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Schistosoma mansoni
cluster # 6122 cluster # 6122       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6122#0 length = 789 sequences # 4  

consensusID : consensus_6122#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 789
fasta sequence
                              [ATGGTAGATAATTATATAACTACTTCATTGTTGTGCAAATGCAAGCATGTCCATTAAATTCCAAAGATTTGTTAAAATTACGTTGTCGATTTCGTACTGGACAGTATACTTTGAATGATTTAACTTCTGATTCAACTATTGATGAACTATTGCAAACAATTACTTCACTTATAGGTGTTACACAATCTCGTATATCACTTTATTATGGTTATCCTCCAAAAAAGTTGGATTGTAGCATTTCAAGTCTTAGTAAGCATCTTTGGGAGATCCCTATTCGTTCGGGTGACATGCTTACTGTTGATGTAACAGAAGAAAAACCAGCGAACGTCAATTCACAAAATGTAAAACTTCAATCTCATAAGCATGAAATAATCTCTAATAAACAATCTGAATCACATATTGTTCGATTATGTGCACCATCTGATAATTCTTGTCTATTTACAAGTGTTCTTTTCTGTATGAATAATGAAGATAATCATTTAAAAATTGGTACAAAAGTTATAACAAATATTGCTGAAGTCAGTAATTTAAGAGAATTAATTTCTGGTATTGTGTTAAGTGATCCAATCAAGTATTCTGAAGCATTCCTTGGGATGTCAAATGAACAATATTCAAATCAAATTAGACAATCAGATAAATGGGGTGGAGGTATTGAAGTATCCATTTTATCACAATTATATAGAATTGAAATATGTATTGTAGATATTGAATCATGTCGAATTGATCGTTTTGGTGAAGATCAAAATTACCCTAAACGAATATTATTGATTTATGATGGTATACATTATG]

[+] EMBL CD140144             [ATGGTAGATAATTATATAACTACTTCATTGTTGTGCAAATGCAAGCATGTCCATTAAATTCCAAAGATTTGTTAAAATTACGTTGTCGATTTCGTACTGGACAGTATACTTTGAATGATTTAACTTCTGATTCAACTATTGATGAACTATTGCAAACAATTACTTCACTTATAGGTGTTACACAATCTCGTATATCACTTTATTATGGTTATCCTCCAAAAAAGTTGGATTGTAGCATTTCAAGTCTTAGTAAGCATCTTTGGGAGATCCCTATTCGTTCGGGTGACATGCTTACTGTTGATGTAACAGAAGAAAAACCAGCGAACGTCAATTCACAAAATGTAAAACTTCAATCTCATAAGCATGAAATAATCTCTAATAAACAATCTGAATCACATATTGTTCGATTATGTGCACCATCTGATAATTCTTGTCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD140089             [ATGGTAGATTATTATATAACTACTTCATTGTTGTGCAAATGCAAGCATGTCCATTAAATTCCAAAGATTTGTTAAAATTACGTTGTCGATTTCGTACTGGACAGTATACTTTGAATGATTTAACTTCTGATTCAACTATTGATGAACTATTGCAAACAATTACTTCACTTATAGGTGTTACACAATCTCGTATATCACTTTATTATGGTTATCCTCCAAAAAAGTTGGATTGTAGCATTTCAAGTCTTAGTAAGCATCTTTGGGAGATCCCTATTCGTTCGGGTGACATGCTTACTGTTGATGTAACAGAAGAAAAACCAGCGAACGTCAATTCACAAAATGTAGAACTTCAATCTCATAAGCATGAAATAATCTCTAATAAACAATCTGAATCACATATTGTTCGATTATGTTCACCATCTGATAATTCTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD140069             [ATGGTAGATAATTATATAACTACTTCATTGTTGTGCAAATGCAAGCATGTCCATTAAATTCCAAAGATTTGTTAAAATTACGTTGTCGATTTCGTACTGGACAGTATACTTTGAATGATTTAACTTCTGATTCAACTATTGATGAACTATTGCAAACAATTACTTCACTTATAGGTGTTACACAATCTCGTATATCACTTTATTATGGTTATCCTCCAAAAAAGTTGGATTGTAGCATTTCAAGTCTTAGTAAGCATCTTTGGGAGATCCCTATTCGTTCGGGTGACATGCTTACTGTTGATGTAACAGAAGAAAAACCAGCGAACGTCAATTCACAAAATGTTAAACTTCAATCTCATAAGCATGAAATAATCTCTAATAAACAATCTGAATCACATATTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD140168             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CATGAAATAATCTCTAATAAACAATCTGAATCACATATTGTTCGATTATGTGCACCATCTGATAATTCTTGTCTATTTACAAGTGTTCTTTTCTGTATGAATAATGAAGATAATCATTTAAAAATTGGTACAAAAGTTATAACAAATATTGCTGAAGTCAGTAATTTAAGAGAATTAATTTCTGGTATTGTGTTAAGTGATCCAATCAAGTATTCTGAAGCATTCCTTGGGATGTCAAATGAACAATATTCAAATCAAATTAGACAATCAGATAAATGGGGTGGAGGTATTGAAGTATCCATTTTATCACAATTATATAGAATTGAAATATGTATTGTAGATATTGAATCATGTCGAATTGATCGTTTTGGTGAAGATCAAAATTACCCTAAACGAATATTATTGATTTATGATGGTATACATTATG]


>consensus_6122#0 ATGGTAGATAATTATATAACTACTTCATTGTTGTGCAAATGCAAGCATGTCCATTAAATT CCAAAGATTTGTTAAAATTACGTTGTCGATTTCGTACTGGACAGTATACTTTGAATGATT TAACTTCTGATTCAACTATTGATGAACTATTGCAAACAATTACTTCACTTATAGGTGTTA CACAATCTCGTATATCACTTTATTATGGTTATCCTCCAAAAAAGTTGGATTGTAGCATTT CAAGTCTTAGTAAGCATCTTTGGGAGATCCCTATTCGTTCGGGTGACATGCTTACTGTTG ATGTAACAGAAGAAAAACCAGCGAACGTCAATTCACAAAATGTAAAACTTCAATCTCATA AGCATGAAATAATCTCTAATAAACAATCTGAATCACATATTGTTCGATTATGTGCACCAT CTGATAATTCTTGTCTATTTACAAGTGTTCTTTTCTGTATGAATAATGAAGATAATCATT TAAAAATTGGTACAAAAGTTATAACAAATATTGCTGAAGTCAGTAATTTAAGAGAATTAA TTTCTGGTATTGTGTTAAGTGATCCAATCAAGTATTCTGAAGCATTCCTTGGGATGTCAA ATGAACAATATTCAAATCAAATTAGACAATCAGATAAATGGGGTGGAGGTATTGAAGTAT CCATTTTATCACAATTATATAGAATTGAAATATGTATTGTAGATATTGAATCATGTCGAA TTGATCGTTTTGGTGAAGATCAAAATTACCCTAAACGAATATTATTGATTTATGATGGTA TACATTATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)