cluster # 5708

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Schistosoma mansoni
cluster # 5708 cluster # 5708 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5708#0 length = 726 sequences # 3

consensusID : consensus_5708#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 726
fasta sequence

                              [CAATTTTCGGCACGAGGCGCTGTTTTGTTAAAATGAATTACGGTAATCTAAAAAATTCTGCAGCAATTTTAGAAAAAAACTTAACAAAACTACGTGGTGAGGTTAATATAGCATCTTTTGCTTATCTATTTGTGGAACTAGTCAAATATTCAATGCGTAATGTATCTAGTATGGATCTTGTACAGAAAAGATTATCAGATTTTGGCAAATTTATTGGTGAACGTATTATTGATATTGTCTATTTAAGAGATAAACCAAATAAACGTGATATACGTTTATATAATGCATTAATTTTTTTAAAAATTAATTTATGGAAAAATTTATTTAATAAAGAAGCTGATGAATTAGAAAGGGATGGTGTAGATGAAAATATTTTTTATATGATTGAACATGAACCTGTGATGAATCGTTTTATACAATTTAATTATGAAGATAAAGATGAAAAACGTAAAACATCTGCTCCATTGAATGTTGCAGCGTTTAACGCTGGAATTGTTGAAGCATTCTTGTCAGGTATTGGTTATCCTTGTACAGTTACAGCAACCTGGTACAAGGGGACTGCTTATGTGATTAAATTTGAAGAGTCCGTGAATATTCGTGAAAGACAATTGGACNAACGGTGAATATAGTTGGCGGCAGGCGAAGTTCCATAAAATACTCATCATAGTTTGATGAATGTCTCAACTTTTCTGTGATTTTTCATATTCTGTATATTTAATAAATACA]

[+] EMBL CD083285             [CAATTTTCGGCACGAGGCGCTGTTTTGTTAAAATGAATTACGGTAATCTAAAAAATTCTGCAGCAATTTTAGAAAAAAACTTAACAAAACTACGTGGTGAGGTTAATATAGCATCTTTTGCTTATCTATTTGTGGAACTAGTCAAATATTCAATGCGTAATGTATCTAGTATGGATCTTGTACAGAAAAGATTATCAGATTTTGGCAAATTTATTGGTGAACGTATTATTGATATTGTCTATTTAAGAGATAAACCAAATAAACGTGATATACGTTTATATAATGCATTAATTTTTTTAAAAATTAATTTATGGAAAAATTTATTTAATAAAGAAGCTGATGAATTAGAAAGGGATGGTGTAGATGAAAATATTTTTTATATGATTGAACATGAACCTGTGATGAATCGTTTTATACAATTTAATTATGAAGATAAAGATGAAAAACGTAAAACATCTGCTCCATTGAATGTTGCAGCGTTTAACGCTGGAATTGTTGAAGCATTCTTGTCAGGTATTGGTTATCCTTGTACAGTTACAGCAACCTGGTACAAGGGGACTGCTTATGTGATTAAATTTGAAGAGTCCGTGAATATTCGTGAAAGACAATTGGACNAA                                                                                                             ]
[-] EMBL CD076856             [                                                                                                                                                                                                                                ATTATTGATATTGTCTATTTAAGAGATAAACCAAATAAACGTGATATACGTTTATATAATGCATTAATTTTTTTAAAAATTAATTTATGGAAAAATTTATTTAATAAAAAAGCTGATGAATTAGAAAGGGATGGTGTAGATGAAAATATTTTTTATATGATTGAACATGAACCTGTGATGAATCGTTTTATCCAATTTAATTATGAAGATAAAGATGAAAAACGTAAAACATTTGCTCCATTGAATGTTGCAGCGTTTAACGCTGGAATTGTTGAAGCATTCTTGTCAGGTATTGGTTATCCTTGTACAGTTACAGCAACCTGGTACAAGGGGACTGCTTATGTGATTAAATTTGAAGAGTCCGTGAATATTTGTGAAAGACAATTGGCCAATCGGTGAATATAGTTGGCGGCAGGCGAAGTTCCATAAAATACTCATCATAGTTTGATGAATGTCTCAACTTTTCTGTGATTTTTCATATTCTGTATATTTAATAAATACA]
[-] EMBL CD196156             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taTTATGGGAAAAATTATTNAATAAAGAAGCTGATGAATTAGAAAGGGATGGTGTAGATGAAAATATTTNTTATATGATTGAACATGAACCTGTGATGAATCGTTTTATACAATTTAATTATGAAGATAAAGATGAAAAACGTAAAACATCTGCTCCATTGAATGTTGCAGCGTTTAACGCTGGAATTGTTGAAGCATTCTTGTCAGGTATTGGTTATCCTTGTACAGTTACAGCAACCTGGTACAAGGGGACTGCTTATGTGATTAAATTTGAAGAGTCCGTGAATATTCGTGAAAGACAATTG                                                                                                                   ]




>consensus_5708#0
CAATTTTCGGCACGAGGCGCTGTTTTGTTAAAATGAATTACGGTAATCTAAAAAATTCTG
CAGCAATTTTAGAAAAAAACTTAACAAAACTACGTGGTGAGGTTAATATAGCATCTTTTG
CTTATCTATTTGTGGAACTAGTCAAATATTCAATGCGTAATGTATCTAGTATGGATCTTG
TACAGAAAAGATTATCAGATTTTGGCAAATTTATTGGTGAACGTATTATTGATATTGTCT
ATTTAAGAGATAAACCAAATAAACGTGATATACGTTTATATAATGCATTAATTTTTTTAA
AAATTAATTTATGGAAAAATTTATTTAATAAAGAAGCTGATGAATTAGAAAGGGATGGTG
TAGATGAAAATATTTTTTATATGATTGAACATGAACCTGTGATGAATCGTTTTATACAAT
TTAATTATGAAGATAAAGATGAAAAACGTAAAACATCTGCTCCATTGAATGTTGCAGCGT
TTAACGCTGGAATTGTTGAAGCATTCTTGTCAGGTATTGGTTATCCTTGTACAGTTACAG
CAACCTGGTACAAGGGGACTGCTTATGTGATTAAATTTGAAGAGTCCGTGAATATTCGTG
AAAGACAATTGGACNAACGGTGAATATAGTTGGCGGCAGGCGAAGTTCCATAAAATACTC
ATCATAGTTTGATGAATGTCTCAACTTTTCTGTGATTTTTCATATTCTGTATATTTAATA
AATACA

clustalw multiple alignements is not computed in this case