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Schistosoma mansoni
cluster # 5986 cluster # 5986       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5986#0 length = 794 sequences # 3  

consensusID : consensus_5986#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 794
fasta sequence
                              [TAAAACACGAGGTTCTGGAAGGACACCATTTATTGGATTCATACTAGTTGATGATATTGTAACATTGTTAATATAAGATCCAGTTGATGAACCCCATTCGAATGGATTTAAACGTCTAAGTAGGTCAAGTACAGCACTAACCCATGATACATTTGTATCAGCATTGAAATTAGATATAACTAATTCTTCTTGAATATCAGCAGGTATATTTTGATTATTTGTTTGTGAATAGAAATCGGGTAAAACAATTGAATTCACTTGAAATGCACTAGTTAATCGGGAAATTAATCGTGTCAAAATATTATTCTGCTCTAAAAGTTGACGTGCCAAACTGATAACGGTGTAAAATTGACAACTTAAACCACACAGACTGTCTCCGACTAAATGATCATCATAAATATGATTTTGAATTAATGATGAATATGATCTGGTAAATTTAATTGCAAATACACATCGATAAAAGTTATCTTTTAAGAGTACACTCATAATAAGACGTAACATTTCTTGTCGAACAGATCTCCATGTTAAACTATGACGTTCCAATATATGATTTAAAAATGAATCTTCTTTAACAGTTTCTCCGGGCAGTAATATTGGCAATATATCATTTGATTGACTGGATTCACTAACATCGATACTATTTTTATCAGCTGGTAGATGACCCAAAATAGCATGACAAATAATCGGTCGTAAACTAGGTACTTGATCACAGAAACGACGTAACCAACGAATAAATAATGTGAAGAAAACTTCCATTGAATAAACATCCGTATGTTGAGCTGCACAATTTATTG]

[+] EMBL CD146932             [TAAAACACGAGGTTCTGGAAGGACACCATTTATTGGATTCATACTAGTTGATGATATTGTAACATTGTTAATATAAGATCCAGTTGATGAACCCCATTCGAATGGATTTAAACGTCTAAGTAGGTCAAGTACAGCACTAACCCATGATACATTTGTATCAGCATTGAAATTAGATATAACTAATTCTTCTTGAATATCAGCAGGTATATTTTGATTATTTGTTTGTGAATAGAAATCGGGTAAAACAATTGAATTCACTTGAAATGCACTAGTTAATCGGGAAATTAATCGTGTCAAAATATTATTCTGCTCTAAAAGTTGACGTGCCAAACTGATAACGGTGTAAAATTGACAACTTAAACCACACAGACTGTCTCCGACTAAATGATCATCATAAATATGATTTTGAATTAATGATGAATATGATCTGGTAAATTTAATTGCAAATACACATCGATAAAAGTTATCTTTTAAGAGTACACTCATAATAAGACGTAACATTTCTTGTCGAACAGATCTCCATGTTAAACTATGACGTTCCAATATATGATTTAAAAATGAATCTTCTTTAACAGTTTCTCCGGGC                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD083346             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ctgCTGCTCTAAAAGTTGACGTGCCAAACTGATAACGGTGTAAAATTGACAACTTAAACCACACAGACTGTCTCCGACTAAATGATCATCATAAATATGATTTTGAATTAATGATGAATATGATCTGGTAAATTTAATTGCAAATACACATCGATAAAAGTTATCTTTTAAGAGTACACTCATAATAAGACGTAACATTTCTTGTCGAACAGATCTCCATGTTAAACTATGACGTTCCAATATATGATTTAAAAATGAATCTTCTTTAACAGTTTCTCCGGGCAGTAATATTGGCAATATATCATTTGATTGACTGGATTCACTAACATCGATACTATTTTTATCAGCTGGTAGATGACCCAAAATAGCATGACAAATAATCGGTCGTAAACTAGGTACTTGATCACAGAAACGACGTAACCAACGAATAAATAATGTGAAGAAAACTTCCATTGAATAAACATCCGTATGTTGAGCTGCACAATTTATTG]
[+] EMBL CD163499             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACGTGCCAAACTGATAACGGTGTAAAATTGACAACTTAAACCACACAGACTGTCTCCGACTAAATGATCATCATAAATATGATTTTGAATTAATGATGAATATGATCTGGTAAATTTAATTGCAAATACACATCGATAAAAGTTATCTTTTAAGAGTACACTCATAATAAGACGTAACATTTCTTGTCGAACAGATCTCCATGTTAAACTATGACGTTCCAATATATGATTTAAAAATGAATCTTCTTTAACAGTTTCTCCGGGCAGTAATATTGGCAATATATCATTTGATTGACTGGATTCACTAACATCGATACTATTTTTATCAGCTGGTAGATGACCCAAAATAGCATGACAAATAATCGGTCGTAAACTAGGTACTTGATCACAGAAACGACGTAACCAACGAATAAATAATGTGAAGAAAACTTCCATTGAATAAA                              ]


>consensus_5986#0 TAAAACACGAGGTTCTGGAAGGACACCATTTATTGGATTCATACTAGTTGATGATATTGT AACATTGTTAATATAAGATCCAGTTGATGAACCCCATTCGAATGGATTTAAACGTCTAAG TAGGTCAAGTACAGCACTAACCCATGATACATTTGTATCAGCATTGAAATTAGATATAAC TAATTCTTCTTGAATATCAGCAGGTATATTTTGATTATTTGTTTGTGAATAGAAATCGGG TAAAACAATTGAATTCACTTGAAATGCACTAGTTAATCGGGAAATTAATCGTGTCAAAAT ATTATTCTGCTCTAAAAGTTGACGTGCCAAACTGATAACGGTGTAAAATTGACAACTTAA ACCACACAGACTGTCTCCGACTAAATGATCATCATAAATATGATTTTGAATTAATGATGA ATATGATCTGGTAAATTTAATTGCAAATACACATCGATAAAAGTTATCTTTTAAGAGTAC ACTCATAATAAGACGTAACATTTCTTGTCGAACAGATCTCCATGTTAAACTATGACGTTC CAATATATGATTTAAAAATGAATCTTCTTTAACAGTTTCTCCGGGCAGTAATATTGGCAA TATATCATTTGATTGACTGGATTCACTAACATCGATACTATTTTTATCAGCTGGTAGATG ACCCAAAATAGCATGACAAATAATCGGTCGTAAACTAGGTACTTGATCACAGAAACGACG TAACCAACGAATAAATAATGTGAAGAAAACTTCCATTGAATAAACATCCGTATGTTGAGC TGCACAATTTATTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)