These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6122#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 789 fasta sequence [ATGGTAGATAATTATATAACTACTTCATTGTTGTGCAAATGCAAGCATGTCCATTAAATTCCAAAGATTTGTTAAAATTACGTTGTCGATTTCGTACTGGACAGTATACTTTGAATGATTTAACTTCTGATTCAACTATTGATGAACTATTGCAAACAATTACTTCACTTATAGGTGTTACACAATCTCGTATATCACTTTATTATGGTTATCCTCCAAAAAAGTTGGATTGTAGCATTTCAAGTCTTAGTAAGCATCTTTGGGAGATCCCTATTCGTTCGGGTGACATGCTTACTGTTGATGTAACAGAAGAAAAACCAGCGAACGTCAATTCACAAAATGTAAAACTTCAATCTCATAAGCATGAAATAATCTCTAATAAACAATCTGAATCACATATTGTTCGATTATGTGCACCATCTGATAATTCTTGTCTATTTACAAGTGTTCTTTTCTGTATGAATAATGAAGATAATCATTTAAAAATTGGTACAAAAGTTATAACAAATATTGCTGAAGTCAGTAATTTAAGAGAATTAATTTCTGGTATTGTGTTAAGTGATCCAATCAAGTATTCTGAAGCATTCCTTGGGATGTCAAATGAACAATATTCAAATCAAATTAGACAATCAGATAAATGGGGTGGAGGTATTGAAGTATCCATTTTATCACAATTATATAGAATTGAAATATGTATTGTAGATATTGAATCATGTCGAATTGATCGTTTTGGTGAAGATCAAAATTACCCTAAACGAATATTATTGATTTATGATGGTATACATTATG] [+] EMBL CD140144 [ATGGTAGATAATTATATAACTACTTCATTGTTGTGCAAATGCAAGCATGTCCATTAAATTCCAAAGATTTGTTAAAATTACGTTGTCGATTTCGTACTGGACAGTATACTTTGAATGATTTAACTTCTGATTCAACTATTGATGAACTATTGCAAACAATTACTTCACTTATAGGTGTTACACAATCTCGTATATCACTTTATTATGGTTATCCTCCAAAAAAGTTGGATTGTAGCATTTCAAGTCTTAGTAAGCATCTTTGGGAGATCCCTATTCGTTCGGGTGACATGCTTACTGTTGATGTAACAGAAGAAAAACCAGCGAACGTCAATTCACAAAATGTAAAACTTCAATCTCATAAGCATGAAATAATCTCTAATAAACAATCTGAATCACATATTGTTCGATTATGTGCACCATCTGATAATTCTTGTCTA ] [+] EMBL CD140089 [ATGGTAGATTATTATATAACTACTTCATTGTTGTGCAAATGCAAGCATGTCCATTAAATTCCAAAGATTTGTTAAAATTACGTTGTCGATTTCGTACTGGACAGTATACTTTGAATGATTTAACTTCTGATTCAACTATTGATGAACTATTGCAAACAATTACTTCACTTATAGGTGTTACACAATCTCGTATATCACTTTATTATGGTTATCCTCCAAAAAAGTTGGATTGTAGCATTTCAAGTCTTAGTAAGCATCTTTGGGAGATCCCTATTCGTTCGGGTGACATGCTTACTGTTGATGTAACAGAAGAAAAACCAGCGAACGTCAATTCACAAAATGTAGAACTTCAATCTCATAAGCATGAAATAATCTCTAATAAACAATCTGAATCACATATTGTTCGATTATGTTCACCATCTGATAATTCTTG ] [+] EMBL CD140069 [ATGGTAGATAATTATATAACTACTTCATTGTTGTGCAAATGCAAGCATGTCCATTAAATTCCAAAGATTTGTTAAAATTACGTTGTCGATTTCGTACTGGACAGTATACTTTGAATGATTTAACTTCTGATTCAACTATTGATGAACTATTGCAAACAATTACTTCACTTATAGGTGTTACACAATCTCGTATATCACTTTATTATGGTTATCCTCCAAAAAAGTTGGATTGTAGCATTTCAAGTCTTAGTAAGCATCTTTGGGAGATCCCTATTCGTTCGGGTGACATGCTTACTGTTGATGTAACAGAAGAAAAACCAGCGAACGTCAATTCACAAAATGTTAAACTTCAATCTCATAAGCATGAAATAATCTCTAATAAACAATCTGAATCACATATTGT ] [-] EMBL CD140168 [ CATGAAATAATCTCTAATAAACAATCTGAATCACATATTGTTCGATTATGTGCACCATCTGATAATTCTTGTCTATTTACAAGTGTTCTTTTCTGTATGAATAATGAAGATAATCATTTAAAAATTGGTACAAAAGTTATAACAAATATTGCTGAAGTCAGTAATTTAAGAGAATTAATTTCTGGTATTGTGTTAAGTGATCCAATCAAGTATTCTGAAGCATTCCTTGGGATGTCAAATGAACAATATTCAAATCAAATTAGACAATCAGATAAATGGGGTGGAGGTATTGAAGTATCCATTTTATCACAATTATATAGAATTGAAATATGTATTGTAGATATTGAATCATGTCGAATTGATCGTTTTGGTGAAGATCAAAATTACCCTAAACGAATATTATTGATTTATGATGGTATACATTATG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||