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Schistosoma mansoni
cluster # 6061 cluster # 6061       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6061#0 length = 750 sequences # 4  

consensusID : consensus_6061#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 750
fasta sequence
                              [TGTTTTCTTTCTATATATCACAGAGGATTTCTCGACTGTCATTGTCCTTTGTTGTCGATGTTGTTGTTGTTGTTGTGACTTATGATGTACTTGATGTAGTTAGTACATGATCTATCTGCTTATCATCATCATCATTTTATTTTTTAAAAAAGAAGCCTTAAATGTTGTATTATTATGTAATAGATTACATTAGATTATTGTTCTTATTTAATATATTCTATTTTTTAATAGTTATTTGTTTAAATGCTTCACATATACGCTGATCAGGATGATGATGATGATGAGTATCATGTGATTCATGCATTTTTGTGTGCTCTTTTTCTTCTTCTATCCAACTGTTATCTATCTTATCCATCAATGTTATAGTTACTATGACAACTTCAGTTTATTGTGTCTGTGTGTGTGTATAACGAAATTGCCAAAATCTGTTTATAGCGCCATTTTCTATTACATTTTCATATTTTGATTGATTGATATGTTCTATACTTATACAACTTTTGCTTTATTCTTTTCACTTATTTATGGATTTTTGTTCTTGTTGTTGATTTTTATGAAAAATTTTCACGATTATTTTTTTTCG-GGGGGGGGGTTTGTTTGTTTTTTAAAAAAAAGGGAGAATAAACAATCATCTCACTTATTAGGGGGGATGTTTCTTTGTTTAGATAATGTTTATGTATCTATATACATACATATATAATGAGTTTTTATGATCAATGTCACTTTCAACTCTACAATGTTTAGATCAGTAAT]

[-] EMBL CD185196             [TGTTTTCTTTCTATATATCACAGAGGATTTCTCGACTGTCATTGTCCTTTGTTGTCGATGTTGTTGTTGTTGTTGTGACTTATGATGTACTTGATGTAGTTAGTACATGATCTATCTGCTTATCATCATCATCATTTTATTTTTTAAAAAAGAAGCCTTAAATGTTGTATTATTATGTAATAGATTACATTAGATTATTGTTCTTATTTAATATATTCTATTTTTTAATAGTTATTTGTTTAAATGCTTCACATATACGCTGATCAGGATGATGATGATGATGAGTATCATGTGATTCATGCATTTTTGTGTGCTCTTTTTCTTCTTCTATCCAACCGTTATCTATCTTATCCATCAATGTTATAGTTACTATGACAACTTCAGTTTATTGTGTCTGTGTGTGTGTATAACGAAATTGCCAAAATCTGTTTATAGCGCCATTTTCTATTACATTTTCATATTTTGATTGATTGATATGTTCTATACTTATACAACTTTTGCTTTATTCTTTTCACTTATTTATGGATTTTTGTTCTTGTTGTTG                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI067921             [                                                                                                                                                                            TTATGTAATAGATTACATTAGATTATTGTTCTTATTTAATATATTCTATTTTTTAATAGTTATTTGTTTAAATGCTTCACATATACGCTGATCAGGATGATGATGATGATGAGTATCATGTGATTCATGCATTTTTGTGTGCTCTTTTTCTTCTTCTATCCAACTGTTATCTATCTTATCCATCAATGTTATAGTTACTATGACAACTTCAGTTTATTGTGTCTGTGTGTGTGTATAACGAAATTGCCAAAATCTGTTTATAGCGCCATTTTCTATTACATTTTCATATTTTGATTGATTGATATGTTCTATACTTATACAACTTTTGCTTTATTCTTTTCACTTATTTATGGATTTTTGTTCTTGTTGTTGATTTTTATGAAAAATTTTCACGATTATTTTTTTTCG GGGGGGGGGTTTGTTTGTTTTTTAAAAAAAAGGGAGAATAAACAATCATCTCACTTATTAGGGGGGATGTTTCTTTGTTTAGATAATGTTTATGTATCTATATACATACATATATAATGAGTTTTTATGATCAATGTCACTTTCAACTCTACAATGTTTAGATCAGTAAT]
[+] EMBL AI067834             [                                                                                                                                                                            TTATGTAATAGATTACATTAGATTATTGTTCTTATTTAATATATTCTATTTTTTAATAGTTATTTGTTTAAATGCTTCACATATACGCTGATCAGGATGATGATGATGATGAGTATCATGTGATTCATGCATTTTTGTGTGCTCTTTTTCTTCTTCTATCCAACTGTTATCTATCTTATCCATCAATGTTATAGTTACTATGACAACTTCAGTTTATTGTGTCTGTGTGTGTGTATAACGAAATTGCCAAAATCTGTTTATAGCGCCATTTTCTATTACATTTTCATATTTTGATTGATTGATATGTTCTATACTTATACAACTTTTGCTTTATTCTTTTCACTTATTTACGGATTTTTGTTCTTGTTGTTGAat                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AW061411             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTCTGTGTGTGTGTATAACTTTATTGCCAAAATCTGTTTATAGCGCCATTTTCTATTACATTTTCATATTTTGATTGATTGATATGTTCTATACTTATACAACTTTTGCTTTATTCTTTTCACTTATTTATGGATTTTTGTTCTTG TGTTGATTTTCATG AAAATTTTC CGATTATTTTTTTTCGTGTGTGTGGGTTTGTTTGATATTTAAAAAAA  GGAG ATTAACAATCATCTCACTTATTAGt                                                                                                            ]


>consensus_6061#0 TGTTTTCTTTCTATATATCACAGAGGATTTCTCGACTGTCATTGTCCTTTGTTGTCGATG TTGTTGTTGTTGTTGTGACTTATGATGTACTTGATGTAGTTAGTACATGATCTATCTGCT TATCATCATCATCATTTTATTTTTTAAAAAAGAAGCCTTAAATGTTGTATTATTATGTAA TAGATTACATTAGATTATTGTTCTTATTTAATATATTCTATTTTTTAATAGTTATTTGTT TAAATGCTTCACATATACGCTGATCAGGATGATGATGATGATGAGTATCATGTGATTCAT GCATTTTTGTGTGCTCTTTTTCTTCTTCTATCCAACTGTTATCTATCTTATCCATCAATG TTATAGTTACTATGACAACTTCAGTTTATTGTGTCTGTGTGTGTGTATAACGAAATTGCC AAAATCTGTTTATAGCGCCATTTTCTATTACATTTTCATATTTTGATTGATTGATATGTT CTATACTTATACAACTTTTGCTTTATTCTTTTCACTTATTTATGGATTTTTGTTCTTGTT GTTGATTTTTATGAAAAATTTTCACGATTATTTTTTTTCGGGGGGGGGGTTTGTTTGTTT TTTAAAAAAAAGGGAGAATAAACAATCATCTCACTTATTAGGGGGGATGTTTCTTTGTTT AGATAATGTTTATGTATCTATATACATACATATATAATGAGTTTTTATGATCAATGTCAC TTTCAACTCTACAATGTTTAGATCAGTAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)