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Schistosoma mansoni
cluster # 60 cluster # 60       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_60#0 length = 910 sequences # 2  

consensusID : consensus_60#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 910
fasta sequence
                              [CTCTTTAAAATAATGTGAAAAGACATTAGTGATTACTACTACATATGAACTAGATATACATTTTGAGAAATATTGAAATGAATATTTTCATAAAATGTTATTATGATTACAAAATAACAAATGCATTAAAGAAAAAAAATATTTATACTGTTAGTTGAAGTTCTGGATTTGATAATGGGTTTGATTTTTGTTTGGGTTGAATATTAACTGGTTGGTTTAATGCATAATTACTAGCTAATGGAGGTAAACCAATACCTAAACCATTTCTTACTAATCGATGTTGTTTCGATGCTGTATCATAATTATTTTCTGATGTATTAAAATCTGTGGTAGACTGTCCTCTTAAATCGATTCTTAGTGGTGTTTGAATTATATTTGATGACTGATCGTCGGGTTGATTAAAACCATTATGATCAAAATTGTTATTTGAATGGATCAATTCATGGCTATTTTCCGAATGAGGGTATAAACCTGAAGCTCTTGAATTCACCTTTGTGGGAGATTCATTATATTTTGAGAGACCTGATGGGATATTTGTTGTGCAATTTTTACGTAATGTGACAGTAGATGAAGGCATCTGANGACTTCTAGGTGGAGGTATGGGAGGTAGACTGTGTTCACCTCGTGAATGTTCCATTTGCTGTTGTTCTAGTGTTAATGGCATTATTTTCTGAGGTGATGCATGTTCTGGATGATAAGCGATTCCGGGACCATTATTATTTCCATACTGAGCTACTGGTTGAATGATTGTATTATCAGAAACTATATAACATGCACATGAACCGCCTGGTGTTGGATTTTGACATGCGATTGAATGAATTTTAGTCAGACTTCCTGTGTTATCTAAACTTGGATTCCTGTAATAGCCAATTCTACTACTTGGTCGATATCCAGAGTACGTGTTGTACTG]

[+] EMBL CD180863             [CTCTTTAAAATAATGTGAAAAGACATTAGTGATTACTACTACATATGAACTAGATATACATTTTGAGAAATATTGAAATGAATATTTTCATAAAATGTTATTATGATTACAAAATAACAAATGCATTAAAGAAAAAAAATATTTATACTGTTAGTTGAAGTTCTGGATTTGATAATGGGTTTGATTTTTGTTTGGGTTGAATATTAACTGGTTGGTTTAATGCATAATTACTAGCTAATGGAGGTAAACCAATACCTAAACCATTTCTTACTAATCGATGTTGTTTCGATGCTGTATCATAATTATTTTCTGATGTATTAAAATCTGTGGTAGACTGTCCTCTTAAATCGATTCTTAGTGGTGTTTGAATTATATTTGATGACTGATCGTCGGGTTGATTAAAACCATTATGATCAAAATTGTTATTTGAATGGATCAATTCATGGCTATTTTCCGAATGAGGGTATAAACCTGAAGCTCTTGAATTCACCTTTGTGGGAGATTCATTATATTTTGAGAGACCTGATGGGATATTTGTTGTGCAATTTTTACGTAATGTGACAGTAGATGAAGGCATCTGANGACTTCTAGGTGGAGGTATGGGAGGTAGACTGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD200511             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGCAATTTTTACGTAATGTGACAGTAGATGAAGGCATCTGAGGACTTCTAGGTGGAGGTATGGGAGGTAGACTGTGTTCACCTCGTGAATGTTCCATTTGCTGTTGTTCTAGTGTTAATGGCATTATTTTCTGAGGTGATGCATGTTCTGGATGATAAGCGATTCCGGGACCATTATTATTTCCATACTGAGCTACTGGTTGAATGATTGTATTATCAGAAACTATATAACATGCACATGAACCGCCTGGTGTTGGATTTTGACATGCGATTGAATGAATTTTAGTCAGACTTCCTGTGTTATCTAAACTTGGATTCCTGTAATAGCCAATTCTACTACTTGGTCGATATCCAGAGTACGTGTTGTACTG]


>consensus_60#0 CTCTTTAAAATAATGTGAAAAGACATTAGTGATTACTACTACATATGAACTAGATATACA TTTTGAGAAATATTGAAATGAATATTTTCATAAAATGTTATTATGATTACAAAATAACAA ATGCATTAAAGAAAAAAAATATTTATACTGTTAGTTGAAGTTCTGGATTTGATAATGGGT TTGATTTTTGTTTGGGTTGAATATTAACTGGTTGGTTTAATGCATAATTACTAGCTAATG GAGGTAAACCAATACCTAAACCATTTCTTACTAATCGATGTTGTTTCGATGCTGTATCAT AATTATTTTCTGATGTATTAAAATCTGTGGTAGACTGTCCTCTTAAATCGATTCTTAGTG GTGTTTGAATTATATTTGATGACTGATCGTCGGGTTGATTAAAACCATTATGATCAAAAT TGTTATTTGAATGGATCAATTCATGGCTATTTTCCGAATGAGGGTATAAACCTGAAGCTC TTGAATTCACCTTTGTGGGAGATTCATTATATTTTGAGAGACCTGATGGGATATTTGTTG TGCAATTTTTACGTAATGTGACAGTAGATGAAGGCATCTGANGACTTCTAGGTGGAGGTA TGGGAGGTAGACTGTGTTCACCTCGTGAATGTTCCATTTGCTGTTGTTCTAGTGTTAATG GCATTATTTTCTGAGGTGATGCATGTTCTGGATGATAAGCGATTCCGGGACCATTATTAT TTCCATACTGAGCTACTGGTTGAATGATTGTATTATCAGAAACTATATAACATGCACATG AACCGCCTGGTGTTGGATTTTGACATGCGATTGAATGAATTTTAGTCAGACTTCCTGTGT TATCTAAACTTGGATTCCTGTAATAGCCAATTCTACTACTTGGTCGATATCCAGAGTACG TGTTGTACTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)