoni
cluster # 5467 cluster # 5467 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5467#0 length = 563 sequences # 3

consensusID : consensus_5467#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 563
fasta sequence

                              [AACAATATTTAACTTAAAATACTGTACAGTAAAAATTATAGCAGGAATTAAGTTATGG-AAAAAAAAACTATTAATAAGAAAACCGTAAACAACAAATATTTCGTTGGAAAAAGTTTTAAAAATAAATAATCAATAATCATGTCTGATTCTCTGTTAATAAAATTGAAATAGTTCATTACCAAGTTAAACTGTTTACAGATCTTTAAAGATTTCTTTTAAGCAATTTCTTATGTAAATGAATTTTGGACGTTCTGTACGATCAGCTGACCAACATTTAAGCATTAATTGATAAACAGATTCTGGACATTGAAATGGACGTGTTAAACGATCACCTTGTTCCAAAAGCTTAATAATTTCTGTATGACTTAAATCAGTAAATGGTTCAACAGCGTAACTAAAAACTTCCCATAATAAAACTCCAAAAGACCAAACATCAGTATCTATATGAAATTTTCCGTCTAAAATTGATTCAAGAGGTAACCATTTTATCGGCAAACATTCATTGGAAGTAGAGATAAAATCAACACCAGATTGAATTGGTCTACACATTGAAAAATCTGATA]

[+] EMBL CD073576             [AACAATATTTAACTTAAAATACTGTACAGTAAAAATTATAGCAGGAATTAAGTTATGG AAAAAAAAACTATTAATAAAAAAACCGTAAACAACAAATATTTCGTTGGAAAAAGTTTTAAAAATAAATAATCAATAATCATGTCTGATTCTCTGTTAATAAAATTGAAATAGTTCATTACCAAGTTAAACTGTTTACAGATCTTTAAAGATTTCTTTTAAGCAATTTCTTATGTAAATGAATTTTGGACGTTCTGTACGATCAGCTGACCAACATTTAAGCATTAATTGATAAACAGATTCTGGACATTGAAATGGACGTGTTAAACGATCACCTTGTTCCAAAAGCTTAATAATTTCTGTATGACTTAAATCAGTAAATGGTTCAACAGCGTAACTAAAAACTTCCCATAATAAAACTCCAAAAGACCAAACATCAGTATCTATATGAAATTTTCCGTCTAAAATTGATTCAAGAGGTAACCATTTTATCGGCAAACATTCATTGGAAGTAGAGATAAAATCAACACCAGATTGAATTGGTCTACACATTGAAAAATCTGATA]
[+] EMBL CD077147             [AACAATATTTAACTTAAAATACTGTACAGTAAAAATTATAGCAGGAATTAAGTTATGG AAAAAAAAACTATTAATAAGAAAACCGTAAACAACAAATATTTCGTTGGAAAAAGTTTTAAAAATAAATAATCAATAATCATGTCTGATTCTCTGTTAATAAAATTGAAATAGTTCATTACCAAGTTAAACTGTTTACAGATCTTTAAAGATTTCTTTTAAGCAATTTTTTATGTAAATGAATTTTGGACGTTCTGTACGATCAGCTGACCAACATTTAAGCATTAATTGATAAACAGATTCTGGACATTGAGATGGACGTGTTAAACGATCACCTTGTTCCAAAAGCTTAATAATTTCTGTATGACTTAGATCAGTAAATGGTTCAACAGCGTAACTAAAAACTTCCCATAATAAAACTCCAAA                                                                                                                                            ]
[-] EMBL AI447068             [ ACAATATTTAACTTAAAATACTGTACAGTAAAAATTATAGCAGGAATTAAGTTATGGAAAAAAAAAACTATTAATAAGAAAACCGTAAACAACAAATATTTCGTTGGAAAAAGTTTTAAAAATAAATAATCAATAATCATGTCTGATTCTCTGTTAATAAAATTGAAATAGTTCATTACCAAGTTAAACTG TTACAGATCTTTAAAGA TTCTTTTAAGCAATTTCTTATGTAAATGAATTTTGGACGTTCTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]




>consensus_5467#0
AACAATATTTAACTTAAAATACTGTACAGTAAAAATTATAGCAGGAATTAAGTTATGGAA
AAAAAAACTATTAATAAGAAAACCGTAAACAACAAATATTTCGTTGGAAAAAGTTTTAAA
AATAAATAATCAATAATCATGTCTGATTCTCTGTTAATAAAATTGAAATAGTTCATTACC
AAGTTAAACTGTTTACAGATCTTTAAAGATTTCTTTTAAGCAATTTCTTATGTAAATGAA
TTTTGGACGTTCTGTACGATCAGCTGACCAACATTTAAGCATTAATTGATAAACAGATTC
TGGACATTGAAATGGACGTGTTAAACGATCACCTTGTTCCAAAAGCTTAATAATTTCTGT
ATGACTTAAATCAGTAAATGGTTCAACAGCGTAACTAAAAACTTCCCATAATAAAACTCC
AAAAGACCAAACATCAGTATCTATATGAAATTTTCCGTCTAAAATTGATTCAAGAGGTAA
CCATTTTATCGGCAAACATTCATTGGAAGTAGAGATAAAATCAACACCAGATTGAATTGG
TCTACACATTGAAAAATCTGATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case