Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5612 cluster # 5612       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5612#0 length = 693 sequences # 3  

consensusID : consensus_5612#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 693
fasta sequence
                              [ACATCACTTTCACCCACAGGTTGCTTAGCCCTTAGTTCTTGTGGTGGTAATTTGCGTTTGTGGCCTCGATTAATGCGTAACTATGTCCATGTTGATTCTGTGCTACCAGCCCCTATCGGTGGTTTATTTGGAGACCAAGCAATACAGTTAGAGCATATTCATGTATCTGGTGCATTTATTGTCGCCACTCGAACTGGTCATCTTATTCTCATCGATACACGTAATCCTCAGGATAATGTGGTTACCCGTTTACTTACCAATACAAATGATGGAAGTCTACGTTCACAAGGTTTATTATCTGGATTGGGTCGTCGCGTTTCGAACTTTTTCAGTTTGGTTTCTTCAACCGCAACCAGTGGTCAAGGGAAGTCATTACCAGCTCGCGGTGGTGAAAATTTTGTATTTATTCGTTTAATCTCATGTACACCATCTTCAGCATCCGATAGTGATAAATGTCTTTGTTTTGCGCTGTATAAAAACCAATTGGATATTTGGTCAATTCATCGGAATTTGAACTATCAGATAGGTGGTGTTTATACCGTTGCATCCCTGATCGATTCAACTATGGCATTTGAAAATGATTCATTAAATTGGGAAGCTGTTGACTTTGCATTACAATCGAATCGTTATACATCGAGTGATCANACTGTAGTATATCTACTTTTAAGTCGTACTGATCAGTCACAATTATCA]

[+] EMBL CD153211             [ACATCACTTTCACCCACAGGTTGCTTAGCCCTTAGTTCTTGTGGTGGTAATTTGCGTTTGTGGCCTCGATTAATGCGTAACTATGTCCATGTTGATTCTGTGCTACCAGCCCCTATCGGTGGTTTATTTGGAGACCAAGCAATACAGTTAGAGCATATTCATGTATCTGGTGCATTTATTGTCGCCACTCGAACTGGTCATCTTATTCTCATCGATACACGTAATCCTCAGGATAATGTGGTTACCCGTTTACTTACCAATACAAATGATGGAAGTCTACGTTCACAAGGTTTATTATCTGGATTGGGTCGTCGCGTTTCGAACTTTTTCAGTTTGGTTTCTTCAACCGCAACCAGTGGTCAAGGGAAGTCATTACCAGCTCGCGGTGGTGAAAATTTTGTATTTATTCGTTTAATCTCATGTACACCATCTTCAGCATCCGATAGTGATAAATGTCTTTGTTTTGCGCTGTATAAAAACCAATTGGATATTTGGTCAATTCATCGGAATTTGAACTATCAGATAGGTGGTGT                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD153109             [ACATCACTTTCACCCACAGGTTGCTTAGCCCTTAGTTCTTGTGGTGGTAATTTGCGTTTGTGGCCTCGATTAATGCTTAACTATGTCCATGTTGATTCTGTGCTACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD088393             [                     TGCTTAGCCCTTAGTTCTTGTGGTGGTAATTTGCGTTTGTGGCCTCGATTAATGCGTAACTATGTCCATGTTGATTCTGTGCTACCAGCCCCTATCGGTGGTTTATTTGGAGACCAAGCAATACAGTTAGAGCATATTCATGTATCTGGTGCATTTATTGTCGCCACTCGAACTGGTCATCTTATTCTCATCGATACACGTAATCCTCAGGATAATGTGGTTACCCGTTTACTTACCAATACAAATGATGGAAGTCTACGTTCACAAGGTTTATTATCTGGATTGGGTCGTCGCGTTTCGAACTTTTTCAGCTTGGTTTCTTCAGCCGCAACCAGTGGTCAAGGGAAGTCATTACCAGCTCGCGGTGGTGAAAATTTTGTATTTATTCGTTTAATCTCATGTACACCATCTTCAGCATCCGATAGTGATAAATGTCTTTGTTTTGCGCTGTATAAAAACCAATTGGATATTTGGTCAATTCATCAGAATTTGAACTATCAGATAGGTGGTGTTTATACCGTTGCATCCCTGATCGATTCAACTATGGCATTTGAAAATGATTCATTAAATTGGGAAGCTGTTGACTTTGCATTACAATCGAATCGTTATACATCGAGTGATCANACTGTAGTATATCTACTTTTAAGTCGTACTGATCAGTCACAATTATCA]


>consensus_5612#0 ACATCACTTTCACCCACAGGTTGCTTAGCCCTTAGTTCTTGTGGTGGTAATTTGCGTTTG TGGCCTCGATTAATGCGTAACTATGTCCATGTTGATTCTGTGCTACCAGCCCCTATCGGT GGTTTATTTGGAGACCAAGCAATACAGTTAGAGCATATTCATGTATCTGGTGCATTTATT GTCGCCACTCGAACTGGTCATCTTATTCTCATCGATACACGTAATCCTCAGGATAATGTG GTTACCCGTTTACTTACCAATACAAATGATGGAAGTCTACGTTCACAAGGTTTATTATCT GGATTGGGTCGTCGCGTTTCGAACTTTTTCAGTTTGGTTTCTTCAACCGCAACCAGTGGT CAAGGGAAGTCATTACCAGCTCGCGGTGGTGAAAATTTTGTATTTATTCGTTTAATCTCA TGTACACCATCTTCAGCATCCGATAGTGATAAATGTCTTTGTTTTGCGCTGTATAAAAAC CAATTGGATATTTGGTCAATTCATCGGAATTTGAACTATCAGATAGGTGGTGTTTATACC GTTGCATCCCTGATCGATTCAACTATGGCATTTGAAAATGATTCATTAAATTGGGAAGCT GTTGACTTTGCATTACAATCGAATCGTTATACATCGAGTGATCANACTGTAGTATATCTA CTTTTAAGTCGTACTGATCAGTCACAATTATCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)