These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5811#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 850 fasta sequence [CCGAGGCCAAAATTCGGCACGAGGCTTTTTTCCATCCGACCTTGGAGTTCATTTCCTCCATCAGGGTGGTCAGTTGGTTTCCTGGGAATTTGTTTATGACATACCGGAGTCTCAATCTAGTCTTTAATATCCCCATCAATGGTGGGTGCGTAGCACTGGATGACATTCATTTCAATCCCTTCTTTATTTAGAAGAATCCTTTGGTGATCAATTAACCATAACGTTCCCATCGTATAAGTGCCTTTCTCGCTTCTTTGGCGAGGGTCATTGTAACTCCTTATGTATGGTGGGGTGCATTTTCTTCATGATCAGTGCAGAATAACGATTCTCCCTAAGCTATTCTCTCATTTCCAGCTTCTGTTCAATGTGTTTCACCTATTACAAGCGGAGCCATGTTGTATCTTCTAATTTCTGCCGGCTTTCGAACAACTCTCTCGGATTCTTACACTGTCCGGACATTCTATGTAGCTACATTAATTGTCGCTCTTGTTATCAGAAGAGGGGTTTTGGAGAATTTGATTGTCAAGGTTCTTCTTTACGGGATGTGGTTGCTAACCCCATCCCTAACCCTTCCTCCTCCGGGCTTGAAACTAGTTGTAACCCTAGTAGGGTTTTAAAAGGAGTTTAAATTTGACTACGGTGGCTGAGATGAACACTTCGGTAACAAAATGCTTCACTTATCCATAATGGGCAGAAGTGATGGCTCATGTGAAGTATCTTTCAACTCTTGTTCAACAAAAACACTGAACTATCTTTTATTGTGTTAACATTCCTTCAGGTTATACATTTATAAACCTCCATGTTTCAGACTGTGATCTTTCATACCTTAATAGTGTTATATATTACATGT] [+] EMBL CD080432 [CCGAGGCCAAAATTCGGCACGAGGCTTTTTTCCATCCGACCTTGGAGTTCATTTCCTCCATCAGGGTGGTCAGTTGGTTTCCTGGGAATTTGTTTATGACATACCGGAGTCTCAATCTAGTCTTTAATATCCCCATCAATGGTGGGTGCGTAGCACTGGATGACATTCATTTCAATCCCTTCTTTATTTAGAAGAATCCTTTGGTGATCAATTAACCATAACGTTCCCATCGTATAAGTGCCTTTCTCGCTTCTTTGGCGAGGGTCATTGTAACTCCTTATGTATGGTGGGGTGCATTTTCTTCATGATCAGTGCAGAATAACGATTCTCCCTAAGCTATTCTCTCATTTCCAGCTTCTGTTCAATGTGTTTCACCTATTACAAGCGGAGCCATGTTGTATCTTCTAATTTCTGCCGGCTTTCGAACAACTCTCTCGGATTCTTACACTGTCCGGACATTCTATGTAGCTACATTAATTGTCGCTCTTGTTATCAGAAGAGGGGTTTTGGAGAATTTGATTGTCAAGGTTCTTCTTTACGGGATGTGGTTGCTAACCCCATCCCTAACCCTTCCTCCTCCGGGCTTGAAACTAGTTGTAACCCTAGTAGGGTTTTAAAAGGAGTTTAAATTTGACTACGGTGGCTGAGATGAACACTTCGGTAACANAATGCTTCACTTATCCATAATGGGCAGAAGTGATGG ] [-] EMBL CD074524 [ AGAATCCTTTGGTGATCAATTAACCATAACGTTCCCATCGTATAAGTGCCTTTCTCGCTTCTTTGGCGAGGGTCATTGTAACTCCTTATGTATGGTGGGGTGCATTTTCTTCATGATCAGTGCAGAATAACGATTCTCCCTAAGCTATTCTCTCATTTCCAGCTTCTGTTCAATGTGTTTCACCTATTACAAGCGGAGCCATGTTGTATCTTCTAATTTCTGCCGGCTTTCGAACAACTCTCTCGGATTCTTACACTGTCCGGACATTCTATGTAGCTACATTAATTGTCGCTCTTGTTATCAGAAGAGGGGTTTTGGAGAATTTGATTGTCAAGGTTCTTCTTTACGGGATGTGGTTGCTAACCCCATCCCTAACCCTTCCTCCTCCGGGCTTGAAACTAGTTGTAACCCTAGTAGGGTTTTAAAAGGAGTTTAAATTTGACTACGGTGGCTGAGATGAACACTTCGGTAACAAAATGCTTCACTTATCCATAATGGGCAGAAGTGATGGCTCATGTGAAGTATCTTTCAACTCTTGTTCAACAAAAACACTGAACTATCTTTTATTGTGTTAACATTCCTTCAGGTTATACATTTATAAACCTCCATGTTTCAGACTGTGATCTTTCATACCTTAATAGTGTTATATATTACATGT] [-] EMBL CD074345 [ TGATCAATTAACCATAACGTTCCCATCGTATAAGTGCCTTTCTCGCTTCTTTGGCGAGGGTCATTGTAACTCCTTATGTATGGTGGGGTGCATTTTCTTCATGATCAGTGCAGAATAACGATTCTCCCTAAGCTATTCTCTCATTTCCAGCTTCTGTTCAATGTGTTTCACCTATTACAAGCGGAGCCATGTTGTATCTTCTAATTTCTGCCGGCTTTCGAACAACTCTCTCGGATTCTTACACTGTCCGGACATTCTATGTAGCTACATTAATTGTCGCTCTTGTTATCAGAAGAGGGGTTTTGGAGAATTTGATTGTCAAGGTTCTTCTTTACGGGATGTGGTTGCTAACCCCATCCCTAACCCTTCCTCCTCCGGGCTTGAAACTAGTTGTAACCCTAGTAGGGTTTTAAAAGGAGTTTAAATTTGACTACGGTGGCTGAGATGAACACTTCGGTAACAAAATGCTTCACTTATCCATAATGGGCAGAAGTGATGGCTCATGTGAAGTATCTTTCAACTCTTGTTCAACAAAAACACTGAACTATCTTTTATTGTGTTAACATTCCTTCAGGTTATACATTTATAAACCTCCATGTTTCAGACTGTGATCTTTCATACCTTAATAGTGTTATATATTACATGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||