Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5581 cluster # 5581       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5581#0 length = 491 sequences # 3  
consensusID : consensus_5581#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 491
fasta sequence 
                              [TTTAAAACTTTCCAGTTGTATTAATTCACCTAATTTACTTCGAAATTCCAGTCCAACAATTTGTTCACCCATAAATCATTGTGTGATACCGAAATTCTCTATTCCTCAGTCCATTTCTTTACATCAAACAATGAATGAACAATTGGCAAGAACATCTCAAGAAAATTCCTAAAATAATCTACAATCAGCTACTGTTCTATTCCTTAATCAAAATAATTCTCATCATAATCAGGAACAACAGCGACAACAACAAATAAATGATATAAACGATATTGCTTTAGTTAGAATAATATATAAAGAAAATTATACAAAATCTAATAAATTTCTATAATTTTGCGTTAATGGAACAATTAAATCAACATTAATCACAATATTCAATGAGTATGATGATGATGATGATGACATCACCAACTGCACAATTAAGTTCAAATCAATTTCATAGTGATTTAGAACACCATGGTTGGCCGAATCTTCTAGAAACAAGAGCTAAT]

[+] EMBL CD137119             [TTTAAAACTTTCCAGTTGTATTAATTCACCTAATTTACTTCGAAATTCCAGTCCAACAATTTGTTCACCCATAAATCATTGTGTGATACCGAAATTCTCTATTCCTCAGTCCATTTCTTTACATCAAACAATGAATGAACAATTGGCAAGAACATCTCAAGAAAATTCCTAAAATAATCTACAATCAGCTACTGTTCTATTCCTTAATCAAAATAATTCTCATCATAATCAGGGACAACAGCGACAACAACAAATAAATGATATAAACGATATTGCTTTAGTTAGAATAATATATAAAGAAAATTATACAAAATCTAATAAATTTCTGTAATTTTGCGTTAATGGAACAATTAAATCAACATTAATCACAATATTCAATGAGTATGATGATGATGATGATGACATCACCAACTGCACAATTAAGTTCAAATCAATTTCATAGTGATTTAGAACACCATGGTTGGCCGAATCTTCTAGAAACAAGAGCTAA ]
[+] EMBL CD137179             [TTTAAAACTTTCCAGTTGTATTAATTCACCTAATTTACTTCGAAATTCCAGTCCAACAATTTGTTCACCCATAAATCATTGTGTGATACCGAAATTCTCTATTCCTCAGTCCATTTCTTTACATCAAACAATGAATGAACAATTGGCAAGAACATCTCAAGAAAATTCCTAAAATAATCTACAATCAGCTACTGTTCTATTCCTTAATCAAAATAATTCTCATCATAATCAGGAACAACAGCGACAACAACAAATAAATGATATAAACGATATTGCTTTAGTTAGAATAATATATAAAGAAAATTATACAAAATCTAATAAATTTCTATAATTTTGCGTTAATGGAACAATTAAATCAACATTAATCACAATATTCAATGAGTATGATGATGATGATGATGACATCACCAACTGCACAATTAAGTTCAAATCAATTCCATAGTGATTTAGAACACCATGGTTGGCCGAATCTTCTAGAAACAAGAGCTAA ]
[-] EMBL CD136798             [ TTAAAACTTTCCAGTTGTATTAATTCACNTAATTTACTTCGAAATTCCAGTCCAACAATTTGTTCACCCATAAATCATTGTGTGATACCGAAATTCTCTATTCCTCAGTCCATTTCTTTACATCAAACAATGAATGAACAATTGGCAAGAACATCTCAAGAAAATTCCTAAAATAATCTACAATCAGCTACTGTTCTATTCCTTAATCAAAATAATTCTCATCATAATCAGGAACAACAGCGACAACAACAAATAAATGATATAAACGATATTGCTTTAGTTAGAATAATATATAAAGAAAATTATACAAAATCTAATAAATTTCTATAATTTTGCGTTAATGGAACAATTAAATCAACATTAATCACAATATTCAATGAGTATGATGATGATGATGATGACATCACCAACTGCACAATTAAGTTCAAATCAATTTCATAGTGATTTAGAACACCATGGTTGGCCGAATCTTCTAGAAACAAGAGCTAAT]




>consensus_5581#0
TTTAAAACTTTCCAGTTGTATTAATTCACCTAATTTACTTCGAAATTCCAGTCCAACAAT
TTGTTCACCCATAAATCATTGTGTGATACCGAAATTCTCTATTCCTCAGTCCATTTCTTT
ACATCAAACAATGAATGAACAATTGGCAAGAACATCTCAAGAAAATTCCTAAAATAATCT
ACAATCAGCTACTGTTCTATTCCTTAATCAAAATAATTCTCATCATAATCAGGAACAACA
GCGACAACAACAAATAAATGATATAAACGATATTGCTTTAGTTAGAATAATATATAAAGA
AAATTATACAAAATCTAATAAATTTCTATAATTTTGCGTTAATGGAACAATTAAATCAAC
ATTAATCACAATATTCAATGAGTATGATGATGATGATGATGACATCACCAACTGCACAAT
TAAGTTCAAATCAATTTCATAGTGATTTAGAACACCATGGTTGGCCGAATCTTCTAGAAA
CAAGAGCTAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)