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Schistosoma mansoni
cluster # 5929 cluster # 5929       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5929#0 length = 862 sequences # 3  

consensusID : consensus_5929#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 862
fasta sequence
                              [AGTCGACTCTAGAAGATCCCTTTATAGTAATATTTTAATGTCATGTGCTACTCGTGATGCTGTATGTCGTCTTATTATTAATGCAAGACCAAAAGGTTGTATAACTTGGTTTAAAAATCATTCCTCCCTGAATCATCGTTATAATTCCTGTTATAGAAAATCAAGTGTGTCACGTTTCACTGACAGCAAATCTGCTAAACCTCTCTCAGAGAGAAATATCTCTCAGAACACTGATACTGATTTGTTATCCACACAAGGCTCTAATCTTGCACATACTTCTCTTGGTTCGAATACGCCAACAACACCTACTGTTTCCTCTGGACGTAGTTTTCAATCAAGAACTACTCCATACTCTGGTCGTAGACGTCCTCCACGAGAGTATCATTCTTTTCAGCCCAGTCAGTTGATTGATGTATTAATAAATGAAGAAAATCCAGGTTCACGGGAACTAATTTCTCTCGATGATCTAGATAATGTCGACAGTCATCGGTTAACGTCATTAATTAACAGTCATCAAGAAACTATTGGCCGTTGGTCTTCTCGATCAGGTTCTACTAGCAATAGGCAGCGAAGGTCGAGTCATTTTTTAAGAATTTTAAATCAACCTCCTTCCTTATCAATATGGGAAGGTGAAACCAGATCACCTATCAGTAATAGTACAACAACAACTTTCAATGCTAATGAACCTATTCGTTTTATGGACATGGAAAATGATGATTGTGATCAGTCCGATATGAATTTAGATACTGATCTAAATAATTCAGATAATTATCTGTTATCGGAATTTCTTGATTTAGGTGGAATTGAACCATCCATTTCTGCATTACGTGAGGAAAGCGATGATGACAGAGCATATCGTATT]

[+] EMBL CD127321             [AGTCGACTCTAGAAGATCCCTTTATAGTAATATTTTAATGTCATGTGCTACTCGTGATGCTGTATGTCGTCTTATTATTAATGCAAGACCAAAAGGTTGTATAACTTGGTTTAAAAATCATTCCTCCCTGAATCATCGTTATAATTCCTGTTATAGAAAATCAAGTGTGTCACGTTTCACTGACAGCAAATCTGCTAAACCTCTCTCAGAGAGAAATATCTCTCAGAACACTGATACTGATTTGTTATCCACACAAGGCTCTAATCTTGCACATACTTCTCTTGGTTCGAATACGCCAACAACACCTACTGTTTCCTCTGGACGTAGTTTTCAATCAAGAACTACTCCATACTCTGGTCGTAGACGTCCTCCACGAGAGTATCATTCTTTTCAGCCCAGTCAGTTGATTGATGTATTAATAAATGAAGAAAATCCAGGTTCACGGGAACTAATTTCTCTCGATGATCTAGATAATGTCGACAGTCATCGGTTAACGTCATTAATTAACAGTCATCAAGAAACTATTGGCCGTTGGTCTTCTCGATCAGGTTCTACTAGCAATAGGCAGCGAAGGTCGAGTCATTTTTTAAGAATTTTAAATCAACCTCCTTCCTTATCAATATGGGAAGGTG                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD156342             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATTGATGTATTAATAAATGAAGAAAATCCAGGTTCACGGGAACTAATTTCTCTCGATGATCTAGATAATGTCGACAGTCATCGGTTAACGTCATTAATTAACAGTCATCAAGAAACTATTGGCCGTTGGTCTTCTCGATCAGGTTCTACTAGCAATAGGCAGCGAAGGTCGAGTCATTTTTTAAGAATTTTAAATCAACCTCCTTCCTTATCAATATGGGAAGGTGAAACCAGATCACCTATCAGTAATAGTACAACAACAACTTTCAATGCTAATGAACCTATTCGTTTTATGGACATGGAAAATGATGATTGTGATCAGTCCGATATGAATTTAGATACTGATCTAAATAATTCAGATAATTATCTGTTATCGGAATTTCTTGATTTAGGTGGAATTGAACCATCCATTTCTGCATTACGTGAGGAAAGCGATGATGACAGAGCATATCGTATT]
[+] EMBL CD156341             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTGATGTATTAATAAATGAAGAAAATCCAGGTTCACGGGAACTAATTTCTCTCGATGATCTAGATAATGTCGACAGTCATCGGTTAACGTCATTAATTAACAGTCATCAAGAAACTATTGGCCGTTGGTCTTCTCGATCAGGTTCTACTAGCAATAGGCAGCGAAGGTCGAGTCATTTTTTAAGAATTTTAAATCAACCTCCTTCCTTATCAATATGGGAAGGTGAAACCAGATCACCTATCAGTAATAGTACAACAACAACTTTCAATGCTAATGAACCTATTCGTTTTATGGACATGGAAAATGATGATTGTGATCAGTCCGATATGAATTTAGATACTGATCTAAATAATTCAGATAATTATCTGTTATCGGAATTTCTTGATTTAGGTGGAATTGAACCATCCATTTCTGCATTACGTGAGGAAAGCGATGATGACAGAGCATATCGTATT]


>consensus_5929#0 AGTCGACTCTAGAAGATCCCTTTATAGTAATATTTTAATGTCATGTGCTACTCGTGATGC TGTATGTCGTCTTATTATTAATGCAAGACCAAAAGGTTGTATAACTTGGTTTAAAAATCA TTCCTCCCTGAATCATCGTTATAATTCCTGTTATAGAAAATCAAGTGTGTCACGTTTCAC TGACAGCAAATCTGCTAAACCTCTCTCAGAGAGAAATATCTCTCAGAACACTGATACTGA TTTGTTATCCACACAAGGCTCTAATCTTGCACATACTTCTCTTGGTTCGAATACGCCAAC AACACCTACTGTTTCCTCTGGACGTAGTTTTCAATCAAGAACTACTCCATACTCTGGTCG TAGACGTCCTCCACGAGAGTATCATTCTTTTCAGCCCAGTCAGTTGATTGATGTATTAAT AAATGAAGAAAATCCAGGTTCACGGGAACTAATTTCTCTCGATGATCTAGATAATGTCGA CAGTCATCGGTTAACGTCATTAATTAACAGTCATCAAGAAACTATTGGCCGTTGGTCTTC TCGATCAGGTTCTACTAGCAATAGGCAGCGAAGGTCGAGTCATTTTTTAAGAATTTTAAA TCAACCTCCTTCCTTATCAATATGGGAAGGTGAAACCAGATCACCTATCAGTAATAGTAC AACAACAACTTTCAATGCTAATGAACCTATTCGTTTTATGGACATGGAAAATGATGATTG TGATCAGTCCGATATGAATTTAGATACTGATCTAAATAATTCAGATAATTATCTGTTATC GGAATTTCTTGATTTAGGTGGAATTGAACCATCCATTTCTGCATTACGTGAGGAAAGCGA TGATGACAGAGCATATCGTATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)