These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6061#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 750 fasta sequence [TGTTTTCTTTCTATATATCACAGAGGATTTCTCGACTGTCATTGTCCTTTGTTGTCGATGTTGTTGTTGTTGTTGTGACTTATGATGTACTTGATGTAGTTAGTACATGATCTATCTGCTTATCATCATCATCATTTTATTTTTTAAAAAAGAAGCCTTAAATGTTGTATTATTATGTAATAGATTACATTAGATTATTGTTCTTATTTAATATATTCTATTTTTTAATAGTTATTTGTTTAAATGCTTCACATATACGCTGATCAGGATGATGATGATGATGAGTATCATGTGATTCATGCATTTTTGTGTGCTCTTTTTCTTCTTCTATCCAACTGTTATCTATCTTATCCATCAATGTTATAGTTACTATGACAACTTCAGTTTATTGTGTCTGTGTGTGTGTATAACGAAATTGCCAAAATCTGTTTATAGCGCCATTTTCTATTACATTTTCATATTTTGATTGATTGATATGTTCTATACTTATACAACTTTTGCTTTATTCTTTTCACTTATTTATGGATTTTTGTTCTTGTTGTTGATTTTTATGAAAAATTTTCACGATTATTTTTTTTCG-GGGGGGGGGTTTGTTTGTTTTTTAAAAAAAAGGGAGAATAAACAATCATCTCACTTATTAGGGGGGATGTTTCTTTGTTTAGATAATGTTTATGTATCTATATACATACATATATAATGAGTTTTTATGATCAATGTCACTTTCAACTCTACAATGTTTAGATCAGTAAT] [-] EMBL CD185196 [TGTTTTCTTTCTATATATCACAGAGGATTTCTCGACTGTCATTGTCCTTTGTTGTCGATGTTGTTGTTGTTGTTGTGACTTATGATGTACTTGATGTAGTTAGTACATGATCTATCTGCTTATCATCATCATCATTTTATTTTTTAAAAAAGAAGCCTTAAATGTTGTATTATTATGTAATAGATTACATTAGATTATTGTTCTTATTTAATATATTCTATTTTTTAATAGTTATTTGTTTAAATGCTTCACATATACGCTGATCAGGATGATGATGATGATGAGTATCATGTGATTCATGCATTTTTGTGTGCTCTTTTTCTTCTTCTATCCAACCGTTATCTATCTTATCCATCAATGTTATAGTTACTATGACAACTTCAGTTTATTGTGTCTGTGTGTGTGTATAACGAAATTGCCAAAATCTGTTTATAGCGCCATTTTCTATTACATTTTCATATTTTGATTGATTGATATGTTCTATACTTATACAACTTTTGCTTTATTCTTTTCACTTATTTATGGATTTTTGTTCTTGTTGTTG ] [+] EMBL AI067921 [ TTATGTAATAGATTACATTAGATTATTGTTCTTATTTAATATATTCTATTTTTTAATAGTTATTTGTTTAAATGCTTCACATATACGCTGATCAGGATGATGATGATGATGAGTATCATGTGATTCATGCATTTTTGTGTGCTCTTTTTCTTCTTCTATCCAACTGTTATCTATCTTATCCATCAATGTTATAGTTACTATGACAACTTCAGTTTATTGTGTCTGTGTGTGTGTATAACGAAATTGCCAAAATCTGTTTATAGCGCCATTTTCTATTACATTTTCATATTTTGATTGATTGATATGTTCTATACTTATACAACTTTTGCTTTATTCTTTTCACTTATTTATGGATTTTTGTTCTTGTTGTTGATTTTTATGAAAAATTTTCACGATTATTTTTTTTCG GGGGGGGGGTTTGTTTGTTTTTTAAAAAAAAGGGAGAATAAACAATCATCTCACTTATTAGGGGGGATGTTTCTTTGTTTAGATAATGTTTATGTATCTATATACATACATATATAATGAGTTTTTATGATCAATGTCACTTTCAACTCTACAATGTTTAGATCAGTAAT] [+] EMBL AI067834 [ TTATGTAATAGATTACATTAGATTATTGTTCTTATTTAATATATTCTATTTTTTAATAGTTATTTGTTTAAATGCTTCACATATACGCTGATCAGGATGATGATGATGATGAGTATCATGTGATTCATGCATTTTTGTGTGCTCTTTTTCTTCTTCTATCCAACTGTTATCTATCTTATCCATCAATGTTATAGTTACTATGACAACTTCAGTTTATTGTGTCTGTGTGTGTGTATAACGAAATTGCCAAAATCTGTTTATAGCGCCATTTTCTATTACATTTTCATATTTTGATTGATTGATATGTTCTATACTTATACAACTTTTGCTTTATTCTTTTCACTTATTTACGGATTTTTGTTCTTGTTGTTGAat ] [+] EMBL AW061411 [ GTCTGTGTGTGTGTATAACTTTATTGCCAAAATCTGTTTATAGCGCCATTTTCTATTACATTTTCATATTTTGATTGATTGATATGTTCTATACTTATACAACTTTTGCTTTATTCTTTTCACTTATTTATGGATTTTTGTTCTTG TGTTGATTTTCATG AAAATTTTC CGATTATTTTTTTTCGTGTGTGTGGGTTTGTTTGATATTTAAAAAAA GGAG ATTAACAATCATCTCACTTATTAGt ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||