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Schistosoma mansoni
cluster # 5966 cluster # 5966       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5966#0 length = 769 sequences # 3  

consensusID : consensus_5966#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 769
fasta sequence
                              [AGCAATCCACTAAGTTAAAAAACGAAGATATTTTTTTAAGATGTGGCAGGAATTACAAAACGAAGGAAAATACAGAGACTATGCGGTTTAAGGAAGTTTGGCAGCATAATATAGCTTTGCACCGGAATGAGTTAATTAGCAGAGAAAAAGAGAGCCCATGACATGATAAATTAAAGAACTTAGTCGTTGTGATAACAAAATCGACTGCGTAAAAACAATTTAGACAGAATATTCAGAAAGGTAACCACAAAAGTATAGTTATATCTAGAATTATTAAAGGAAAATGCAATCAACAACAAGACACGAGAATTAGAAAGACTAACTCATAATAGCTTGTGATAAACAGCCAGAATTATTCAGAGTTCAAAATAATTAAATAAGACGGAATAAGTATATATTCATACACGATAAAGAGTAGCAGAATAACCTAACTTGAGTTTTAGATTGACCATTGTGCAGAGAAAAAACTGGATGCAACAATTACAATCAAAGTACATAACAGATGACCATTTGATTGGAAATGTTTACATATCTCAATAATTGGCGGAGTTTAAAAAAAATTAAATAACAATTATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAGTTTTTCATGATAATGAAGTTATGTAATTTCGGATGGATCTGCAAAAATTAAGCATTTCTAATGACAGAGTAGATTATAGTTCTTTTATTATAATTATTAAGTGATAATTTGATAATATGATGCACACTTATTGAGGTCAGAAGAAAATGTATTATTAAC]

[-] EMBL CD065394             [AGCAATCCACTAAGTTAAAAAACGAAGATATTTTTTTAAGATGTGGCAGGAATTACAAAACGAAGGAAAATACAGAGACTATGCGGTTTAAGGAAGTTTGGCAGCATAATATAGCTTTGCACCGGAATGAGTTAATTAGCAGAGAAAAAGAGAGCCCATGACATGATAAATTAAAGAACTTAGTCGTTGTGATAACAAAATCGACTGCGTAAAAACAATTTAGACAGAATATTCAGAAAGGTAACCACAAAAGTATAGTTATATCTAGAATTATTAAAGGAAAATGCAATCAACAACAAGACACGAGAATTAGAAAGACTAACTCATAATAGCTTGTGATAAACAGCCAGAATTATTCAGAGTTCAAAATAATTAAATAAGACGGAATAAGTATATATTCATACACGATAAAGAGTAGCAGAATAACCTAACTTGAGTTTTAGATTGACCATTGTGCAGAGAAAAAACTGGATGCAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD119226             [ GCAATCCACTAAGTTAAAAAACGAAGATATTTTTTTAAGATGTGGCAGGAATTACAAAACGAAGGAAAATACAGAGACTATGCGGTTTAAGGAAGTTTGGCAGCATAATATAGCTTTGCACCGGAATGAGTTAATTAGCAGAGAAAAAGAGAGCCCATGACATGATAAATTAAAGAACTTAGTCGTTGTGATAACAAAATCGACTGCGTAAAAACAATTTAGACAGAATATTCAGAAAGGTAACCACAAAAGTATAGTTATATCTAGAATTATTAAAGGAAAATGCAATCAACAACAAGACACGAGAATTAGAAAGACTAACTCATAATAGCTTGTGATAAACAGCCAGAATTATTCAGAGTTCAAAATAATTAAATAAGACGGAATAAGTATATATTCATACACGATAAAGAGTAGCAGAATAACCTAACTTGAGTTTTAGATTGACCATTGTGCAGAGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD169111             [                                                                                                                                                                ACATGATAAATTAAAGAACTTAGTCGTTGTGATAACAAAATCGACTGCGTAAAAACAATTTAGACAGAATATTCAGAAAGGTAACCACAAAAGTATAGTTATATCTAGAATTATTAAAGGAAAATGCAATCAACAACAAGACACGAGAATTAGAAAGACTAACTCATAATAGCTTGTGATAAACAGCCAGAATTATTCAGAGTTCAAAATAATTAAATAAGACGGAATAAGTATATATTCATACACGATAAAGAGTAGCAGAATAACCTAACTTGAGTTTTAGATTGACCATTGTGCAGAGAAAAAACTGGATGCAACAATTACAATCAAAGTACATAACAGATGACCATTTGATTGGAAATGTTTACATATCTCAATAATTGGCGGAGTTTAAAAAAAATTAAATAACAATTATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAGTTTTTCATGATAATGAAGTTATGTAATTTCGGATGGATCTGCAAAAATTAAGCATTTCTAATGACAGAGTAGATTATAGTTCTTTTATTATAATTATTAAGTGATAATTTGATAATATGATGCACACTTATTGAGGTCAGAAGAAAATGTATTATTAAC]


>consensus_5966#0 AGCAATCCACTAAGTTAAAAAACGAAGATATTTTTTTAAGATGTGGCAGGAATTACAAAA CGAAGGAAAATACAGAGACTATGCGGTTTAAGGAAGTTTGGCAGCATAATATAGCTTTGC ACCGGAATGAGTTAATTAGCAGAGAAAAAGAGAGCCCATGACATGATAAATTAAAGAACT TAGTCGTTGTGATAACAAAATCGACTGCGTAAAAACAATTTAGACAGAATATTCAGAAAG GTAACCACAAAAGTATAGTTATATCTAGAATTATTAAAGGAAAATGCAATCAACAACAAG ACACGAGAATTAGAAAGACTAACTCATAATAGCTTGTGATAAACAGCCAGAATTATTCAG AGTTCAAAATAATTAAATAAGACGGAATAAGTATATATTCATACACGATAAAGAGTAGCA GAATAACCTAACTTGAGTTTTAGATTGACCATTGTGCAGAGAAAAAACTGGATGCAACAA TTACAATCAAAGTACATAACAGATGACCATTTGATTGGAAATGTTTACATATCTCAATAA TTGGCGGAGTTTAAAAAAAATTAAATAACAATTATATATATATATATATATATATATATA TATATAAAAGTTTTTCATGATAATGAAGTTATGTAATTTCGGATGGATCTGCAAAAATTA AGCATTTCTAATGACAGAGTAGATTATAGTTCTTTTATTATAATTATTAAGTGATAATTT GATAATATGATGCACACTTATTGAGGTCAGAAGAAAATGTATTATTAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)