cluster # 590

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 590 cluster # 590 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_590#0 length = 641 sequences # 2

consensusID : consensus_590#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 641
fasta sequence

                              [CTGGGTGGCTGGCCGACGGCAGCTTGCGGTACCCTAAATAAAACTGGGATGAAAGTTATCAGCGGATAGTGGTTGGCAAACTAACTAACTAATTAACTGTACGTGTTATGAGGATGAGTTTGTCTTTTCTGCTTATTTGACTTGGTTAATTTATATGGTCTGCTTACCTATTTCTTTGTTTCTTATTAATTGTGTACATGAGAGATAGATAAGCATAGCATTGACTTTTGAAACAACTTCTGAATTGACTAGTAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGGTTTTTGGGGTGAATTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTACTATTATTTTCGATGAAAAAAAGATTTGCTAATTTTAATGATTATGTTCTTGATTTTATCTGATATTAGTGACCGAATTGTACCATGTTAGTTGATCGGAAGCAACGGACAAGAAGCCGTAGACACAGGTTTCGTGCTAGCTGGCACTCGTCAGTAAGGTGTACCTGGAATCTTGAGTGAATGGATGTCCTGTGCGGGCTTCGAACCTACGCCAATCAGTGTCATAATCAGAGGTGCTAGTACGGAGCGATTCGAGTCTCTACTGACTGTTATGTCTGATT]

[+] EMBL CD085146             [CTGGGTGGCTGGCCGACGGCAGCTTGCGGTACCCTAAATAAAACTGGGATGAAAGTTATCAGCGGATAGTGGTTGGCAAACTAACTAACTAATTAACTGTACGTGTTATGAGGATGAGTTTGTCTTTTCTGCTTATTTGACTTGGTTAATTTATATGGTCTGCTTACCTATTTCTTTGTTTCTTATTAATTGTGTACATGAGAGATAGATAAGCATAGCATTGACTTTTGAAACAACTTCTGAATTGACTAGTAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGGTTTTTGGGGTGAATTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTACTATTATTTTCGATGAAAAAAAGATTTGCTAATTTTAATGATTATGTTCTTGATT                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD111720             [                                                                                                                       taGTCTTGTCTGCTTATTTGACTTGGTTAATTTATATGGTCTGCTTACCTATTTCCTTGTTTCTTATTAATTGTGTACATGAGAGATAGATAAGCATAGCATTGACTTTTGAAACAACTTCTGAATTGACTAGTAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGTTTTTTGGGGTGAATTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTACTATTATTTTCGATGAAAAAAAGATTTGCTAATTTTAATGATTATGTTCTTGATTTTATCTGATATTAGTGACCGAATTGTACCATGTTAGTTGATCGGAAGCAACGGACAAGAAGCCGTAGACACAGGTTTCGTGCTAGCTGGCACTCGTCAGTAAGGTGTACCTGGAATCTTGAGTGAATGGATGTCCTGTGCGGGCTTCGAACCTACGCCAATCAGTGTCATAATCAGAGGTGCTAGTACGGAGCGATTCGAGTCTCTACTGACTGTTATGTCTGATT]




>consensus_590#0
CTGGGTGGCTGGCCGACGGCAGCTTGCGGTACCCTAAATAAAACTGGGATGAAAGTTATC
AGCGGATAGTGGTTGGCAAACTAACTAACTAATTAACTGTACGTGTTATGAGGATGAGTT
TGTCTTTTCTGCTTATTTGACTTGGTTAATTTATATGGTCTGCTTACCTATTTCTTTGTT
TCTTATTAATTGTGTACATGAGAGATAGATAAGCATAGCATTGACTTTTGAAACAACTTC
TGAATTGACTAGTAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGGT
TTTTGGGGTGAATTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTA
CTATTATTTTCGATGAAAAAAAGATTTGCTAATTTTAATGATTATGTTCTTGATTTTATC
TGATATTAGTGACCGAATTGTACCATGTTAGTTGATCGGAAGCAACGGACAAGAAGCCGT
AGACACAGGTTTCGTGCTAGCTGGCACTCGTCAGTAAGGTGTACCTGGAATCTTGAGTGA
ATGGATGTCCTGTGCGGGCTTCGAACCTACGCCAATCAGTGTCATAATCAGAGGTGCTAG
TACGGAGCGATTCGAGTCTCTACTGACTGTTATGTCTGATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case