Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5788 cluster # 5788       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5788#0 length = 894 sequences # 3  
consensusID : consensus_5788#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 894
fasta sequence 
                              [CCTCCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGAATATTAATCAAAATAATGAGGATACAGAAATTACTCTTAAAAATATAGCTGATAAAGTGAAAACATATTCGAGTAATCATAAGACGAATCCAGTATTTATAAATTTTGGTCGTACTTCATGGGGATTGATGAAATTCCTATGGGACTGTAGTGTCTAGTACTATGTCAAGCACACATGGGTCATTCCATATTTCGGACAGACTAATATACTATTCTTCTTGTGTCACATTTTGACCTTGGCAGTTATTCGCTTATTAACCTTGACTGTTTTCATCTGAGGGTATTTTAGAGATGAAGAAAATCAGAGGACTGCTTCGTATGGTGGAGATGAAAATACTTTTAAAAATCAATTAAATTTAAAAACTAATGCTGGAGAATATAGTAGTTTTTGTGCTGAGGTTGATAACGATACAAGTGATAACGATGATATTGATGATGATGATGATGATTCAATTAATGATAATCAAACTGAAAATGCTGAAGATATCGTTGAGAATGATAATTCATTTTATCAAAGTAGTAATGGAAATACTATGAAACGTAGATTTTCAAGAAATCAACTCAAACCTGAATGGTCTCCTGGTCGTCAGCGTATTCCAGGTACCAGTTATCATGGTAGAACTCAAAGTTCGAACAACAGTGATGATTTTCAAGTAAATGAAGGAAGCTATCGGTCTACAAACATGGATGAATCACTGTTAACAAAACGGTCACAGAAAGATTATTATCCAACAGCAAGTGCTGAGAATGAAAAGCAAACATATTTGAAGCATACACTTCAATCTGAGGAGAATGAACATGATGATTTTTGAGTGAATTATTAACGTGCTAGTGATTTATTTATTTCTACAAAATGTATAATAAAA]

[+] EMBL CD080380             [CCTCCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGAATATTAATCAAAATAATGAGGATACAGAAATTACTCTTAAAAATATAGCTGATAAAGTGAAAACATATTCGAGTAATCATAAGACGAATCCAGTATTTATAAATTTTGGTCGTACTTCATGGGGATTGATGAAATTCCTATGGGACTGTAGTGTCTAGTACTATGTCAAGCACACATGGGTCATTCCATATTTCGGACAGACTAATATACTATTCTTCTTGTGTCACATTTTGACCTTGGCAGTTATTCGCTTATTAACCTTGACTGTTTTCATCTGAGGGTATTTTAGAGATGAAGAAAATCAGAGGACTGCTTCGTATGGTGGAGATGAAAATACTTTTAAAAATCAATTAAATTTAAAAACTAATGCTGGAGAATATAGTAGTTTTTGTGCTGAGGTTGATAACGATACAAGTGATAACGATGATATTGATGATGATGATGATGATTCAATTAATGATAATCAAACTGAAAATGCTGAAGATATCGTTGAGAATGATAATTCATTTTATCAAAGTAGTAATGGAAATACTATGAAACGTAGATTTTCAAGAAATCAACTCAAACCTGAATGGTCTCCTGGTCGTCAGCGTATTCCAGGTACCAGTTATCATGGTAGAACTCANAGTTCGAACAACAGTGATGATTNTCAAGTAAATGAAGGAAGCTATCGGTCTAC AACATGGATGAATCACTGTTAACANAACGGTCACAGAA                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD074476             [                                                                                                                                                                                              ATGTCAAGCACACATGGGTCA TCCATA TTCGGACAGACTAATATACTATTCTTCTTGTGTCACATTTTGACCTTGGCAGTTATTCGCTTATTAACCTTGACTGTTTTCATCTGAGGGTATTTTAGAGATGAAGAAAATCAGAGGACTGCTTCGTATGGTGGAGATGAAAATACTTTTAAAAATCAATTAAATTTAAAAACTAATGCTGGAGAATATAGTAGTTTTTGTGCTGAGGTTGATAACGATACAAGTGATAACGATGATATTGATGATGATGATGATGATTCAATTAATGATAATCAAACTGAAAATGCTGAAGATATCGTTGAGAATGATAATTCATTTTATCAAAGTAGTAATGGAAATACTATGAAACGTAGATTTTCAAGAAATCAACTCAAACCTGAATGGTCTCCTGGTCGTCAGCGTATTCCAGGTACCAGTTATCATGGTAGAACTCAAAGTTCGAACAACAGTGATGATTTTCAAGTAAATGAAGGAAGCTATCGGTCTACAAACATGGATGAATCACTGTTAACAAAACGGTCACAGAAAGATTATTATCCAACAGCAAGTGCTGAGAATGAAAAGCAAACATATTTGAAGCATACACTTCAATCTGAGGAGAATGAACATGATGATTTTTGAGTGAATTATTAACGTGCTAGTGATTTATTTATTTCTACAAAATGTATAATAAAA]
[-] EMBL CD074296             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTTCGTATGGTGGAGATGAAAATACTTTTAAAAATCAATTAAATTTAAAAACTAATGCTGGAGAATATAGTAGTTTTTGTGCTGAGGTTGATAACGATACAAGTGATAACGATGATATTGATGATGATGATGATGATTCAATTAATGATAATCAAACTGAAAATGCTGAAGATATCGTTGAGAATGATAATTCATTTTATCAAAGTAGTAATGGAAATACTATGAAACGTAGATTTTCAAGAAATCAACTCAAACCTGAATGGTCTCCTGGTCGTCAGCGTATTCCAGGTACCAGTTATCATGGTAGAACTCAAAGTTCGAACAACAGTGATGATTTTCAAGTAAATGAAGGAAGCTATCGGTCTACAAACATGGATGAATCACTGTTAACAAAACGGTCACAGAAAGATTATTATCCAACAGCAAGTGCTGAGAATGAAAAGCAAACATATTTGAAGCATACACTTCAATCTGAGGAGAATGAACATGATGATTTTTGAGTGAATTATTAACGTGCTAGTGATTTATTTATTTCTACAAAATGTATAATAAAA]




>consensus_5788#0
CCTCCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGAATATTAATCAAAATAATGAGGATACAGAAATT
ACTCTTAAAAATATAGCTGATAAAGTGAAAACATATTCGAGTAATCATAAGACGAATCCA
GTATTTATAAATTTTGGTCGTACTTCATGGGGATTGATGAAATTCCTATGGGACTGTAGT
GTCTAGTACTATGTCAAGCACACATGGGTCATTCCATATTTCGGACAGACTAATATACTA
TTCTTCTTGTGTCACATTTTGACCTTGGCAGTTATTCGCTTATTAACCTTGACTGTTTTC
ATCTGAGGGTATTTTAGAGATGAAGAAAATCAGAGGACTGCTTCGTATGGTGGAGATGAA
AATACTTTTAAAAATCAATTAAATTTAAAAACTAATGCTGGAGAATATAGTAGTTTTTGT
GCTGAGGTTGATAACGATACAAGTGATAACGATGATATTGATGATGATGATGATGATTCA
ATTAATGATAATCAAACTGAAAATGCTGAAGATATCGTTGAGAATGATAATTCATTTTAT
CAAAGTAGTAATGGAAATACTATGAAACGTAGATTTTCAAGAAATCAACTCAAACCTGAA
TGGTCTCCTGGTCGTCAGCGTATTCCAGGTACCAGTTATCATGGTAGAACTCAAAGTTCG
AACAACAGTGATGATTTTCAAGTAAATGAAGGAAGCTATCGGTCTACAAACATGGATGAA
TCACTGTTAACAAAACGGTCACAGAAAGATTATTATCCAACAGCAAGTGCTGAGAATGAA
AAGCAAACATATTTGAAGCATACACTTCAATCTGAGGAGAATGAACATGATGATTTTTGA
GTGAATTATTAACGTGCTAGTGATTTATTTATTTCTACAAAATGTATAATAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)