cluster # 5790

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Schistosoma mansoni
cluster # 5790 cluster # 5790 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5790#0 length = 603 sequences # 3

consensusID : consensus_5790#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 603
fasta sequence

                              [ATGCATTCAATACAAATTAGTTACACATACTACAAATGTCTTAAATTTGTCAATGCTTGGAGCGAGAACTACGGTACGGGGTAATTGGTCTAATTGAAGTTTTCATTCGTCTATAAGCTATCGGTTTAACATATGATACGCAGATTAGAACTGTTTCCAGTTTACGCAGCTATGACATATTGACAACGGCCTCAAATCACAACAAAAACGACATATTAATTGTGATTCATTTCCTCTTTTCCCAGTTACATAGCTTACATTTATCAAACGCAAAAATAAAATATGGACTGTGGCTGTGATAAATTACTATTGTACTTGAGTCACATATGTATTGTCAAATGTATCCTTTGTGTAGTGAATTCCAACTTATCAGTTAGTCATAATCAACTTTGAGGATGGTACAAATATGTGTTAGTCGAATTTGCTGTACTCTATCAGTACAACAAAATGACAAGTGGCGAGGTCAAAACAATGATAATGAAAAAGACTAAACATTGAGAATACGGAATGAAAAAAAGTATGTAAAAGAATATTGGGACTCAAGATCTACAGGGAGCGATAGTATGACCTATGAGCAACGTTATCTAATGTCTCCAATCGCTA]

[+] EMBL CD147059             [ATGCATTCAATACAAATTAGTTACACATACTACAAATGTCTTAAATTTGTCAATGCTTGGAGCGAGAACTACGGTACGGGGTAATTGGTCTAATTGAAGTTTTCATTCGTCTATAAGCTATCGGTTTAACATATGATACGCAGATTAGAACTGTTTCCAGTTTACGCAGCTATGACATATTGACAACGGCCTCAAATCACAACAAAAACGACATATTAATTGTGATTCATTTCCTCTTTTCCCAGTTACATAGCTTACATTTATCAAACGCAAAAATAAAATATGGACTGTGGCTGTGATAAATTACTATTGTACTTGAGTCACATATGTATTGTCAAATGTATCCTTTGTGTAGTGAATTCCAACTTATCA                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD147160             [                                                                                           AATTGAAGTTTTCATTCGTCTATAAGCTATCGGTTTAACATATGATACGCAGATTAGAACTGTTTCCAGTTTACGCAGCTATGACATATTGACAACGGCCTCAAATCACAACAAAAACGACATATTAATTGTGATTCATTTCCTCTTTTCCCAGTTACATAGCTTACATTTATCAAACGCAAAAATAAAATATGGACTGTGGCTGTGATAAATTACTATTGTACTTGAGTCACATATGTATTGGCAAATGTATCCTTTGTGTAGTGAATTCCAACTTATCAGTTAGTCATAATCAACTTTGAGGATGGTACAAATATGTGTTAGTCGAATTTGCTGTACTCTATCAGTACAACAAAATGACAAGTGGCGAGGTCAAAACAATGATAATGAAAAAGACTAAACATTGAGAATACGGAATGAAAAAAAGTATGTAAAAGAATATTGGGACTCAAGATCTACAGGGAGCGATAGTATGACCTATGAGCAACGTTATCTAATGTCTCCAATCGCT ]
[-] EMBL CD096348             [                                                                                            ATTGAAGTTTCCATTCGTCTATAAGCTATCGGTTTAACATATGATACGCAGATTAGAACTGTTTCCAGTTTACGCAGCTATGACATATTGACAACGGCCTCAAATCACAACAAAAACGACATATTAATTGTGATTCATTTCCTCTTTTCCCAGTTACATAGCTTACATTTATCAAACGCAAAAATAAAATATGGACTGTGGCTGTGATAAATTACTATTGTACTTGAGTCACATATGTATTGTCAAATGTATCCTTTGTGTAGTGAATTCCAACTTATCAGTTAGTCATAATCAACTTTGAGGATGGTACAAATATGTGTTAGTCGAATTTGCTGTACTCTATCAGTACAACAAAATGACAAGTGGCGAGGTCAAAACAATGATAATGAAAAAGACTAAACATTGAGAATACGGAATGAAAAAAAGTATGTAAAAGAATATTGGGACTCAAGATCTACAGGGAGCGATAGTATGACCTATGAGCAACGTTATCTAATGTCTCCAATCGCTA]




>consensus_5790#0
ATGCATTCAATACAAATTAGTTACACATACTACAAATGTCTTAAATTTGTCAATGCTTGG
AGCGAGAACTACGGTACGGGGTAATTGGTCTAATTGAAGTTTTCATTCGTCTATAAGCTA
TCGGTTTAACATATGATACGCAGATTAGAACTGTTTCCAGTTTACGCAGCTATGACATAT
TGACAACGGCCTCAAATCACAACAAAAACGACATATTAATTGTGATTCATTTCCTCTTTT
CCCAGTTACATAGCTTACATTTATCAAACGCAAAAATAAAATATGGACTGTGGCTGTGAT
AAATTACTATTGTACTTGAGTCACATATGTATTGTCAAATGTATCCTTTGTGTAGTGAAT
TCCAACTTATCAGTTAGTCATAATCAACTTTGAGGATGGTACAAATATGTGTTAGTCGAA
TTTGCTGTACTCTATCAGTACAACAAAATGACAAGTGGCGAGGTCAAAACAATGATAATG
AAAAAGACTAAACATTGAGAATACGGAATGAAAAAAAGTATGTAAAAGAATATTGGGACT
CAAGATCTACAGGGAGCGATAGTATGACCTATGAGCAACGTTATCTAATGTCTCCAATCG
CTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case