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Schistosoma mansoni
cluster # 5692 cluster # 5692       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5692#0 length = 990 sequences # 3  

consensusID : consensus_5692#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 990
fasta sequence
                              [CAAATATTATAATATTTCGAAACATCATTGTTGTGAAACATTTAAGATAAAAAGTTTATCTTATCGAGTCTGTCCACATTAGTGTACAATCTGGATAGGTTTTCAAACTATTTGATATGCCAGAAACTATTGATCTACCATTCGTTAGAGATTGCGAAACAAAGATTGTGAGATTAAATATATAGTCAGATTCATTAGGGTTTACAAACAAGTCAAATCAAGAAGAAATTTAACTAATTATTAATCAACAAAGAAAAAATTTTTTTCAAAGATGTCGTTAAATGTCCAAAGGTACACAAAAAACAAAACTTCTAAGCCATAACTATCAAAATAAATTCCTTTTTCTGGTAAATTATAATACTGGTAAGATAAGAACAGATTGAAAAAATACAAACATCTGTCAGAATTGTTTAAAAATAAATCTAACATCAATTGGTATTTACAAGGACTGTTTACAGATTGAAGGTAACTTTACGTGAAAGGATTTATACTACTATCTATATTAGCAAGTAGTTGAACATTGTGTGATGAAGTTTCTTGAAATTTGATGTTTTCTGTCACAAGTTTAGACCATAAAACAGGATCAGACTGTAGAGTTTCAACTGTATCAAATAATTCGACAGTATAATGATCACTTGATAATATTTGTCCAGTAGGTTTATAGAACAAATCCAATTTTGGCGCATCATATTTTGCACCACTTTTTATATCATAATCACTTAACATTAATTCTGGTAGTAGCTCACTTTCAGACTCGGCATTCACACTTAAAAAGATTGAAATCTTCGGTAACCATAATAACGTTTTATGACGAATAATGTTTACCAGACCTTCAGTGAATGTATTTAATGGAACCAATTGTTCAAAATGCAATGGACTTTCATGAATATTCATACAATTTAAGCAATTGAACTTGCAAATAACCGACCCTCTATCTGATTTTGCTATTCTTTCAATA-GTAATCCTTTTAGAGTTCCATCTTCACCTCGT]

[+] EMBL CD076970             [CAAATATTATAATATTTCGAAACATCATTGTTGTGAAACATTTAAGATAAAAAGTTTATCTTATCGAGTCTGTCCACATTAGTGTACAATCTGGATAGGTTTTCAAACTATTTGATATGCCAGAAACTATTGATCTACCATTCGTTAGAGATTGCGAAACAAAGATTGTGAGATTAAATATATAGTCAGATTCATTAGGGTTTACAAACAAGTCAAATCAAGAAGAAATTTAACTAATTATTAATCAACAAAGAAAAAATTTTTTTCAAAGATGTCGTTAAATGTCCAAAGGTACACAAAAAACAAAACTTCTAAGCCATAACTATCAAAATAAATTCCTTTTTCTGGTAAATTATAATACTGGTAAGATAAGAACAGATTGAAAAAATACAAACATCTGTCAGAATTGTTTAAAAATAAATCTAACATCAATTGGTATTTACAAGGACTGTTTACAGATTGAAGGTAACTTTACGTGAAAGGATTTATACTACTATCTATATTAGCAAGTAGTTGAACATTGTGTGATGAAGTTTCTTGAAATTTGATGTTTTCTGTCACAAGTTTAGACCATAAAACAGGATCAGACTGTAGAGTTTCAACTGTATCAAATAATTCGACAGTATAATGATCACTTGATAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD084326             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTACGTGAAAGGATTTATACTACTATCTATATTAGCAAGTAGTTGAACATTGTGTGATGAAGTTTCTTGAAATTTGATGTTTTCTGTCACAAGTTTAGACCATAAAACAGGATCAGACTGTAGAGTTTCAACTGTATCAAATAATTCGACAGTATAATGATCACTTGATAATATTTGTCCAGTAGGTTTATAGAACAAATCCAATTTTGGCGCATCATATTTTGCACCACTTTTTATATCATAATCACTTAACATTAATTCTGGTAGTAGCTCACTTTCAGACTCGGCATTCACACTTAAAAAGATTGAAATCTTCGGTAACCATAATAACGTTTTATGACGAATAATGTTTACCAGACCTTCAGTGAATGTATTTAATGGAACCAATTGTTCAAAATGCAATGGACTTTCATGAATATTCATACAATTTAAGCAATTGAACTTGCAAATAACCGACCCTCTATCTGATTTTGCTATTCTTTCAATA GTAATCCTTTTAGAGTTCCATCTTCACCTCGT]
[-] EMBL CD084281             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGTAGTTGAACATTGTGTGATGAAGTTTCTTGAAATTTGATGTTTTCTGTCACAAGTTTAGACCATAAAACAGGATCAGACTGTAGAGTTTCAACTGTATCAAATAATTCGACAGTATAATGATCACTTGATAATATTTGTCCAGTAGGTTTATAGAACAAATCCAATTTTGGCGCATCATATTTTGCACCACTTTTTATATCATAATCACTTAACATTAATTCTGGTAGTAGCTCACTTTCAGACTCGGCATTCACACTTAAAAAGATTGAAATCTTCGGTAACCATAATAACGTTTTATGACGAATAATGTTTACCAGACCTTCAGTGAATGTATTTAATGGAACCAATTGTTCAAAATGCAATGGACTTTCATGAATATTCATACAATTTAAGCAATTGAACTTGCAAATAACCGACCCTCTATCTGATTTTGCTATTCTTTCAATATTTAATCCTTTTAGAGTTCCATCTTCA      ]


>consensus_5692#0 CAAATATTATAATATTTCGAAACATCATTGTTGTGAAACATTTAAGATAAAAAGTTTATC TTATCGAGTCTGTCCACATTAGTGTACAATCTGGATAGGTTTTCAAACTATTTGATATGC CAGAAACTATTGATCTACCATTCGTTAGAGATTGCGAAACAAAGATTGTGAGATTAAATA TATAGTCAGATTCATTAGGGTTTACAAACAAGTCAAATCAAGAAGAAATTTAACTAATTA TTAATCAACAAAGAAAAAATTTTTTTCAAAGATGTCGTTAAATGTCCAAAGGTACACAAA AAACAAAACTTCTAAGCCATAACTATCAAAATAAATTCCTTTTTCTGGTAAATTATAATA CTGGTAAGATAAGAACAGATTGAAAAAATACAAACATCTGTCAGAATTGTTTAAAAATAA ATCTAACATCAATTGGTATTTACAAGGACTGTTTACAGATTGAAGGTAACTTTACGTGAA AGGATTTATACTACTATCTATATTAGCAAGTAGTTGAACATTGTGTGATGAAGTTTCTTG AAATTTGATGTTTTCTGTCACAAGTTTAGACCATAAAACAGGATCAGACTGTAGAGTTTC AACTGTATCAAATAATTCGACAGTATAATGATCACTTGATAATATTTGTCCAGTAGGTTT ATAGAACAAATCCAATTTTGGCGCATCATATTTTGCACCACTTTTTATATCATAATCACT TAACATTAATTCTGGTAGTAGCTCACTTTCAGACTCGGCATTCACACTTAAAAAGATTGA AATCTTCGGTAACCATAATAACGTTTTATGACGAATAATGTTTACCAGACCTTCAGTGAA TGTATTTAATGGAACCAATTGTTCAAAATGCAATGGACTTTCATGAATATTCATACAATT TAAGCAATTGAACTTGCAAATAACCGACCCTCTATCTGATTTTGCTATTCTTTCAATAGT AATCCTTTTAGAGTTCCATCTTCACCTCGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)