These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5832#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 1085 fasta sequence [CGAGCCTTTAATTCGGCACCAGGCGCTTAACATGGGGTAATGATCTTTGCTGGGGTGGACGTCGTGTCATACATCTTTTCCTTCTTGGTAATGTCCCATCTAATAATGAACGTTTAAAATACATATTAAAAAATGAGTCCTATGTATATCATGATATAATTCAACAAGATTTTCTTGATCACTATTATAATAGTACATATAAAATTATGTTTGGTATTAATTGGGCAGTAAAATATTGTTCAAATGTCCCAATTATTATGTTTGTTGATGATGATTATTTTATCTATCCAAAAAAATGTGGTTGCTTATATTGAAGGTTTAAGCACCGAGCTACGTAAACTTTTGATCAGTGGTTATGTTTGGTATAATGCTGGACCAGTTCGTAAGAATATCGGCAGTCACGATAAGTGGTTGGTTGATGACAAAGAATATGCTCCGCGTTATTATCCTCCATATGTGGCAGGGGGTAATTTTTTTTTATCAATGAATTTGGCACGTCAATTAAATATAGCTATGCGTTACACAAAATATCTTCGGTTTGATGATGTCTACCTTGGAATAATACTTAAGAAGTTATTACATGTACCGATGCATTTAAAAAAAGTCTACACATTCCACCCTGTAAATTTAAATTCATCTGAGATATATGAAATGATTTCTAGTCATGGCTTTGGCAAATCTGTTTCACAATTCTTCTTATGGGACCGCTTAAAATGTTCAACATTNTGTGTACACTCTATTGTTTAATTTACCATTTGTTTTTCTTCTTTTATACTATTAGAACAATACTTATGACGTTTCTCTTCTTTTTTTTAATCATCCTTCCTGGATCTATCCAATTATCAGTCAAGATAAAATGGTAGACAGTTTTACAGGAAACTTTGTCATTNTTATTCGCCTTTTGTTG-GGTGTGGGTATCACCTGTCTTAATCATTTGTATTCTAAATG-ACATACTTTTACTATTATCTGATATATGAAACAAGAAANATG-TCATTCTTGATA-TTACTC-AATGCTCCCACTTATCG-TACC-ATACTACTTTTGAT-AAATTTCTGATAGACT-AATATA-TTATTGATC-AAAGATATTTA] [+] EMBL CD081815 [CGAGCCTTTAATTCGGCACCAGGCGCTTAACATGGGGTAATGATCTTTGCTGGGGTGGACGTCGTGTCATACATCTTTTCCTTCTTGGTAATGTCCCATCTAATAATGAACGTTTAAAATACATATTAAAAAATGAGTCCTATGTATATCATGATATAATTCAACAAGATTTTCTTGATCACTATTATAATAGTACATATAAAATTATGTTTGGTATTAATTGGGCAGTAAAATATTGTTCAAATGTCCCAATTATTATGTTTGTTGATGATGATTATTTTATCTATCCAAAAAAATGTGGTTGCTTATATTGAAGGTTTAAGCACCGAGCTACGTAAACTTTTGATCAGTGGTTATGTTTGGTATAATGCTGGACCAGTTCGTAAGAATATCGGCAGTCACGATAAGTGGTTGGTTGATGACAAAGAATATGCTCCGCGTTATTATCCTCCATATGTGGCAGGGGGTAATTTTTTTTTATCAATGAATTTGGCACGTCAATTAAATATAGCTATGCGTTACACAAAATATCTTCGGTTTGATGATGTCTACCTTGGAATAATACTTAAGAAGTTATTACATGTACCGATGCATTTAAAAAAAGTCTACACATTCCACCCTGTAAATTTAAATTCATCTGAGATATATGAAATGATTTCTAGTCATGGCTTTGGCAAATCTGTTTCACAATTCTTCTTATGGGACCGCTTAAAATGTTCAACATTNTGTGTACACTCTATTGTTTAATTTACCATTTGTTTTTCTTCTTTTATACTATTAGAACAATACTTATGACGTTTCTCTTCTTTTTTTTAATCATCCTTCCTGGATCTATCCAATTATCAGTCAAGATAAAATGGTAGACAGTTTTACAGGAAACTTTGTCATTNTTATTCGCCTTTTGTTG GGTGTGGGTATCACCTGTCTTAATCATTTGTATTCTAAATG ACATACTTTTACTATTATCTGATATATGAAACAAGAAANATG TCATTCTTGATA TTACTC AATGCTCCCACTTATCG TACC ATACTACTTTTGAT AAATTTCTGATAGACT AATATA TTATTGATC AAAGAT ] [-] EMBL CD193026 [ ATCTTTTCCTTCTTGGTAATGTCCCATCTAATAATGAACGTTTAAAATACATATTAAAAAATGAGTCNTATGTATATCATGATATAATTCAACAAGATTCTCTTGATCACTATTATAATAGTACATATAAAATTATGTTTGGTATTAATTGGGCAGTAAAAT ] [-] EMBL CD075546 [ ATAATGCTGGACCAGTTCGTAAGAATATCGGCAGTCACGATAAGTGGTTGGTTGATGACAAAGAATATGCTCCGCGTTATTATCCTCCATATGTGGCAGGGGGTAATTTTTTTTTATCAATGAATTTGGCACGTCAATTAAATATAGCTATGCGTTACACAAAATATCTTCGGTTTGATGATGTCTACCTTGGAATAATACTTAAGAAGTTATTACATGTACCGATGCATTTAAAAAAAGTCTACACATTCCACCCTGTAAATTTAAATTCATCTGAGATATATGAAATGATTTCTAGTCATGGCTTTGGCAAATCTGTTTCACAATTCTTCTTATGGGACCGCTTAAAATGTTCAACATTTTGTGTACACTCTATTGTTTAATTTACCATTTGTTTTTCTTCTTTTATACTATTAGACCAATACTTATGACGTTTCTCTTCTTTTTTTTAATCATCCTTCCTGGATCTATCCAATTATCAGTCAAGATAAAATGGTAGACAGTTTTACAGGAAACTTTGTCATTTTTATTCGCCTTTTGTTGTTGT TGGGTATCACCTGTCTTAATCATTTGTATTCTAATTGTACATACTTTTACTATTATCTGATATATGAAACAAGAAA ATGTTCATTCTTGATATTTACTCAAATGCTCCCACTTATCGTTACCAATACTACTTTTGATAAAATTTCTGATAGACTAAATATATTTATTGGTCAAAAGA ATTTA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||