These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6010#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 739 fasta sequence [GAACCAACATTGGGTTATAGTAGACGTGGCTGGTTTATACATCCATTCGATAATAATCCATGGTGGACATCCATTGTTGCCATCGGACCATCATTACTGGCAGTTATTTTAATTTTTATGGATCAACAAATTACAGCAGTTATTGTGAATCGACGTGAGCATAAATTAAAGAAAGGAGCTGGTTACCATTTAGATTTACTTGTTGTCTCAGTTACTATATTAAGTAATTCAATTCTT-GGAATCCCATGGTTTGTTGCAGCAACTGTCCTGTCGATTAATCATGTTTTATCATTGAAAAAAGAATCCGAAACAAATGCTCCTGGTGAACGACCAGTTTATTTAGGCTGTAGAGAACAACGTGTCACTGGAGTATTGATTTTCCTATTTATTGGTTTATCTGTATTCATGACACCCCTATTATCACGTATTCCAATGCCTGTACTGTATGGAATATTTCTATTCAT-GGTATATCATCTATGCGTGGCATTCAAATGTTTGAACGTCTTAGTTTACTATTTATGCCGGTTAAATATCAGCCAGACTATCCGTATTTGAGACATGTTTCTCTACGTCGAGTTCATTTATTCACGATAATACAAGTTGCTTGTTTGGTTATGCTATGGGTTATTAAATCCATTGAAGTACTTGCTATTCTCTTCCCTAATATGGTTTTAGCCATGTGTTTTATACGTAAAGGATTAGATTTTATATTTACTCAAGAAGAATTAAAATGGTTAGA] [+] EMBL CD113130 [GAACCAACATTGGGTTATAGTAGACGTGGCTGGTTTATACATCCATTCGATAATAATCCATGGTGGACATCCATTGTTGCCATCGGACCATCATTACTGGCAGTTATTTTAATTTTTATGGATCAACAAATTACAGCAGTTATTGTGAATCGACGTGAGCATAAATTAAAGAAAGGAGCTGGTTACCATTTAGATTTACTTGTTGTCTCAGTTACTATATTAAGTAATTCAATTCTT GGAATCCCATGGTTTGTTGCAGCAACTGTCCTGTCGATTAATCATGTTTTATCATTGAAAAAAGAATCCGAAACAAATGCTCCTGGTGAACGACCAGTTTATTTAGGCTGTAGAGAACAACGTGTCACTGGAGTATTGATTTTCCTATTTATTGGTTTATCTGTATTCATGACACCCCTATTATCACGTATTCCAATGCCTGTACTGTATGGAATATTTCTATTCAT GGTATATCATCTATGCGTGGCATTCAAATGTTTGAACGTCTTAGTTTACTATTTATGCCGGTTAAATATCAGCCAGACTATCCGTATTTGAGACATGTTTCTCTACGTCGAGTTCATTTATTCACGATAATAC ] [+] EMBL CD196288 [ aatacgCATCCATTCGATAATAATCCATGGTGGACATCCATTGTTGCCATCGGACCATCATTACTGGCAGTTATTTTAATTTTTATGGATCAACAAATTACAGCAGTTATTGTGAATCGACGTGAGCATAAATTAAAGAAAGGAGCTGGTTACCATTTAGATTTACTTGTTGTCTCAGTTACTATATTAAGTAATTCAATTCTT GGAATCCCATGGTTTGTTGCAGCAACTGTCCTGTCGATTAATCATGTTTTATCATTGAAAAAAGAATCCGAAACAAATGCTCCTGGTGAACGACCAGTTTATTTAGGCTGTAGAGAAC ACGTGTCACTGGAGTATTGATTTTCCTATTTATTGG TTATCTGTATTCATGAC ] [+] EMBL CD194023 [ GATAATAATCCATGGTGGACATCCATTGTTGCCATCGGACCATCATTACTGGCAGTTATTTTAATTTTTATGGATCAACAAATTACAGCAGTTATTGTGAATCGACGTGAGCATAAATTAAAGAAAGGAGCTGGTTACCATTTAGATTTACTTGTTGTCTCAGTTACTATATTAAGTAATTCAATTCTT GGAATCCCATGGTTTGTTGCAGCAACTGTCCTGTCGATTAATCATGTTTTATCATTGAAAAAAGAATCCGAAACAAATGCTCCTGGTGAACGACCAGTTTATTTAGGCTGTAGAGAAC ACGTGTCACTGGAGTATTGATTTTCCTATTTATTGGNTTATCTGTATTCATGACACCCCTATTATCACGTATTCCAA ] [-] EMBL CD200924 [ TACCATTTAGATTTACTTGTTGTCTCAGTTACTATATTAGGTAATTCAATTCTTGGGAATCCCATGGTTTGTTGCAGCAACTGTCCTGTCGATTAATCATGTTTTATCATTGAAAAAAGAATCCGAAACAAATGCTCCTGGTGAACGACCAGTTTATTTAGGCTGTAGAGAACAACGTGTCACTGGAGTATTGATTTTCCTATTTATTGGTTTATCTGTGTTCATGACACCCCTATTATCACGTATTCCAATGCCTGTACTGTATGGAATATTTCTATTCATGGGTATATCATCTATGCGTGGCATTCAAATGTTTGAACGTCTTAGTTTACTATTTATGCCGGTTAAATATCAGCCAGACTATCCGTATTTGAGACATGTTTCTCTACGTCGAGTTCATTTATTCACGATAATACAAGTTGCTTGTTTGGTTATGCTATGGGTTATTAAATCCATTGAAGTACTTGCTATTCTCTTCCCTAATATGGTTTTAGCCATGTGTTTTATACGTAAAGGATTAGATTTTATATTTACTCAAGAAGAATTAAAATGGTTAGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||