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Schistosoma mansoni
cluster # 5498 cluster # 5498       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5498#0 length = 534 sequences # 3  

consensusID : consensus_5498#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 534
fasta sequence
                              [GAGCTCCGTGCAGTTTCAACTTTCAAAAGACAGCAACTAAACCAGTTAGCCCAACATTCATATCAACTCGCTAATATGGAAAATGTCACCCGCCAGGAATCAGGAACTGTTTCTAAAGAATTAACGGTTAATCACAAGTTAACTTCTGATGTGAAGCGACTTAAACAGGGTCAAGCCTTAAACATGGCCCGCATCTGTAAATTGAGTCGTATGGTGTATTATTTACTTTGTAAACAACGAGAAGTGACTGAGCAGAACAAACAGTTGGGTTCACTAGTAAAAATGCAAAGTCGTAGAATAAAACAGTTAGAAGCTATTTGTGGGACAAATTCAGTCAACTGTTCAGATGGATTAGAGTCAACATCGTCGTCCTCACCTTCATCGGCTGTTTGCACTTCGTCTTCACCTAGCCACTGCAACCAGTTATCTACAACATTTAGTGAACAAAATATCTTAAAATCTGGTAATAAAAGAGTTAAATCTAATGGTGATGTTCATATTTGTGATAATGAAATTCATTGTATGGTGCCGTCG]

[+] EMBL CD137421             [GAGCTCCGTGCAGTTTCAACTTTCAAAAGACAGCAACTAAACCAGTTAGCCCAACATTCATATCAACTCGCTAATATGGAAAGTGTCACCCGCCAGGAATCAGGAACTGTTTCTAAAGAATTAACGGTTAATCACAAGTTAACTTCCGATGTGAAGCGACTTAAACAGGGTCAAGCCTTAAACATGGCCCGCATCTGTAAATTGAGTCGTATGGTGTATTATTTACTTTGTAAACAACGAGAAGTGACTGAGCAGAACAAACAGTTGGGTTCACTAGTAAAAATGCAAAGTCGTAGAATAAAACAGTTAGAAGCTATTTGTGGGACAAATTCAGTCAACTGTTCAGATGGATTAGAGTCAACATCGTCGTCCTCACCTTCATCGGCTGTTTGCACTTCGTCTTCACCTAGCCACTGCAACCAGTTATCTACAACATTTAGTGAACAAAATATCTTANAATCTGGTAATAAAAGAGTTAAATCTAATGGTGATGTTCATATTTGTGATAATG                       ]
[+] EMBL CD137354             [GAGCTCCGTGCAGTTTCAACTTTCAAAAGACAGCAA  AAACCAGTTAGCCCAACATTCATATCAACTCGCTAATATGGAAAATGTCACCCGCCAGGAATCAGGAACTGTTTCTAAAGAATTAACGGTTAATCACAAGTTAACTTCTGATGTGAAGCGACTTAAACAGGGTCAAGCCTTAAACATGGCCCGCATCTGTAAATTGAGTCGTATGGTGTATTATTTACTTTGTAAACAACGAGAAGTGACTGAGCAGAACAAACAGTTGGGTTCACTAGTAAAAATGCAAAGTCGTAGAATAAAACAGTTAGAAGCTATTTGTGGGACAAATTCAGTCAACTGTTCAGATGGATTAGAGTCAACATCGTCGTCCTCACCTTCATCGGCTGTTTGCACTTCGTCTTCACCTAGCCACTGCAACCAGTTATCTACAACATTTAGTGAACAAAATATCTTAAAATCTGGTAATAAAAGAGTTAAATCTAATGGTGATGTTCATATTTGTGATAATG                       ]
[-] EMBL CD196842             [                                                                                 AATGTCACCCGCCAGGAATCAGGAACTGTTTCTAAAGAATTAACGGTTAATCACAAGTTAACTTCTGATGTGAAGCGACTTAAACAGGGTCAAGCCTTAAACATGGCCCGCATCTGTAAATTGAGTCGTATGGTGTATTATTTACTTTGTAAACAACGAGAAGTGACTGAGCAGAACAAACAGTTGGGTTCACTAGTAAAAATGCAAAGTCGTAGAATAAAACAGTTAGAAGCTATTTGTGGGACAAATTCAGTCAACTGTTCAGATGGATTAGAGTCAACATCGTCGCCCTCACCTTCATCGGCTGTTTGCACTTCGTCTTCACCTAGCCACTGCAACCAGTNATCTACAACATTTAGTGAACAAAATATCTTAAAATCTGGTAATAAAAGAGTTAAATCTAATGGTGATGTTCATATTTGTGATAATGAAATTCATTGTATGGTGCCGTCG]


>consensus_5498#0 GAGCTCCGTGCAGTTTCAACTTTCAAAAGACAGCAACTAAACCAGTTAGCCCAACATTCA TATCAACTCGCTAATATGGAAAATGTCACCCGCCAGGAATCAGGAACTGTTTCTAAAGAA TTAACGGTTAATCACAAGTTAACTTCTGATGTGAAGCGACTTAAACAGGGTCAAGCCTTA AACATGGCCCGCATCTGTAAATTGAGTCGTATGGTGTATTATTTACTTTGTAAACAACGA GAAGTGACTGAGCAGAACAAACAGTTGGGTTCACTAGTAAAAATGCAAAGTCGTAGAATA AAACAGTTAGAAGCTATTTGTGGGACAAATTCAGTCAACTGTTCAGATGGATTAGAGTCA ACATCGTCGTCCTCACCTTCATCGGCTGTTTGCACTTCGTCTTCACCTAGCCACTGCAAC CAGTTATCTACAACATTTAGTGAACAAAATATCTTAAAATCTGGTAATAAAAGAGTTAAA TCTAATGGTGATGTTCATATTTGTGATAATGAAATTCATTGTATGGTGCCGTCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)