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Schistosoma mansoni
cluster # 547 cluster # 547       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_547#0 length = 1297 sequences # 2  

consensusID : consensus_547#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1297
fasta sequence
                              [CTCCAGGCCAAAAATTTGGCACGAGGCAACAAAATAGAAATAAGCTTATATTATTCTCCCTAAACTGTTGCTCTTGTATTATTCAAATTAATGAAGCTAGCTATGATCAAGAAATGTATATAAATAATCTGAGTAATTTCAAACATTTGTTAATAATCATCTGCACAAACTGAATAACAGCTGATTGAACAATGATTATTTCAAGTCGTGTACAAACTTGATTAAAGTGGATATCTGCCTTTAAATCTTCTATAATTATACTCTGATGTTAAAAGCTAAATGTATCTTTACAAAAAGTTGCTGTTCTTGGGAATTTTCACGTGATTAACAGTAAGATTAGTTTAGTACTGTTCATCTCAGTATTACCCATCAACATATTATGCGAAGATTTCCTAACACTTGCCAAATACAACCATTTTATAAATGTTTACTGAGGATTTATGAATTTACAATATTGCAACCAATCACTGACTTATTTTAGCCCAAGATCGTGGCTGTTTACGATAATATATCATAGAGTGATGAGTACACTTACATGTTTAACTAAAATTGTCATTTTTCACTTAACTGATGAGATTTCAAGCTTTTCTCAAATTCTATAATGATTTTCTTAACCATATCATGATAATTTATTAATGATTTCGTTCGATTNTATTTCAAGCAATTGAAGAACTCATGCACGATATTCTTCCTCATCAATTNTAAATACAAATTACAGTCCACATATTNTAATCATAATATTTCTCTAGATCACTGAGTCAGAATCCTGTGGTGAGCTCTAGTCGTTTCGTGATATTGCGTGACCATTATCTATAGCACGTGGTGGATGATTGTCTCGTGCCCAACATGTCCAAACACCACTAGTCGCAGCTTTCAACTGAACAGAATTGATGGAATTGTATCCAAAAGTTGGTCACTAGTAAACACATGATTATTATCAAGATAGGGGTTATGTAGAAACTGTTGGATCTTAGTAGTTTACTTCACGGACTGATCTAAGTTGAACCACCACTGAAAACCAGGAAGCACTGGACAACTGCTTTGTCTTAGTATGGGGCTCCACGGCAGTGTGAATCCGGGAACAAAGGCTCTCGGTTTTATCCCCAGCGAGGTCCTGAATATCTCCTACTGATGGTTTCCATACTAAAACGAAACAGATGTCTAATGCTTACCAGTTTTTAGTGATGGTTTAACTAAAACTATTCTGTGAAGTCAATAATCAAAATTTAACGATCTCCATAAAACTCTTATACTGTAATGTAATTTAATATTTATGTACAAAATTTACAATGAAAAA]

[+] EMBL CD081071             [CTCCAGGCCAAAAATTTGGCACGAGGCAACAAAATAGAAATAAGCTTATATTATTCTCCCTAAACTGTTGCTCTTGTATTATTCAAATTAATGAAGCTAGCTATGATCAAGAAATGTATATAAATAATCTGAGTAATTTCAAACATTTGTTAATAATCATCTGCACAAACTGAATAACAGCTGATTGAACAATGATTATTTCAAGTCGTGTACAAACTTGATTAAAGTGGATATCTGCCTTTAAATCTTCTATAATTATACTCTGATGTTAAAAGCTAAATGTATCTTTACAAAAAGTTGCTGTTCTTGGGAATTTTCACGTGATTAACAGTAAGATTAGTTTAGTACTGTTCATCTCAGTATTACCCATCAACATATTATGCGAAGATTTCCTAACACTTGCCAAATACAACCATTTTATAAATGTTTACTGAGGATTTATGAATTTACAATATTGCAACCAATCACTGACTTATTTTAGCCCAAGATCGTGGCTGTTTACGATAATATATCATAGAGTGATGAGTACACTTACATGTTTAACTAAAATTGTCATTTTTCACTTAACTGATGAGATTTCAAGCTTTTCTCAAATTCTATAATGATTTTCTTAACCATATCATGATAATTTATTAATGATTTCGTTCGATTNTATTTCAAGCAATTGAAGAACTCATGCACGATATTCTTCCTCATCAATTNTAAATACAAATTACAGTCCACATATTNTAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD074893             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AATTTATTAATGATTTCGTTCGATTTTATTTCAAGCAATTGAAGAACTCATGCACGATATTCTTCCTCATCAATTTTAAATACAAATTACAGTCCACATATTTTAATCATAATATTTCTCTAGATCACTGAGTCAGAATCCTGTGGTGAGCTCTAGTCGTTTCGTGATATTGCGTGACCATTATCTATAGCACGTGGTGGATGATTGTCTCGTGCCCAACATGTCCAAACACCACTAGTCGCAGCTTTCAACTGAACAGAATTGATGGAATTGTATCCAAAAGTTGGTCACTAGTAAACACATGATTATTATCAAGATAGGGGTTATGTAGAAACTGTTGGATCTTAGTAGTTTACTTCACGGACTGATCTAAGTTGAACCACCACTGAAAACCAGGAAGCACTGGACAACTGCTTTGTCTTAGTATGGGGCTCCACGGCAGTGTGAATCCGGGAACAAAGGCTCTCGGTTTTATCCCCAGCGAGGTCCTGAATATCTCCTACTGATGGTTTCCATACTAAAACGAAACAGATGTCTAATGCTTACCAGTTTTTAGTGATGGTTTAACTAAAACTATTCTGTGAAGTCAATAATCAAAATTTAACGATCTCCATAAAACTCTTATACTGTAATGTAATTTAATATTTATGTACAAAATTTACAATGAAAAA]


>consensus_547#0 CTCCAGGCCAAAAATTTGGCACGAGGCAACAAAATAGAAATAAGCTTATATTATTCTCCC TAAACTGTTGCTCTTGTATTATTCAAATTAATGAAGCTAGCTATGATCAAGAAATGTATA TAAATAATCTGAGTAATTTCAAACATTTGTTAATAATCATCTGCACAAACTGAATAACAG CTGATTGAACAATGATTATTTCAAGTCGTGTACAAACTTGATTAAAGTGGATATCTGCCT TTAAATCTTCTATAATTATACTCTGATGTTAAAAGCTAAATGTATCTTTACAAAAAGTTG CTGTTCTTGGGAATTTTCACGTGATTAACAGTAAGATTAGTTTAGTACTGTTCATCTCAG TATTACCCATCAACATATTATGCGAAGATTTCCTAACACTTGCCAAATACAACCATTTTA TAAATGTTTACTGAGGATTTATGAATTTACAATATTGCAACCAATCACTGACTTATTTTA GCCCAAGATCGTGGCTGTTTACGATAATATATCATAGAGTGATGAGTACACTTACATGTT TAACTAAAATTGTCATTTTTCACTTAACTGATGAGATTTCAAGCTTTTCTCAAATTCTAT AATGATTTTCTTAACCATATCATGATAATTTATTAATGATTTCGTTCGATTNTATTTCAA GCAATTGAAGAACTCATGCACGATATTCTTCCTCATCAATTNTAAATACAAATTACAGTC CACATATTNTAATCATAATATTTCTCTAGATCACTGAGTCAGAATCCTGTGGTGAGCTCT AGTCGTTTCGTGATATTGCGTGACCATTATCTATAGCACGTGGTGGATGATTGTCTCGTG CCCAACATGTCCAAACACCACTAGTCGCAGCTTTCAACTGAACAGAATTGATGGAATTGT ATCCAAAAGTTGGTCACTAGTAAACACATGATTATTATCAAGATAGGGGTTATGTAGAAA CTGTTGGATCTTAGTAGTTTACTTCACGGACTGATCTAAGTTGAACCACCACTGAAAACC AGGAAGCACTGGACAACTGCTTTGTCTTAGTATGGGGCTCCACGGCAGTGTGAATCCGGG AACAAAGGCTCTCGGTTTTATCCCCAGCGAGGTCCTGAATATCTCCTACTGATGGTTTCC ATACTAAAACGAAACAGATGTCTAATGCTTACCAGTTTTTAGTGATGGTTTAACTAAAAC TATTCTGTGAAGTCAATAATCAAAATTTAACGATCTCCATAAAACTCTTATACTGTAATG TAATTTAATATTTATGTACAAAATTTACAATGAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)