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Schistosoma mansoni
cluster # 5902 cluster # 5902       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5902#0 length = 1181 sequences # 3  

consensusID : consensus_5902#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1181
fasta sequence
                              [TCAATACTATAGCCGAATTTGCTAAAAATCTTCCAGACACGCAAAAAATCGAAATATTGAAATTTATATTGAATTTTGAGCCAATGGTTAATTATCACCCAGAGTATGGTGATCGTCCGAAACCGTTAATTATGGTCCTTTTACAAACTATGCTAACTGTCGCCACACAGTATAAAACAGTAGCCATATCGAACGCATTGAATTCGGACTTTCTAAATCTTTTATTACGTGGTGTCGCTATTGATCCAGATCCCGTCATACGAATAATTGTACAGAAAATACTACATACTTTAATTGATCGACATGGGGATACAGAACAGTTGTTGACTGTTCGAATTTACGGTGAGAACGGATTAAGCAATTATTTTATCTTAGAGAAGCCTGAAAGACAAGATATTTTATTCATGAAAAGGACTGGTGTGTTATTTATTGAAAATATTTACCATCAGTTATTAGATCCTAGT-ACAAAGTAGACAATTTAGAATATCTGTCTTGCACTGTTGGATTGGTCGCATTAGAAATGGGTGCAGAACAGGTTATTACAGAATTGTTTCGTTTAATCTTAGCAGTTCAAACAAAAATCATTGATGAAATACGTATATGCCGTTAACACATCGCTGTGCTTTACATGCATTACTAGCTAGCACAATAACATTACTTGTTCAGCTGATTAATCTTCAATCACTTAGTGAACATATTTATACTGTTATTCAACGTAGACGAGACATGGCGCCGTGGTTACTGCCTTCTGTTGCATTTAATCGAACAAATACCGTGGACAGCTATCCAACTGAATTTGAAATAAATGATGATCTATTGTTTTCATCAGATAAAATAACTGAATCATTAGTAAATACTGGTTATGATACTGCTGTTTTGTCAATTCCTTATAATCCGATTTATTTACGATTATATGATGGCAAATCTCCTGATCCACTTATCGATGGTAACATTTATCCACGTGTAAGCGGTAATGAACATTTTACAAATCAGTCAATTTATTATGGTACCGTTGATGATAAAAATTCCAGTATTGCAAACTCGACTTCTGGTGCACGTATGAATTCAACATATTTAGATGGAACAATGCTATATCGTGAAAGCAGTCTTGTAGAAAGCGGTACATGCGTTGCTCAATCTGGAAGTAGTTTTTCGCTAACTGATAGTCTTTATTCAGTGGC]

[-] EMBL CD064969             [TCAATACTATAGCCGAATTTGCTAAAAATCTTCCAGACACGCAAAAAATCGAAATATTGAAATTTATATTGAATTTTGAGCCAATGGTTAATTATCACCCAGAGTATGGTGATCGTCCGAAACCGTTAATTATGGTCCTTTTACAAACTATGCTAACTGTCGCCACACAGTATAAAACAGTAGCCATATCGAACGCATTGAATTCGGACTTTCTAAATCTTTTATTACGTGGTGTCGCTATTGATCCAGATCCCGTCATACGAATAATTGTACAGAAAATACTACATACTTTAATTGATCGACATGGGGATACAGAACAGTTGTTGACTGTTCGAATTTACGGTGAGAACGGATTAAGCAATTATTTTATCTTAGAGAAGCCTGAAAGACAAGATATTTTATTCATGAAAAGGACTGGTGTGTTATTTATTGAAAATATTTACCATCAGTTATTAGATCCTAGT ACAAAGTAGACAATTTAGAATATCTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD066346             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATTTACCATCAGTTATTAGATCCTAGTAACAAAGTAGACAATTTAGAATATCTGTCTTGCACTGTTGGATTGGTCGCATTAGAAATGGGTGCAGAACAGGTTATTACAGAATTGTTTCGTTTAATCTTAGCAGTTCAAACAAAAATCATTGATGAAATACGTATATGCCGTTAACACATCGCTGTGCTTTACATGCATTACTAGCTAGCACAATAACATTACTTGTTCAGCTGATTAATCTTCAATCACTTAGTGAACATATTTATACTGTTATTCAACGTAGACGAGACATGGCGCCGTGGTTACTGCCTTCTGTTGCATTTAATCGAACAAATACCGTGGACAGCTATCCAACTGAATTTGAAATAAATGATGATCTATTGTTTTCATCAGATAAAATAACTGAATCATTAGTAAATACTGGTTATGATACTGCTGTTTTGTCAATTCCTTATAATCCGATTTATTTACGATTATATGA                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD153084             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CGTATATGCCGTTAACACATCGCTGTGCTTTACATGCATTACTAGCTAGCACAATAACATTACTTGTTCAGCTGATTAATCTTCAATCACTTAGTGAACATATTTATACTGTTATTCAACGTAGACGAGACATAGCGCCGTGGTTACTGCCTTCTGTTGCATTTAATCGAACAAATACCGTGGACAGCTATCCAACTGAATTTGAAATAAACGATGATCTATTGTTTTCATCAGATAAAATAACTGAATCATTAGTAAATACTGGTTATGATACTGCTGTTTTGTCAATTCCTTATAATCCGATTTATTTACGATTATATGATGGCAAATCTCCTGATCCACTTATCGATGGTAACATTTATCCACGTGTAAGCGGTAATGAACATTTTACAAATCAGTCAATTTATTATGGTACCGTTGATGATAAAAATTCCAGTATTGCAAACTCGACTTCTGGTGCACGTATGAATTCAACATATTTAGATGGAACAATGCTATATCGTGAAAGCAGTCTTGTAGAAAGCGGTACATGCGTTGCTCAATCTGGAAGTAGTTTTTCGCTAACTGATAGTCTTTATTCAGTGGC]


>consensus_5902#0 TCAATACTATAGCCGAATTTGCTAAAAATCTTCCAGACACGCAAAAAATCGAAATATTGA AATTTATATTGAATTTTGAGCCAATGGTTAATTATCACCCAGAGTATGGTGATCGTCCGA AACCGTTAATTATGGTCCTTTTACAAACTATGCTAACTGTCGCCACACAGTATAAAACAG TAGCCATATCGAACGCATTGAATTCGGACTTTCTAAATCTTTTATTACGTGGTGTCGCTA TTGATCCAGATCCCGTCATACGAATAATTGTACAGAAAATACTACATACTTTAATTGATC GACATGGGGATACAGAACAGTTGTTGACTGTTCGAATTTACGGTGAGAACGGATTAAGCA ATTATTTTATCTTAGAGAAGCCTGAAAGACAAGATATTTTATTCATGAAAAGGACTGGTG TGTTATTTATTGAAAATATTTACCATCAGTTATTAGATCCTAGTACAAAGTAGACAATTT AGAATATCTGTCTTGCACTGTTGGATTGGTCGCATTAGAAATGGGTGCAGAACAGGTTAT TACAGAATTGTTTCGTTTAATCTTAGCAGTTCAAACAAAAATCATTGATGAAATACGTAT ATGCCGTTAACACATCGCTGTGCTTTACATGCATTACTAGCTAGCACAATAACATTACTT GTTCAGCTGATTAATCTTCAATCACTTAGTGAACATATTTATACTGTTATTCAACGTAGA CGAGACATGGCGCCGTGGTTACTGCCTTCTGTTGCATTTAATCGAACAAATACCGTGGAC AGCTATCCAACTGAATTTGAAATAAATGATGATCTATTGTTTTCATCAGATAAAATAACT GAATCATTAGTAAATACTGGTTATGATACTGCTGTTTTGTCAATTCCTTATAATCCGATT TATTTACGATTATATGATGGCAAATCTCCTGATCCACTTATCGATGGTAACATTTATCCA CGTGTAAGCGGTAATGAACATTTTACAAATCAGTCAATTTATTATGGTACCGTTGATGAT AAAAATTCCAGTATTGCAAACTCGACTTCTGGTGCACGTATGAATTCAACATATTTAGAT GGAACAATGCTATATCGTGAAAGCAGTCTTGTAGAAAGCGGTACATGCGTTGCTCAATCT GGAAGTAGTTTTTCGCTAACTGATAGTCTTTATTCAGTGGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)