cluster # 5522

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Schistosoma mansoni
cluster # 5522 cluster # 5522 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5522#0 length = 561 sequences # 3

consensusID : consensus_5522#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 561
fasta sequence

                              [TATTCATCATCCTATTTTGTCAACAGCGTTCACAACCAATAAAACACTACATGGTTCATTATTTGCTTCAGTTTATTGTGAAATGAAAGCCTAATAGTTATAAAATACACTGTAGGGTTGGAAGTGAAGAAGCATGAAATATAGAAGAAAAATATCATATATGTATACAATTATGATTATTTGTTACAGTTATGTTTTTTTAAATGTCATCATTTATGTGTTTATCATTATCAGTGTTTTTGATCACTAAATAAAAGTCATTTCCCTCAAACTACCTTTTTTCCCCACACTTAATAGCACTTTACGTAGAAATTCTTTGTCAGATTGATCGAACAGACAATCTGTGTTGTTTGATAAAGTTAACATTAGAATTAAGTTTATTAAGTATGTTAGGGAAAAAAAGTATAAGTGCACTTTTAAGATTGATCTGATTTTCCAGCACCTTACATGTTCTATCATCTCATTTTTCTTATCATTGTAATTTTTAGATCTATGACTTACATTAGTTCACCAACATAACATATTAAG-CCTTCTTGAATAGAACAGTGGCTTTGTGGTCAA]

[+] EMBL CD088692             [TATTCATCATCCTATTTTGTCAACAGCGTTCACAACCAATAAAACACTACATGGTTCATTATTTGCTTCAGTTTATTGTGAAATGAAAGCCTAATAGTTATAAAATACACTGTAGGGTTGGAAGTGAAGAAGCATGAAATATAGAAGAAAAATATCATATATGTATACAATTATGATTATTTGTTACAGTTATGTTTTTTTAAATGTCATCATTTATGTGTTTATCATTATCAGTGTTTTTGATCACTAAATAAAAGTCATTTCCCTCAAACTACCTTTTTTCCCCACACTTAATAGCACTTTACGTAGAAATTCTTTGTCAGATTGATCGAACAGACAATCTGTGTTGTTTGATAAAGTTAACATTAGAATTAAGTTTATTAAGTATGTTAGGGAAAAAAAGTATAAGTGCACTTTTAAGATTGATCTGATTTTCCAGCACCTTACATGTTCTATCATCTCATTTTTCTTATCATTGTAATTTTTAGATCTATGACTTACATTAGTTCACCAACATAACATATTAAG CCTTCTTGAATAGAACAGTGGCTTTGTGGTCAA]
[+] EMBL CD088660             [TATTCATCATCCTATTTTGTCAACAGCGTTCACAACCAATAAAACACTACATGGTTCATTATTTGCTTCAGTTTATTGTGAAATGAAAGCCTAATAGTTATAAAATACACTGTAGGGTTGGAAGTGAAGAAGCATGAAATATAGAAGAAAAATATCATATATGTATACAATTATGATTATTTGATACAGTTATGTTTTTTTAAATGTCATCATTTATGTGTTTATCATTATCAGTGTTTTTGATCACTAAATAAAAGTCATTTCCCTCAAACTACCCTTTTTCCCCACACTTAATAGCACTTTACGTAGAAATTCTTTGTCAGATTGATCGAACAGACAATCTGTGTTGTTTGATAAAGTTAACATTAGAATTAAGTTTATTAAGTATGTTAGGGAAAAAAAGTATAAGTGCACTTTTAAGATTGATCTGATTNTCCAGCACCTTACATGTTCTATCATCTCATTNTTCTTATCATTNNGAATTTTAGATCTATGACTTACATTAGNTCACCAACATAACATATTAAGCCCTTCTTGAAT                      ]
[-] EMBL CD088676             [ ATTCATCATCCTATTTTGTCAACAGCGTTCACAACCAATAAAACACTACATGGTTCATTATTTGCTTCAGTTTATTGTGAAATGAAAGCCTAATAGTTATAAAATACACTGTAGGGTTGGAAGTGAAGAAGCATGAAATATAGAAGAAAAATATCATATATGTATACAATTATGATTATTTGTTACAGTTATGTTTTTTTAAATGTCATCATTTATGTGTTTATCATTATCAGTGTTTTTGATCACTAAATAAAAGTCATTTCCCTCAAACTACCTTTTTTCCCCACACTTAATAGCACTTTACGTAGAAATTCTTTGTCAGATTGATCGAACAGACAATCTGTGTTGTTTGATAAAGTTAACATTAGAATTAAGTTTATTAAGTATGTTAGGGAAAAAAAGTATAAGTGCACTTTTAAGATTGATCTGATTTTCCAGCACCTTACATGTTCTATCATCTCATTTTTCTTATCAATGTAATTTTTAGATCTATGACTTAC                                                             ]




>consensus_5522#0
TATTCATCATCCTATTTTGTCAACAGCGTTCACAACCAATAAAACACTACATGGTTCATT
ATTTGCTTCAGTTTATTGTGAAATGAAAGCCTAATAGTTATAAAATACACTGTAGGGTTG
GAAGTGAAGAAGCATGAAATATAGAAGAAAAATATCATATATGTATACAATTATGATTAT
TTGTTACAGTTATGTTTTTTTAAATGTCATCATTTATGTGTTTATCATTATCAGTGTTTT
TGATCACTAAATAAAAGTCATTTCCCTCAAACTACCTTTTTTCCCCACACTTAATAGCAC
TTTACGTAGAAATTCTTTGTCAGATTGATCGAACAGACAATCTGTGTTGTTTGATAAAGT
TAACATTAGAATTAAGTTTATTAAGTATGTTAGGGAAAAAAAGTATAAGTGCACTTTTAA
GATTGATCTGATTTTCCAGCACCTTACATGTTCTATCATCTCATTTTTCTTATCATTGTA
ATTTTTAGATCTATGACTTACATTAGTTCACCAACATAACATATTAAGCCTTCTTGAATA
GAACAGTGGCTTTGTGGTCAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case