Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6104 cluster # 6104       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6104#0 length = 344 sequences # 4  

consensusID : consensus_6104#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 344
fasta sequence
                              [TCAACTTTTCATTGATGAAATTGGAAAGTGTGATCAAGTCACTTGTGCACATGTGATCTGAGTGAATGTGAAAATGTGGGCAGACAGAGCTTGAAGTGAGTGATGAGATGATGGATTGGATTGAGCGGTGATTCGATGATTTGATGGTGAAGTGATAAGTGATTTGTTCAGGGCATGTGATGATGATTTTCAGTGTTCTCGTAAATTCTGTTGAG-AAGACAAATAATATGAGGGCATTGACGATGCAAACTTATCATTGATGAAATTGGAAAGTGTGATC-AGCCACTTGTGCACATGTGATCTGAGTGAATGTGAAAATGTGGGCAGACAGAGCTTGAAGTGAG]

[+] EMBL CD140056             [TCAACTTTTCATTGATGAAATTGGAAAGTGTGATCAAGTCACTTGTGCACATGTGATCTGATTGCATGTGAAAATGTGGGCAGACAGAGCTTGAAGTGAGTGATGAGATGATGGATTGGATTGAGCGGTGACTCGATGATTTGATGGTGAAGTGATAAGTGATTTGTTCAGGGCATGTGATGATGATTTTCAGTGTTCTCGTAAATTCTGTTGAGAAAGACAA                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD139930             [                    TTGGAAAGTGTGATCAAGTCACTTGTGCACATGTGATCTGAGTGAATGTGAAAATGTGGGCAGACAGAGCTTGAAGTGAGTGATGAGATGATGGATTGGATTGAGCGGTGATTCGATGATTTGATGGTGAAGTGATAAGTGATTTGTTCAGGGCATGTGATGATGATTTTCAGTGTTCTCGTAAATTCTGTTGAG AAGACAAATAATATGAGGGCATTGACGATGCAAACTTATCATTGATGAAATTGGAAAGTGTGATC AGCCACTTGTGCACATGT                                              ]
[+] EMBL CD139890             [                    TTGGAAAGTGTGATCAAGTCACTTGTGCACATGTGATCTGAGTGAATGTGAAAATGTGGGCAGACAGAGCTTGAAGTGAGTGATGAGATGATGGATTGGATTGAGCGGTGATTCGATGATTTGATGGTGAAGTGATAAGTGATTTGTTCAGGGCATGTGATGATGATTTTC                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD144859             [                                               CACATGTGATCTGAGTGAATGTGAAAATGTGGGCAGACAGAGCTTGAAGTGAGTGATGAGATGATGGATTGGATTGAGCGGTGATTCGATGATTTGATGGTGAAGTGATAAGTGATTTGTTCAGGGCATGTGATGATGATTTTCAGTGTTCTCGTAAATTCTGTTGAG AAGACAAATAATATGAGGGCATTGACGATGCAAACTTATCATTGATGAAATTGGAAAGTGTGATCAAGTCACTTGTGCACATGTGATCTGAGTGAATGTGAAAATGTGGGCAGACAGAGCTTGAAGTGAG]


>consensus_6104#0 TCAACTTTTCATTGATGAAATTGGAAAGTGTGATCAAGTCACTTGTGCACATGTGATCTG AGTGAATGTGAAAATGTGGGCAGACAGAGCTTGAAGTGAGTGATGAGATGATGGATTGGA TTGAGCGGTGATTCGATGATTTGATGGTGAAGTGATAAGTGATTTGTTCAGGGCATGTGA TGATGATTTTCAGTGTTCTCGTAAATTCTGTTGAGAAGACAAATAATATGAGGGCATTGA CGATGCAAACTTATCATTGATGAAATTGGAAAGTGTGATCAGCCACTTGTGCACATGTGA TCTGAGTGAATGTGAAAATGTGGGCAGACAGAGCTTGAAGTGAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)