Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5871 cluster # 5871       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5871#0 length = 513 sequences # 3  

consensusID : consensus_5871#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 513
fasta sequence
                              [GATTGAGGATTACACTTGATGGAAGTGTTGTCACCGTTGTTGATGTACAATATAATGGTGAACTGTTGTTAGTCACATAATTAAAATTATCCGGTGTACGTAATGGATTATGAGTAATTTTAGTGTTATGTACATTGTTTAATGAGAAACTACCTGAACCAATGTCAATGGTAGGCAGCTCAGTATTTATCAGTGGAGTAGTTGGTGAAAATATAGGCATATTATTTTTGTTATTATATAGATAAATGGATGAATTTAAAGGATGTGGGTACGTACAAGACGTTGTTGTTGTACACGAAGACTGAAGATGGATTCGATTAATCAGAATATTTTGAATAGATACTAAAACAGTTTGAATTTCTAAAAATTGTTGTTTTAATTGGCTGACTTCTTGAGATAATTTATTTTGCCGA---TGGA-ATCTTTGAGGTCACACACAATGGAATACATGAANGGATTGAACCTTAAGTACAGATAAAACTGACGGTGAAGATGAAATACTTAAAGGTGAAATCG]

[+] EMBL CD152602             [GATTGAGGATTACACTTGATGGAAGTGTTGTCACCGCTGCTGATGTACAATATAATGGTGAACTGTTGTTACTCACATAATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD152706             [   TGTGGATTACACTTGATGGAAGTGTTGTCACCGTTGTTGATGTACAATATAATGGTGAACTGTTGTTAGTCATATAATTAAAATTATCCGGTGTACGTAATGGATTATGAGTAATTTTAGTGTTATGTACATTGTTTAATGAGAAACTACCTGAACCAATGTCAATGGTAGGCAGCTCAGTATTTATCAGTGGAGTAGTTGGTGAAAATATAGGCATATTATTTTTGTTATTATATAGATAAATGGATGAATTTAAAGGATGTGGGTACGTACAAGACGTTGTTGTTGTACACGAAGACTGAAGATGGATTCGATTAATCAGAATATTTTGAATAGATACTAAAACAGTTTGAATTTCTAAAAATTGTTGTTTTAATTGGCTGACTTCTTGAGATAATTTATTTTGCCGA   TGGA ATCTTTGAGGTCACACACAATGGAATACATGAANGGATTGAACCTTAAGTACAGATAAAACTGACGGTGAAGATGAAATACTTAAAGGTGAAATCG]
[+] EMBL CD178421             [          TACACTTGATGGAAGTGTTGTCACCGTTGTTGATGTACAATATAATGGTGAACTGTTGTTAGTCACATAATTAAAATTATCCGGTGTACGTAATGGATTATGAGTAATTTTAGTGTTATGTACATTGTTTAATGAGAAACTAGCTGAACCAATGTCAATGGTAGGCAGCTCAGTATTTATCAGTGGAGTAGTTGGTGAAAATATAGGCATATTATTTTTGTTATTATATAGATAAATGGATGAATTTAAAGGATGTGGGTACGTACAAGACGTTGTTGTTGTACACGAAGACTGAAGATGGATTCGATTAATCAGAATATTTTGAATAGATACTAAAACAGTTTGAATTTCTAAAAATTGTTGTTTTAATTGGCTGACTTCTTGAGATAATTTATTTTGCTGATTTTGTACATCTTTtaa                                                                                       ]


>consensus_5871#0 GATTGAGGATTACACTTGATGGAAGTGTTGTCACCGTTGTTGATGTACAATATAATGGTG AACTGTTGTTAGTCACATAATTAAAATTATCCGGTGTACGTAATGGATTATGAGTAATTT TAGTGTTATGTACATTGTTTAATGAGAAACTACCTGAACCAATGTCAATGGTAGGCAGCT CAGTATTTATCAGTGGAGTAGTTGGTGAAAATATAGGCATATTATTTTTGTTATTATATA GATAAATGGATGAATTTAAAGGATGTGGGTACGTACAAGACGTTGTTGTTGTACACGAAG ACTGAAGATGGATTCGATTAATCAGAATATTTTGAATAGATACTAAAACAGTTTGAATTT CTAAAAATTGTTGTTTTAATTGGCTGACTTCTTGAGATAATTTATTTTGCCGATGGAATC TTTGAGGTCACACACAATGGAATACATGAANGGATTGAACCTTAAGTACAGATAAAACTG ACGGTGAAGATGAAATACTTAAAGGTGAAATCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)