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Schistosoma mansoni
cluster # 5630 cluster # 5630       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5630#0 length = 568 sequences # 3  

consensusID : consensus_5630#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 568
fasta sequence
                              [TTTGGCTAGTCTGTCATGTGCTCTAGTGATCATAACAGTACAAAGACACATGCGACTTGTTACTATCCAAAGGACAGTGTTAAGTAAGTTAATAAAAGGGTTTAACAAAAATTAACCATGATCGAAATTGGGTAGAGGGATAGTTGCTATAAATTTTCTAAACATAGACTTGTATATATGTATGAATGAGTATTTGTGCATTTTATTCGGTAGTCCAATACACTTTCTAGCTCTTGTGTTCTAGCCCTAGTAGTCACTTGTGGGGTTAGCGCGCAACACACCGTGTGTCAGAATCAGATTTTTGACACCGCACATCCCAACATTAAACATATATATTGAATTGGTGGTCAGTAATTCTTCATGAGTGAGCACTTGCAATAGGTAGTAGCGGTTGATTGTTCAAGATTTAGAAACTAGAATGGAGTTCAAGAAATTTTTAGGATGAGATATTTAATACCCCACCTTTGTACAAAGTTCAGGTTCGAATTATCAGGTAAACTTATTTTATTCCTTACTCCTAATAAATTATGTCTACCGATTGCAATATAAAATCGCTTTATTTCCGCCC]

[+] EMBL AI067179             [TTTGGCTAGTCTGTCATGTGCTCTAGTGATCATAACAGTACAAAGACACATGCGACTTGTTACTATCCAAAGGACAGTGTTAAGTAAGTTAATAAAAGGGTTTAACAAAAATTAACCATGATCGAAATTGGGTAGAGGGATAGTTGCTATAAATTTTCTAAACATAGACTTGTATATATGTATGAATGAGTATTTGTGCATTTTATTCGGTAGTCCAATACACTTTCTAGCTCTTGTGTTCTAGCCCTAGTAGTCACTTGTGGGGTTAGCGCGCAACACACCGTGTGTCAGAATCAGATTTTTGACACCGCACATCCCAACATTAAACATATATATTGAATTGGTGGTCAGTAATTCTTCATGAGTGAGCACTTGCAATAGGTAGTAGCGGTTGATTGTTCAAGATTTAGAAACTAGAATGGAGTTCAAGAAATTTTTAGGATGAGATATTTAATACCCCACCTTTGTACAAAGTTCAGGTTCGAATTATCAGGTAAACTTATTTTATTCCTTACTCCTAATA                                             ]
[+] EMBL AI067961             [      TAGTCTGTCATGTGCTCTAGTGATCATAACAGTACAAAGACACATGCGACTTGTTACTATCCAAAGGACAGTGTTAAGTAAGTTAATAAAAGGGTTTAACAAAAATTAACCATGATCGAAATTGGGTAGAGGGATAGTTGCTATAAATTTTCTAAACATAGACTTGTATATATGTATGAATGAGTATTTGTGCATTTTATTCGGTAGTCCAATACACTTTCTAGCTCTTGTGTTCTAGCCCTAGTAGTCACTTGTGGGGTTAGCGCGCAACACACCGTGTGTCAGAATCAGATTTTTGACACCGCACATCCCAACATTAAACATATATATTGAATTGGTGGTCAGTAATTCTTCATGAGTGAGCACTTGCAATAGGTAGTAGCGGTTGATTGTTCAAGATTTAGAAACTAGAATGGAGTTCAAGAAATTTTTAGGATGAGATATTTAATACCCCACCTTTGTACAAAGTTCAGGTTCGAATTATCAGGTAAACTTATTTTATTCCTTACTCCTAATAAATTATGTCTACCGATTGCAATATAAAATCGCTTTATTTCCGCCC]
[+] EMBL AI067043             [      TAGTCTGTCATGTGCTCTAGTGATCATAACAGTACAAAGACACATGCGACTTGTTACTATCCAAAGGACAGTGTTAAGTAAGTTAATAAAAGGGTTTAACAAAAATTAACCATGATCGAAATTGGGTAGAGGGATAGTTGCTATAAATTTTCTAAACATAGACTTGTATATATGTATGAATGAGTATTTGTGCATTTTATTCGGTAGTCCAATACACTTTCTAGCTCTTGTGTTCTAGCCCTAGTAGTCACTTGTGGGGTTAGCGCGCAACACACCGTGTGTCAGAATCAGATTTTg                                                                                                                                                                                                                                                                         ]


>consensus_5630#0 TTTGGCTAGTCTGTCATGTGCTCTAGTGATCATAACAGTACAAAGACACATGCGACTTGT TACTATCCAAAGGACAGTGTTAAGTAAGTTAATAAAAGGGTTTAACAAAAATTAACCATG ATCGAAATTGGGTAGAGGGATAGTTGCTATAAATTTTCTAAACATAGACTTGTATATATG TATGAATGAGTATTTGTGCATTTTATTCGGTAGTCCAATACACTTTCTAGCTCTTGTGTT CTAGCCCTAGTAGTCACTTGTGGGGTTAGCGCGCAACACACCGTGTGTCAGAATCAGATT TTTGACACCGCACATCCCAACATTAAACATATATATTGAATTGGTGGTCAGTAATTCTTC ATGAGTGAGCACTTGCAATAGGTAGTAGCGGTTGATTGTTCAAGATTTAGAAACTAGAAT GGAGTTCAAGAAATTTTTAGGATGAGATATTTAATACCCCACCTTTGTACAAAGTTCAGG TTCGAATTATCAGGTAAACTTATTTTATTCCTTACTCCTAATAAATTATGTCTACCGATT GCAATATAAAATCGCTTTATTTCCGCCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)