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Schistosoma mansoni
cluster # 6107 cluster # 6107       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6107#0 length = 414 sequences # 4  

consensusID : consensus_6107#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 414
fasta sequence
                              [ATTGTATCAATCTACCAGATTTAATAAATCATAATACTCCAATTCATTTGGTACATAATTCGAAAATCTTTGGAAGATTGTTTGTACTTGGAGCTAATTTAGATGCACGCAATGATCTAGGGTTGACTATTTTACATATGAAAGTACGCGATAACAATTTCGAAGATGTTTTGGCTTTATTAGTTCATGGTGCTGATCCAAATTTACGTGATAATAGTGGAGCAACTCCTTTACATTATGCCATGACTTATAATGCATCAATTCATACTATTCGTGCATTATTGGCATTTGAAGCGGATCCCTATGCTCTAAACAATAGTCAGCACAGTTGTCGACATTTATTATGTTGTAATGCTGACAGTTATATACCTTCACCTGATCGAGATTTAGCCTTGTACACTTTGGATGCATTAG]

[+] EMBL CD154528             [ATTGTATCAATCTACCAGATTTAATAAATCATAATACTCCAATTCATTTGGTACATAATTCGAAAATCTTTGGAAGATTGTTTGTACTTGGAGCTAATTTAGATGCACGCAATGGTCTAGGGTTGACTATTTTACATATGAAAGTACGCGATAACAATTTCGAAGATGTTTTGGCTTTATTAGTTCATGGTGCTGATCCAAATTTACGTGATAATAGTGGAGCAACTCCTTTACATTATGCCATGACTTATAATGCATCAATTCATACTATTCGTGCATTATTGGCATTTGAAGCGGATCCCTATGCTCTAAACAATAGTCAGCACAGTTGTCGACATTTATTATGTTGNTATGCTGACAGTTATATACCTTCACCTGATCGAGATTTAGCCTTGTACACTTTGGATGCATTAn]
[+] EMBL CD154508             [ATTGTATCAATCTACCAGATTTAATAAATCATAATACTCCAATTCATTTGGTACATAATTCGAAGATCTTTGGAAGATTGTTTGTACTTGGAGCTAATTTAGATGCACGCAGTGATCTAGGGTTGACTATTTTACATATGAAAGTACGCGATAACAATTTCGAAGATGTTTTGGCTTTATTAGTTCATGGTGCTGATCCAAATTTACGTGATAATAGTGGAGCAACTCCTTTACATTATGCCATGACTTATAATGCATCAATTCATACTATTCGTGCATTATTGGCATTTGAAGCGGATCCCTATGCTCTAAACAATAGTCGGCACAGTTGTCGACATTTATTATGTTGTAATGCTGACAGTTATATACCTTCACCTGATCGAGATTTAGCCTTGTACACTTTGGATGCATTAG]
[+] EMBL CD116128             [ATTGTATCAATCTACCAGATTTAATAAATCATAATACTCCAATTCATTTGGTACATAATTCGAAAATCTTTGGAAGATTGTTTGTACTTGGAGCTAATTTAGATGCACGCAATGATCTAGGGTTGACTATTTTACATATGAAAGTACGCGATAACAATTTCGAAGATGTTTTGGCTTTATTAGTTCATGGTGCTGATCCAAATTTACGTGATAATAGTGGAGCAACTCCTTTACATTATGCCATGACTTATAATGCATCAATTCATACTATTCGTGCATTATTGGCATTTGAAGCGGATCCCTATGCTCTAAACAATAGTCAGCACAGTTGTCGACATTTATTATGTTGTAATGCTGACAGTTATATACCTTCACCTGATCGAGATTTAGCCTTGTACACTTTGGATGCATTAG]
[+] EMBL CD116085             [ATTGTATCAATCTACCAGATTTAATAAATCATAATACTCCAATTCATTTGGTACATAATTCGAAAATCTTTGGAAGATTGTTTGTACTTGGAGCTAATTTAGATGCACGCAATGATCTAGGGTTGACTATTTTACATATGAAAGTACGCGATAACAATTTCGAAGATGTTTTGGCTTTATTAGTTCATGGTGCTGATCCAAATTTACGTGATAATAGTGGAGCAACTCCTTTACATTATGCCATGACTTATAATGCATCAATTCATACTATTCGTGCATTATTGGCATTTGAAGCGGATCCCTATGCTCTAAACAATAGTCAGCACAGTTGTCGACATTTATTATGTTGTAATGCTGACAGTTATATACCTTCACCTGATCGAGATTTAGCCTTGTACACTTTGGATGCATTAG]


>consensus_6107#0 ATTGTATCAATCTACCAGATTTAATAAATCATAATACTCCAATTCATTTGGTACATAATT CGAAAATCTTTGGAAGATTGTTTGTACTTGGAGCTAATTTAGATGCACGCAATGATCTAG GGTTGACTATTTTACATATGAAAGTACGCGATAACAATTTCGAAGATGTTTTGGCTTTAT TAGTTCATGGTGCTGATCCAAATTTACGTGATAATAGTGGAGCAACTCCTTTACATTATG CCATGACTTATAATGCATCAATTCATACTATTCGTGCATTATTGGCATTTGAAGCGGATC CCTATGCTCTAAACAATAGTCAGCACAGTTGTCGACATTTATTATGTTGTAATGCTGACA GTTATATACCTTCACCTGATCGAGATTTAGCCTTGTACACTTTGGATGCATTAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)