cluster # 5715

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Schistosoma mansoni
cluster # 5715 cluster # 5715 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5715#0 length = 629 sequences # 3

consensusID : consensus_5715#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 629
fasta sequence

                              [AAGATTCGGCACGAGGCGATCAGCTACTCTTGGATTTTGGTTCACAGATTTACTTGACAGGAATGCCCAATTTAGTAATTGGCTTTTCGAAGGTCGTCCAATTTGCTATTGGATGACAGGATTTTTTAATCCTCAAGGTTTCCTCACTGCTATGAGACAAGAAGTGGCCAGAGCAAATAAATATGCCCTAGATGATGTAGCTTTAACAAACGATGTGACGAAATTAATGCGTGAAGAATTAACTAAAGGTCCAACTGAAGGTGTTTACATTCATGGTCTTAGTTTAGATGGAGCTGGTTGGGATCGTAAACAGGCTAGACTAATGGAGCCGCTACCAAAACTATTGTACACTCCACTCCCAGTAGTACATGTATCTGCATTTTCTCAGTCAATCGGTGAGAAAAGTAAACCTGGAATATTTTATTCATGTCCAGTTTACAAAAAGCCTAAACGTACTGACTTGAATTACATATTTCCTTTAATGCTTCGTAGTGCAGTAGATGCAGACCATTGGATTTTAAGAGGAGTTGCTCTATTAGGTGATGTCAAATAGGTAATAATAGTCTATTTCTATTTATTTGAATAATTTTTTTTT--AAATTCGTATATTACCAAACAAATATAATCTTCA]

[+] EMBL CD083259             [AAGATTCGGCACGAGGCGATCAGCTACTCTTGGATTTTGGTTCACAGATTTACTTGACAGGAATGCCCAATTTAGTAATTGGCTTTTCGAAGGTCGTCCAATTTGCTATTGGATGACAGGATTTTTTAATCCTCAAGGTTTCCTCACTGCTATGAGACAAGAAGTGGCCAGAGCAAATAAATATGCCCTAGATGATGTAGCTTTAACAAACGATGTGACGAAATTAATGCGTGAAGAATTAACTAAAGGTCCAACTGAAGGTGTTTACATTCATGGTCTTAGTTTAGATGGAGCTGGTTGGGATCGTAAACAGGCTAGACTAATGGAGCCGCTACCAAAACTATTGTACACTCCACTCCCAGTAGTACATGTATCTGCATTTTCTCAGTCAATCGGTGAGAAAAGTAAACCTGGAATATTTTATTCATGTCCAGTTTACAAAAAGCCTAAACGTACTGACTTGAATTACATATTTCCTTTAATGCTTCGTAGTGCAGTAGATGCAGACCATTGGATTTTAAGAGGAGTTGCTCTATTAGGTGATGTCAAATAGGTAATAATAGTCTATTTCTATTTATTTGAATAATTTTTTTTT  AAATTCGTATATTACCAAACANATATAATCT   ]
[-] EMBL CD076829             [                 aATCAGCTACTCTTGGATTNTGGTTCACAGATTTACTTGACAGGAATGCCCAATTTAGTAATTGGCTTTTCGAAGGTCGTCCAATTTGCTATTGGATGACAGGATTTTTTAATCCTCAAGGTTTCCTCACTGCTATGAGACAAGAAGTGGCCAGAGCAAATAAATATGCCCTAGATGATGTAGCTTTAACAAACGATGTGACGAAATTAATGCGTGAAGAATTAACTAAAGGTCCAACTGAAGGTGTTTACATTCATGGTCTTAGTTTAGATGGAGCTGGTTGGGATCGTAAACAGGCTAGACTAATGGAGCCGCTACCAAAACTATTGTACACTCCACTCCCAGTAGTACATGTATCTGCATTTTCTCAGTCAATCGGTGAGAAAAGTAAACCTGGAATATTTTATTCATGTCCAGTTTACAAAAAGCCTAAACGTACTGACTTGAATTACATATTTCCTTTAATGCTTCGTAGTGCAGTAGATGCAGACCATTGGATTTTAAGAGGAGTTGCTCTATTAGGTGATGTCAAATAGGTAATAATAGTCTATTTCTATTTATTTGAATAATTTTTTTTT  AAATTCGTATATTACCAAACAAATATAATCTT  ]
[-] EMBL CD087291             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CCCAGTAGTACATGTATCTGCATTTTCTCAGTCAATCGGTGAGAAAAGTAAACCTGGAATATTTTATTCATGTCCAGTTAACAAAAAGCCTAAACGTACTGACTTGAATTACATATTTCCTTTAATGCTTCGTAGTGCGGTAGATGCAGACCATTGGATTTTAAGAGGAGTTGCTCTATTAGGTGATGTCAAATAGGTAATAATAGTCTATTTCTATTTATTTGAATAATTTTTTTTTTAAAATTCGTATATTACCAAACAAATATAATCTTCA]




>consensus_5715#0
AAGATTCGGCACGAGGCGATCAGCTACTCTTGGATTTTGGTTCACAGATTTACTTGACAG
GAATGCCCAATTTAGTAATTGGCTTTTCGAAGGTCGTCCAATTTGCTATTGGATGACAGG
ATTTTTTAATCCTCAAGGTTTCCTCACTGCTATGAGACAAGAAGTGGCCAGAGCAAATAA
ATATGCCCTAGATGATGTAGCTTTAACAAACGATGTGACGAAATTAATGCGTGAAGAATT
AACTAAAGGTCCAACTGAAGGTGTTTACATTCATGGTCTTAGTTTAGATGGAGCTGGTTG
GGATCGTAAACAGGCTAGACTAATGGAGCCGCTACCAAAACTATTGTACACTCCACTCCC
AGTAGTACATGTATCTGCATTTTCTCAGTCAATCGGTGAGAAAAGTAAACCTGGAATATT
TTATTCATGTCCAGTTTACAAAAAGCCTAAACGTACTGACTTGAATTACATATTTCCTTT
AATGCTTCGTAGTGCAGTAGATGCAGACCATTGGATTTTAAGAGGAGTTGCTCTATTAGG
TGATGTCAAATAGGTAATAATAGTCTATTTCTATTTATTTGAATAATTTTTTTTTAAATT
CGTATATTACCAAACAAATATAATCTTCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case