cluster # 5921

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Schistosoma mansoni
cluster # 5921 cluster # 5921 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5921#0 length = 673 sequences # 3

consensusID : consensus_5921#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 673
fasta sequence

                              [AGTTTCAGCAGCAATCTTCGAATCAGTGGATTTACTTGACACATTTGTCATCGGTTTAGTCTCTTTCTGTAAGGGTGCTGGTTCATTCGTCGTCAGATGAGTGTCAGAACTCTTTGTGTTGTTGTTCTTGTTGGAGGAGTCTTTTACAGATGTACTAGTGTTTTCTGGTATAGTTTTCTTGTTTTGGACATCTTTAGTAGCAGAGTTAGTAGTATCAGTAATATTGGGAGTGTTGACTACATTAGATTTTATTGAGTTAGCTGTTTTCGTTGGTATATTTGTTTCATGTGAGGAATTGGTCTTTATGTCTGACTCTTTCTTGCTTGATTGAGTGTCAGGCCTTAAAACATTGCTAATTGCGTTATGAGTAGTGGTTGTATTGTTATTAAAAGGAACTTCGGGTTTTTGTTCTGCCGGTCTTACAACAGAAGTTTTCTCATTTGATGGAAGAGTGCTAGAATCGAAAGTTCTGTCATTTGAATCGCTTTTTTCTTTTAACTTTACATTATTGTCTATTACATTACTACTGTTTTGGGGTTTACTAGTTGGACCACTATTTGTTGATTTTGTAATATTAACTGAATCTGTTGAGCTTTCCGCCACGTCATTTTTAACAACTGGTTCGTTAATTATTTCATTTTTGACTTTATGGTTTTTATTATCTAGAAAATCA]

[-] EMBL CD065142             [AGTTTCAGCAGCAATCTTCGAATCAGTGGATTTACTTGACACATTTGTCATCGGTTTAGTCTCTTTCTGTAAGGGTGCTGGTTCATTCGTCGTCAGATGAGTGTCAGAACTCTTTGTGTTGTTGTTCTTGTTGGAGGAGTCTTTTACAGATGTACTAGTGTTTTCTGGTATAGTTTTCTTGTTTTGGACATCTTTAGTAGCAGAGTTAGTAGTATCAGTAATATTGGGAGTGTTGACTACATTAGATTTTATTGAGTTAGCTGTTTTCGTTGGTATATTTGTTTCATGTGAGGAATTGGTCTTTATGTCTGACTCTTTCTTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD119100             [                                                                                                                                                                                                         AGAGTTAGTAGTATCAGTAATATTGGGAGTGTTGACTACATTAGATTTTATTGAGTTAGCTGTTTTCGTTGGTATATTTGTTCCATGTGAGGAATTGGTCTTTATGTCTGACTCTTTCTTGCTTGATTGAGTGTCAGGCCTTAAAACATTGCTAATTGCGTTATGAGTAGTGGTTGTATTGTTATTAAAAGGAACTTCGGGTTTTTGTTCTGCCGGTCTTACAACAGAAGTTTTCTCATTTGATGGAAGAGTGCTAGAATCGAAAGTTCTGTCATTTGAATCGCTTTTTTCTTTTAACTTTACATTATTGTCTATTACATTACTACTGTTTTGGGGTTTACTAGTTGGACCACTATTTGTTGATTTTGTAATATTAACTGAATCTGTTGAGCTTTCCGCCACGTCATTTTTAACAACTGGTTCGTTAATTATTTCATTTTTGACTTTATGGTTTTTATTATCTAGAAAAT  ]
[-] EMBL CD119276             [                                                                                                                                                                                                                          TAATATTGGGAGTGTTGACTACATTAGATTTTATTGAGTTAGCTGTTTTCGTTGGTATATTTGTTTCATGTGAGGAATTGGTCTTTATGTCTGACTCTTTCTTGCTTGATTGAGTGTCAGGCCTTAAAACATTGCTAATTGCGTTATGAGTAGTGGTTGTATTGTTATTAAAAGGAACTTCGGGTTTTTGTTCTGCCGGTCTTACAACAGAAGTTTTCTCATTTGATGGAAGAGTGCTAGAATCGAAAGTTCTGTCATTTGAATCGCTTTTTTCTTTTAACTTTACATTATTGTCTATTACATTACTACTGTTTTGGGGTTTACTAGTTGGACCACTATTTGTTGATTTTGTAATATTAACTGAATCTGTTGAGCTTTCCGCCACGTCATTTTTAACAACTGGCTCGTTAGTTATTTCATTTTTGACTTTATGGTTTTTATATTCTAGAAAATCA]




>consensus_5921#0
AGTTTCAGCAGCAATCTTCGAATCAGTGGATTTACTTGACACATTTGTCATCGGTTTAGT
CTCTTTCTGTAAGGGTGCTGGTTCATTCGTCGTCAGATGAGTGTCAGAACTCTTTGTGTT
GTTGTTCTTGTTGGAGGAGTCTTTTACAGATGTACTAGTGTTTTCTGGTATAGTTTTCTT
GTTTTGGACATCTTTAGTAGCAGAGTTAGTAGTATCAGTAATATTGGGAGTGTTGACTAC
ATTAGATTTTATTGAGTTAGCTGTTTTCGTTGGTATATTTGTTTCATGTGAGGAATTGGT
CTTTATGTCTGACTCTTTCTTGCTTGATTGAGTGTCAGGCCTTAAAACATTGCTAATTGC
GTTATGAGTAGTGGTTGTATTGTTATTAAAAGGAACTTCGGGTTTTTGTTCTGCCGGTCT
TACAACAGAAGTTTTCTCATTTGATGGAAGAGTGCTAGAATCGAAAGTTCTGTCATTTGA
ATCGCTTTTTTCTTTTAACTTTACATTATTGTCTATTACATTACTACTGTTTTGGGGTTT
ACTAGTTGGACCACTATTTGTTGATTTTGTAATATTAACTGAATCTGTTGAGCTTTCCGC
CACGTCATTTTTAACAACTGGTTCGTTAATTATTTCATTTTTGACTTTATGGTTTTTATT
ATCTAGAAAATCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case