cluster # 5741

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Schistosoma mansoni
cluster # 5741 cluster # 5741 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5741#0 length = 489 sequences # 3

consensusID : consensus_5741#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 489
fasta sequence

                              [GGTTGGGTTGACGAGTGTATATAATCTAATAATGGGGAATTCAAATCTTTCTCATGTTCTTTGTGAATTGTTTTCACTGAATTTATACTGTTTTGAGCGTCGTTTATAGACTGTGTCTGTTTATTTAAGTGATTTTCTATTGATTGTTTATCAGCTGTCATCAATAGACTTTCAGTATTTTGACCAACATTATTTTGATTATGATTCGCTGGTGTCATTGTCGTATTCACTGTCGTTGTTGCCGTCGTCGTTGTTGTATTAGTGGTTATTCCTGTATTCATTATTTTATTCGATTGTATAGATGTGGTGGAATTGGTTAGAATTGAATTAGAATCTGTAGTTACAATCGAAGATGTAGAACGTGAAGGAATTAAACATAATGATGATGTTGATGAAACAACGTTAGGATTTACTGTTGATGGATGATTGGTTTGATCAAAAACTGATGGAACTTCAGTGAGCACCGGTAACAGTCCAATACTGCTATTA]

[+] EMBL AI975587             [   TGGGTTGACGAGTGTATATAATCTAATAATGGGGAATTCAAATCTTTCTCATGTTCTTTGTGAATTGGTTTCACTGAATTTATACTGTTTTGAGCGTCGTTTATAGACTGTGTCTGTTTATTTAAGTGATTTTCTATTGATTGTTTATCAGCTGTCATCAATAGACTTTCAGTATTTTGACCAACATTATTTTGATTATGATTCGCTGGTGTCATTGTCGTATTCACTGTCGTTGTTGCCGTCGACGATGGTGTATTAGAGGCTATTCCTGTATTCATTATTTTATTCGATTGTATAGATGTGGTGGAATTGGTTAGAATTGAATTAGAATCTGTAGTTACAATCCAAGATGTAGAACGTGAAGGAATTAAACATAATGATGATGTTGATGAAACAACGCTAGGATTTACTGTTGATGGATGATTGGTTTGATCAAAAACTGATGGAACTTCAGTGAGCACCGGTAACAGTCCAATACTGCTATTA]
[+] EMBL BF936089             [   TGGGTTGACGAGTGTATATAATCTAATAATGGGGAATTCAAATCTTTCTCATGTTCTTTGTGAATTGTTTTCACTGAATTTATACTGTTTTGAGCGTCGTTTATAGACTGTGTCTGTTTATTTAAGTGATTTTCTATTGATTGTTTATCAGCTGTCATCAATAGACTTTCAGTATTTTGACCAACATTATTTTGATTATGATTCGCTGGTGTCATTGTCGTATTCACTGTCGTTGTTGCCGTCGTCGTTGTTGTATTAGTGGTTATTCCTGTATTCATTATTTTATTCGATTGTATAGATGTGGTGGAATTGGTTAGAATTGAATTAGAATCTGTAGTTACAATCGAAGATGTAGAACGTGAAGGAATTAAACATAATGATGATGTTGATGAAACAACGTTAGGATTTACTGTTGATGGAT                                                                 ]
[-] EMBL CD178892             [ggtgaattaGACGAGTGTATATAATCTAATAATGGGGAATTCAAATCTTTCTCATGTTCTTTGTGAATTGTTTTCACTGAATTTATACTGTTTTGAGCGTCGTTTATAGACTGTGT   TTTATTTAAGTGATTTTCTATTGATTGTTTATCAGCTGTCATCAATAGACTTTCAGTATTTTGACCAACATTATTTTGATTATGATTCGCTGGTGTCATTGTCGTATTCACTGTCGTTGTTGCCGTCGTCGTTGTTGTATTAGTGGTTATTCCTGTATTCATTATTTTATTCGATTGTATAGATGTGGTGGAATTGGTTAGAATTGAATTAGAATCTGTAGTTACAATCGAAGATGTAGAACGTGAAGGAATTAAACATAATGATGATGTTGATGAAACAACGTTAGGATTTACTGTTGATGGATGATTGGTTTGATCAAAAAC                                              ]




>consensus_5741#0
GGTTGGGTTGACGAGTGTATATAATCTAATAATGGGGAATTCAAATCTTTCTCATGTTCT
TTGTGAATTGTTTTCACTGAATTTATACTGTTTTGAGCGTCGTTTATAGACTGTGTCTGT
TTATTTAAGTGATTTTCTATTGATTGTTTATCAGCTGTCATCAATAGACTTTCAGTATTT
TGACCAACATTATTTTGATTATGATTCGCTGGTGTCATTGTCGTATTCACTGTCGTTGTT
GCCGTCGTCGTTGTTGTATTAGTGGTTATTCCTGTATTCATTATTTTATTCGATTGTATA
GATGTGGTGGAATTGGTTAGAATTGAATTAGAATCTGTAGTTACAATCGAAGATGTAGAA
CGTGAAGGAATTAAACATAATGATGATGTTGATGAAACAACGTTAGGATTTACTGTTGAT
GGATGATTGGTTTGATCAAAAACTGATGGAACTTCAGTGAGCACCGGTAACAGTCCAATA
CTGCTATTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case