cluster # 6068

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Schistosoma mansoni
cluster # 6068 cluster # 6068 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_6068#0 length = 650 sequences # 4

consensusID : consensus_6068#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 650
fasta sequence

                              [ATCCAAGCAGTTTCATTAGTCTTCACAGTTGTGACTCGACCTGGTGAACGAACATTTATTTGGTTGTTGGCTTCCCTAATATAGTCTGAATACTTCAACTCTGTATTTAAGGTGGGTTTCAAGATGTAATTCATTCCTCGTGGCGTCTTTAGCTTTTTCTGATGTTCATCACTATTTCCACATTTCCTTAATTACAAGCTTTTGTTCGATTCATAAGCTATCGTCATATCTCCCATAGTAATCTAATCGTAGGCTTAATATTCCAATTTCATACCCTAATTGTCTTATTTCTTGATTATTGTGCGTTTTGTTCTAGTTAAACATATTTATAATCATGTACATTTTTGAATCCGATCGAACCATCAGATATAAAATCATGAAGAAGTTAGTACAAGTGTCTTATTGGGTCCTACCAAAAATTTTCTACTTAGCTAACTGGGATCTACTCTAAAAGTTATTTTCCGAGTCACTACGAT-ATTCTGGTCCCAAGGTCGATCAGTTAAAATCGAACGCATGTGTAACAATCACAAGGTCAAATCAAGTAGCATAGCAACCTGCGAGTAAATCTCTATTATGTCTAGTAATAACAAAACGGATATTGGCTTTTTGTCGTACATGAATAACAGGTTATATGAAGTAATAGAAAGATA]

[+] EMBL CD114900             [ATCCAAGCAGTTTCATTAGTCTTCACAGTTGTGACTCGACCTGGTGAACGAACATTTATTTGGTTGTTGGCTTCCCTAATATAGTCTGAATACTTCAACTCTGTATTTAAGGTGGGTTTCAAGATGTAATTCATTCCTCGTGGCGTCTTTAGCTTTTTCTGATGTTCATCACTATTTCCACATTTCCTTAATTACAAGCTTTTGTTCGATTCATAAGCTATCGTCATATCTCCCATAGTAATCTAATCGTAGGCTTAATATTCCAATTTCATACCCTAATTGTCTTATTTCTTGATTATTGTGCGTTTTGTTCTAGTTAAACATATTTATAATCATGTACATTTTTGAATCCGATCGAACCATCAGATATAAAATCATGAAGAAGTTAGTACAAGTGTCTTATTGGGTCCTACCAAAAATTTTCTACTTAGCTAACTGGGATCTACTCTAAAAGTTATTTTCCGAGTCACTACGAT ATTCTGGTCCCAAGGTCGATCAGTTAGAATCGAACGCATGTGTAACAATCACAAGGTCAAATCAAGTAGCATAGCAACCTGCGAGTAAATCTCTATTATGTCTAGTAATAACAAAACGGATATT                                                  ]
[-] EMBL CD114866             [                                                         ATTTGGTTGTCGGCTTCCCTAATATAGTCTGAATACTTCAACTCTGTATTTAAGGTGGGTTTCAAGATGTAATTCATTCCTCGTGGCGTCTTTAGCTTTTTCTGATGTTCATCACTATTTCCACATTTCCTTAATTACAAGCTTTTGTTCGATTCATAAGCTATCGTCATATCTCCCATAGTAATCTAATCGTAGGCTTAATATTCCAATTTCATACCCTAATTGTCTTATTTCTTGATTATTGTGCGTTTTGTTCTAGTTAAACATATTTATAATCATGTACATTTTTGAATCCGATCGAACCATCAGATATAAAATCATGAAGAAGTTAGTACAAGTGTCTTATTGGGTCCTACCAAAAATTTTCTACTTAGCTAACTGGGATCTACTCTAAAAGTTATTTTCCGAGTCACTACGAT ATTCTGGTCCCAAGGTCGATCAGTTAAAATCGAACGCATGTGTAACAATCACAAGGTCAAATCAAGTAGCATAGCAACCTGCGAGTAAATCTCTATTATGTCTAGTAATAACAAAACGGATATTGGCTTTTTGTCGTACATGAATAACAGGTTATATGAAGTAATAGAAAGATA]
[-] EMBL CD115063             [                                                                                             TTCAACTCTGTATNTAAGGTGGGTTTCAAGATGTAATTCATTCCTCGTGGCGTCTTTAGCTTTTTCTGATGTTCATCACTATTTCCACATTTCCTTAATTACAAGCTTTTGTTCGATTCATAAGCTATCGTCATATCTCCCATAGTAATCTAGTCGTAGGCTTAATATTCCAATTTCATACCCTAATTGTCTTATTTCTTGATTACTGTGCGTTTTGTTCTAGTTAAACATATTTATAATCATGTACATTTTTGAATCCGATCGAACCATCAGATATAAAATCATGAAGAAGTTAGTACAAGTGTCTTATTGGGTCCTACCAAAAATTTTCTACTTAGCTAACTGGGATCTACTCTAAAAGTTATTTTCCGAGTCACTACGAT ATTCTGGTCCCAAGGTCGATCAGTTAAAATCGAACGCATGTGTAACAATCACAAGGTCAAATCAAGTAGCATAGCAACCTGCGAGTAAATCTCTATTATGTCTAGTAATAACAAAACGGATATTGGCTTTTTGTCGTACGTGAATAACAGGTTATATGAAGTAATAGAAAGATA]
[-] EMBL CD201636             [                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCATACCGTAATTGTCTTATGTCTTGATTATTGTGCGTTATGTTCTAGTTAAACATATTTATAATCATGTACATTTTTGAATCCGATCGAACCATCAGATATAAAATCATGAAGAAGTTAGTACAAGTGTCTTATTGGGTCCTACCAAAAATTTTCTACTTAGCTAACTGGGATCTACTCTAAAAGTTATTTTCCGAGTCACTAC ATAATTATGGTCCCAAGGTCGATCAGTTAAAATCGAACGCATGTGTAACAATCACAAGGTCAAATCAAGTAGCATAGCAACCTGCGAGTAAATCTCTATTATGTCTAGTAATAACAAAACGGATATTGGCTTTTTGTCGTACATGAATAACAGGTTATATAACGTCCTCGNNAGATA]




>consensus_6068#0
ATCCAAGCAGTTTCATTAGTCTTCACAGTTGTGACTCGACCTGGTGAACGAACATTTATT
TGGTTGTTGGCTTCCCTAATATAGTCTGAATACTTCAACTCTGTATTTAAGGTGGGTTTC
AAGATGTAATTCATTCCTCGTGGCGTCTTTAGCTTTTTCTGATGTTCATCACTATTTCCA
CATTTCCTTAATTACAAGCTTTTGTTCGATTCATAAGCTATCGTCATATCTCCCATAGTA
ATCTAATCGTAGGCTTAATATTCCAATTTCATACCCTAATTGTCTTATTTCTTGATTATT
GTGCGTTTTGTTCTAGTTAAACATATTTATAATCATGTACATTTTTGAATCCGATCGAAC
CATCAGATATAAAATCATGAAGAAGTTAGTACAAGTGTCTTATTGGGTCCTACCAAAAAT
TTTCTACTTAGCTAACTGGGATCTACTCTAAAAGTTATTTTCCGAGTCACTACGATATTC
TGGTCCCAAGGTCGATCAGTTAAAATCGAACGCATGTGTAACAATCACAAGGTCAAATCA
AGTAGCATAGCAACCTGCGAGTAAATCTCTATTATGTCTAGTAATAACAAAACGGATATT
GGCTTTTTGTCGTACATGAATAACAGGTTATATGAAGTAATAGAAAGATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case