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Schistosoma mansoni
cluster # 5560 cluster # 5560       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5560#0 length = 618 sequences # 3  

consensusID : consensus_5560#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 618
fasta sequence
                              [TACCGACACTAATCCTCTGCATATAA-TTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAA-TTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAAATTTGAGGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTCTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTNNTGAGAGCTACGTTATACC]

[+] EMBL CD088550             [TACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTNTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTNTGAAGAGCTACGNTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAAATTTGAGGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTCTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTNNTGAGAGCTACGTTATACC]
[-] EMBL CD098500             [         TAATCCTCTGCATATAA TTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAA TNTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTNTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAGGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATAC                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD088576             [                   CATATAA TTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAA TTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAA TTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAGGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATAC                                             ]


>consensus_5560#0 TACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTC TGCATATAATTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAG AGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGA CACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCAT ATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCT ACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACT AATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAA TTTTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTTTGAAGAGCTACGT TATACCGACACTAATCCTCTGCATATAAATTTGAGGAGCTACGTTATACCGACACTAATC CTCTGCATATAATTCTGAAGAGCTACGTTATACCGACACTAATCCTCTGCATATAATTNN TGAGAGCTACGTTATACC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)