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Schistosoma mansoni
cluster # 5890 cluster # 5890       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5890#0 length = 449 sequences # 3  

consensusID : consensus_5890#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 449
fasta sequence
                              [AAGCTAATGGTGGACGGTCGCGCAATATCGTGGATTGACTTAAGCTATACATTAACACCGTTGGATGTCAGCTCAGTGGTCTAGAGTTTAAGCGTACGTGAGCGAAACAGAAGGTCCTGGGTTGGAGTCCCACGTGCGGGTTGGTGGATGAGCACCGTTGAAGAGTCCCGTATGAAGACGAAATGGCTGTCTTGTGCTCCCAGGTTTTTAATGATGGTCTAGCTTACATCGATGCATGAATCCAACTATTAAATTACTTCAACTTCCACAAACCCCCATCTGGATGTGCAATTTATTGACTTGACAAAGATTTGATTCTAACTACTTGTATAAATTTGCTTAGTACCTCAATAAATATACTTTGTTTAAGGTAACAATAATACAAGATATGATATTATTGCTCCGAAATAATAAATTTAGTGTATTTGTATAATTTGGTCGCTGATTGT]

[+] EMBL CD087585             [AAGCTAATGGTGGACGGTCGCGCAATATCGTGGATTGACTTAAGCTATACATTAACACCGTTGGATGTCAGCTCAGTGGTCTAGAGTTTAAGCGTACGTGAGCGAAACAGAAGGTCCTGGGTTGGAGTCCCACGTGCGGGTTGGTGGATGAGCACCGTTGAAGAGTCCCGTATGAAGACGAAATGGCTGTCTTGTGCTCCCAGGTTTTTAATGATGGTCTAGCTTACATCGATGCATGAATCCAACTATTAAATTACTTCAACTTCCACAAACCCCCATCTGGATGTGCAATTTATTGACTTGACAAAGATTTGATTCTAACTACTTGTATAAATTTGCTTAGTACCTCAATAAATATACTTTGTTTAAGGTAAGAATAATACAAGATATGATATTATTGCTCCGAAATAATAAATTTAGTGTATTTGTATAATTTGGTCGCTGATTGT]
[+] EMBL CD087579             [AAGCTAATGGTGGACGGTCGCGCAATATCGTGGATTGACTTAAGCTATACATTAATACCGTTGGATGTCAGCTCAGTGGTCTAGAGTTTAAGCGTACGTGAGCGAAACAGAAGGTCCTGGGTTGGAGTCCCACGTGCGGGTTGGTGGATGAGCACCGTTGAAGAGTCCCGTATGAAGACGAAATGGCTGTCTTGTGCTCCCAGGTTTTTAATGATGGTCTAGCTTACATCGATGCATGAATCCAACTATTAAATTACTTCAACTTCCACAAACCCCCATCTGGATGTGCAATTTATTGACTTGACAAAGATTTGATTCTAACTACTTGTATAAATTTGCTTAGTACCTCAATAAATATACTTTGTTTAAGGTAACAATAATACAAGATATGATATTATTGCTCCGAAATAATAAATTTAGTGTATTTGTATAATTTGGTCGCTGATTGT]
[+] EMBL CD087600             [AAGCTAATGGTGGACGGTCGCGCAATATCGTGGATTGACTTAAGCTATACATTAACACCGTTGGATGTCAGCTCAGTGGTCTAGAGTTTAAGCGTACGTGAGCGGAACAGAAGGTCCTGGGTTGGAGTCCCACGTGCGGGTTGGTGGATGAGCACCGTTGAAGAGTCCCGTATGAAGACGAAATGGCTGTCTTGTGCTCCCAGGTTTTTAATGATGGTCTAGCTTACATCGATGCATGAATCCAACTATTAAATTACTTCAACTTCCACGAACCCCCATCTGGATGTGCAATTTATTGACTTGACAAAGATTTGATTCTAACTACTTGTATAAATNTGCTTAGTACCTCAATAAATATACTTTGTTTAAGGTAACAATAATACAAGATATGATATTATTGCTCCGAAATAATA                                    ]


>consensus_5890#0 AAGCTAATGGTGGACGGTCGCGCAATATCGTGGATTGACTTAAGCTATACATTAACACCG TTGGATGTCAGCTCAGTGGTCTAGAGTTTAAGCGTACGTGAGCGAAACAGAAGGTCCTGG GTTGGAGTCCCACGTGCGGGTTGGTGGATGAGCACCGTTGAAGAGTCCCGTATGAAGACG AAATGGCTGTCTTGTGCTCCCAGGTTTTTAATGATGGTCTAGCTTACATCGATGCATGAA TCCAACTATTAAATTACTTCAACTTCCACAAACCCCCATCTGGATGTGCAATTTATTGAC TTGACAAAGATTTGATTCTAACTACTTGTATAAATTTGCTTAGTACCTCAATAAATATAC TTTGTTTAAGGTAACAATAATACAAGATATGATATTATTGCTCCGAAATAATAAATTTAG TGTATTTGTATAATTTGGTCGCTGATTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)