cluster # 5630

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Schistosoma mansoni
cluster # 5630 cluster # 5630 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5630#0 length = 568 sequences # 3

consensusID : consensus_5630#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 568
fasta sequence

                              [TTTGGCTAGTCTGTCATGTGCTCTAGTGATCATAACAGTACAAAGACACATGCGACTTGTTACTATCCAAAGGACAGTGTTAAGTAAGTTAATAAAAGGGTTTAACAAAAATTAACCATGATCGAAATTGGGTAGAGGGATAGTTGCTATAAATTTTCTAAACATAGACTTGTATATATGTATGAATGAGTATTTGTGCATTTTATTCGGTAGTCCAATACACTTTCTAGCTCTTGTGTTCTAGCCCTAGTAGTCACTTGTGGGGTTAGCGCGCAACACACCGTGTGTCAGAATCAGATTTTTGACACCGCACATCCCAACATTAAACATATATATTGAATTGGTGGTCAGTAATTCTTCATGAGTGAGCACTTGCAATAGGTAGTAGCGGTTGATTGTTCAAGATTTAGAAACTAGAATGGAGTTCAAGAAATTTTTAGGATGAGATATTTAATACCCCACCTTTGTACAAAGTTCAGGTTCGAATTATCAGGTAAACTTATTTTATTCCTTACTCCTAATAAATTATGTCTACCGATTGCAATATAAAATCGCTTTATTTCCGCCC]

[+] EMBL AI067179             [TTTGGCTAGTCTGTCATGTGCTCTAGTGATCATAACAGTACAAAGACACATGCGACTTGTTACTATCCAAAGGACAGTGTTAAGTAAGTTAATAAAAGGGTTTAACAAAAATTAACCATGATCGAAATTGGGTAGAGGGATAGTTGCTATAAATTTTCTAAACATAGACTTGTATATATGTATGAATGAGTATTTGTGCATTTTATTCGGTAGTCCAATACACTTTCTAGCTCTTGTGTTCTAGCCCTAGTAGTCACTTGTGGGGTTAGCGCGCAACACACCGTGTGTCAGAATCAGATTTTTGACACCGCACATCCCAACATTAAACATATATATTGAATTGGTGGTCAGTAATTCTTCATGAGTGAGCACTTGCAATAGGTAGTAGCGGTTGATTGTTCAAGATTTAGAAACTAGAATGGAGTTCAAGAAATTTTTAGGATGAGATATTTAATACCCCACCTTTGTACAAAGTTCAGGTTCGAATTATCAGGTAAACTTATTTTATTCCTTACTCCTAATA                                             ]
[+] EMBL AI067961             [      TAGTCTGTCATGTGCTCTAGTGATCATAACAGTACAAAGACACATGCGACTTGTTACTATCCAAAGGACAGTGTTAAGTAAGTTAATAAAAGGGTTTAACAAAAATTAACCATGATCGAAATTGGGTAGAGGGATAGTTGCTATAAATTTTCTAAACATAGACTTGTATATATGTATGAATGAGTATTTGTGCATTTTATTCGGTAGTCCAATACACTTTCTAGCTCTTGTGTTCTAGCCCTAGTAGTCACTTGTGGGGTTAGCGCGCAACACACCGTGTGTCAGAATCAGATTTTTGACACCGCACATCCCAACATTAAACATATATATTGAATTGGTGGTCAGTAATTCTTCATGAGTGAGCACTTGCAATAGGTAGTAGCGGTTGATTGTTCAAGATTTAGAAACTAGAATGGAGTTCAAGAAATTTTTAGGATGAGATATTTAATACCCCACCTTTGTACAAAGTTCAGGTTCGAATTATCAGGTAAACTTATTTTATTCCTTACTCCTAATAAATTATGTCTACCGATTGCAATATAAAATCGCTTTATTTCCGCCC]
[+] EMBL AI067043             [      TAGTCTGTCATGTGCTCTAGTGATCATAACAGTACAAAGACACATGCGACTTGTTACTATCCAAAGGACAGTGTTAAGTAAGTTAATAAAAGGGTTTAACAAAAATTAACCATGATCGAAATTGGGTAGAGGGATAGTTGCTATAAATTTTCTAAACATAGACTTGTATATATGTATGAATGAGTATTTGTGCATTTTATTCGGTAGTCCAATACACTTTCTAGCTCTTGTGTTCTAGCCCTAGTAGTCACTTGTGGGGTTAGCGCGCAACACACCGTGTGTCAGAATCAGATTTTg                                                                                                                                                                                                                                                                         ]




>consensus_5630#0
TTTGGCTAGTCTGTCATGTGCTCTAGTGATCATAACAGTACAAAGACACATGCGACTTGT
TACTATCCAAAGGACAGTGTTAAGTAAGTTAATAAAAGGGTTTAACAAAAATTAACCATG
ATCGAAATTGGGTAGAGGGATAGTTGCTATAAATTTTCTAAACATAGACTTGTATATATG
TATGAATGAGTATTTGTGCATTTTATTCGGTAGTCCAATACACTTTCTAGCTCTTGTGTT
CTAGCCCTAGTAGTCACTTGTGGGGTTAGCGCGCAACACACCGTGTGTCAGAATCAGATT
TTTGACACCGCACATCCCAACATTAAACATATATATTGAATTGGTGGTCAGTAATTCTTC
ATGAGTGAGCACTTGCAATAGGTAGTAGCGGTTGATTGTTCAAGATTTAGAAACTAGAAT
GGAGTTCAAGAAATTTTTAGGATGAGATATTTAATACCCCACCTTTGTACAAAGTTCAGG
TTCGAATTATCAGGTAAACTTATTTTATTCCTTACTCCTAATAAATTATGTCTACCGATT
GCAATATAAAATCGCTTTATTTCCGCCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case