cluster # 5647

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Schistosoma mansoni
cluster # 5647 cluster # 5647 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5647#0 length = 862 sequences # 3

consensusID : consensus_5647#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 862
fasta sequence

                              [TTTCTACATATGATAGTGCTACACCACAGGAGGGCATACAAGCTGCATCAAGGAGAACTCCTATAAACATTCCATCCAGCTCTCTGCCTTCATTTCCTTATGGTGCAGCTAAATATTTTGTTCCATCTCATCTACCTGGTAAAATATTAACTGATGGTTTAGACAATCAAACTTTCAGTGTAACATCAGTCAGTTTTAGTTCAGATGGTGAAGAGCTATTAGCTAATGTTGGACGTGATAATATTTATCTGTTTCATTTAGCTTCACAAAATGAACCATTTCAATGTCAATTATCGTTTAAATCAACTAGATTATTGTATAGTTTATCGGCATCGCAACCAAGGAATCGATTTCGTTCTTTTCGTATTCCTACCTGGTTTCGTCCTTCAAATATGGGATATTATGATTCTTATTCGGGTTCAACCTATGATTACCGTTGTAATTCTTCTATGGATTCTGATTACGCAACCGTACTGGCTTCACGATTAATTGAAGCCAAGGCGTATGCTGTTGCAGTTCATAAATATAATCAACTTATTCAACAGCATCCTTTCTGTCCTCAACTGTATACAGGTCGCGCTACTGCTTTAATTAAAAGAAATTGGAATGGTGATATTTATAATGCGCTATTGGATTGCCGAAACGCTATCCAACTGACTACTCAAAGCAACAATGATTCTTTCAGCATTCAAAACAACGATACCATTAATGAGCACCAATTGTTAAACAGTTCCGTTTACCTTTCAGCTCTATTACTTTCAGTTCGATGTTTATTATATTTGGATTGGTTAAATGCTGCTCGTATTCAACTCAAACAAGCATTGAACAGCTTTCCCAATCTCTTCAAACATACTACGCATCA]

[+] EMBL CD147459             [TTTCTACATATGATAGTGCTACACCACAGGAGGGCATACAAGCTGCATCAAGGAGAACTCCTATAAACATTCCATCCAGCTCTCTGCCTTCATTTCCTTATGGTGCAGCTAAATATTTTGTTCCATCTCATCTACCTGGTAAAATATTAACTGATGGTTTAGACAATCAAACTTTCAGTGTAACATCAGTCAGTTTTAGTTCAGATGGTGAAGAGCTATTAGCTAATGTTGGACGTGATAATATTTATCTGTTTCATTTAGCTTCACAAAATGAACCATTTCAATGTCAATTATCGTTTAAATCAACTAGATTATTGTATAGTTTATCGGCATCGCAACCAAGGAATCGATTTCGTTCTTTTCGTATTCCTACCTGGTTTCGTCCTTCAAATATGGGATATTATGATTCTTATTCGGGTTCAACCTATGATTACCGTTGTAATTCTTCTATGGATTCTGATTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD117329             [                                                                                 CTCTGCCTTCATTTCCTTATGGTGCAGCTAAATATTTTGTTCCATCTCATCTACCTGGTAAAATATTAACTGATGGTTTAGACAATCAAACTTTCAGTGTAACATCAGTCAGTTTTAGTTCAGATGGTGAAGAGCTATTAGCTAATGTTGGACGTGATAATATTTATCTGTTTCATTTAGCTTCACAAAATGAACCATTTCAATGTCAATTATCGTTTAAATCAACTAGATTATTGTATAGTTTATCGGCATCGCAACCAAGGAATCGATTTCGTTCTTTTCGTATTCCTACCTGGTTTCGTCCTTCAAATATGGGATATTATGATTCTTATTCGGGTTCAACCTATGATTACCGTTGTAATTCTTCTATGGCTTCTGATTACGCAACCGTACTGGCTTCACGATTAATTGAAGCCAAGGCGTATGCTGTTGCAGTTCATAAATATAATCAACTTATTCAACAGCATCCTTTCTGTCCTCAACTGTATACAGGTCGCGCTACTGCTTTAATTAAAAGAAATTGGAATGGTGATATTTATAATGCGCTATTGGATTGCCGAAACGCTAT                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD136551             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTAATGAAAGCCAAGGCGTATGCTGTTGCAGTTCATAAATATAATCAACTTATTCAACAGCATCCTTTCTGTCCTCAACTGTATACAGGTCGCGCTACTGCTNTAATTAAAAGAAATTGGAATGGTGATATTTATAATGCGCTATTGGATTGCCGAAATGCTATCCAACTGACTACTCAAAGCAACAATGATTCTTTCAGCATTCAAAACAACGATACCATTAATGAGCACCAATTGTTAAACAGTTCCGTTTACCTTTCAGCTCTATTACTTTCAGTTCGATGTTTATTATATTTGGATTGGTTAAATGCTGCTCGTATTCAACTCAAACAAGCATTGAACAGCTTTCCCAATCTCTTCAAACATACTACGCATCA]




>consensus_5647#0
TTTCTACATATGATAGTGCTACACCACAGGAGGGCATACAAGCTGCATCAAGGAGAACTC
CTATAAACATTCCATCCAGCTCTCTGCCTTCATTTCCTTATGGTGCAGCTAAATATTTTG
TTCCATCTCATCTACCTGGTAAAATATTAACTGATGGTTTAGACAATCAAACTTTCAGTG
TAACATCAGTCAGTTTTAGTTCAGATGGTGAAGAGCTATTAGCTAATGTTGGACGTGATA
ATATTTATCTGTTTCATTTAGCTTCACAAAATGAACCATTTCAATGTCAATTATCGTTTA
AATCAACTAGATTATTGTATAGTTTATCGGCATCGCAACCAAGGAATCGATTTCGTTCTT
TTCGTATTCCTACCTGGTTTCGTCCTTCAAATATGGGATATTATGATTCTTATTCGGGTT
CAACCTATGATTACCGTTGTAATTCTTCTATGGATTCTGATTACGCAACCGTACTGGCTT
CACGATTAATTGAAGCCAAGGCGTATGCTGTTGCAGTTCATAAATATAATCAACTTATTC
AACAGCATCCTTTCTGTCCTCAACTGTATACAGGTCGCGCTACTGCTTTAATTAAAAGAA
ATTGGAATGGTGATATTTATAATGCGCTATTGGATTGCCGAAACGCTATCCAACTGACTA
CTCAAAGCAACAATGATTCTTTCAGCATTCAAAACAACGATACCATTAATGAGCACCAAT
TGTTAAACAGTTCCGTTTACCTTTCAGCTCTATTACTTTCAGTTCGATGTTTATTATATT
TGGATTGGTTAAATGCTGCTCGTATTCAACTCAAACAAGCATTGAACAGCTTTCCCAATC
TCTTCAAACATACTACGCATCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case