These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6124#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 545 fasta sequence [GAACCACATAAGGGAACTAAAAGCAATCTGTTCAACTCAACATACATATAGATATTTATATTTTATATCGATGGCAAACAAACTTAAAGTGTGCGACAAGTGAGTGAGAATTTAAAAAACATAAAGCACATCCAAGGACAATAATAATAATCGTGAAAATATTAATTGTCAATGTGAAACAATGAAGATGACTAAAGAGACCCACTAGTTCTGAGAAATTTATTGATAACTATATATTGTGTATTTGTGTAGAAGGAAGAATATATAT-AAGTATCCATTTCGTTCTAAATCTTAATTTAAAAGGTAAAATAATTATGATTCTCGCACGGATGGACAGAATAGTTTTTATTATTATTATTATATGACCGGATATAATTATATAAGGAAAAGAAACAACCAAATAATGATTATAATAATTTAATTGTTTAAGGAATAATTTCTCGATTAAATGCATCGGTATACTTTGTTGATTAATTAAATAATTAATTAGTTAATTTAGAATAAAATGCACATTCACAAAACACAATATTTACATAGATTATACA] [-] EMBL SMAA85766 [GAACCACATAAGGGAACTAAAAGCAATCTGTTCAACTCAACATACATATAGATATTTATATTTTATATCGATGGCAAACAAACTTAAAGTGTGCGACAAGTGAGTGAGAATTTAAAAAACATAAAGCACATCCAAGGACAATAATAATAATCGTGAAAATATTAATTGTCAATGTGAAACAATGAAGATGACTAAAGAGACCCACTAGTTCTGAGAAATTTATTGATAACTATATATTGTGTATTTGTGTAGAAGGAAGAATATATAT AAGTATCCATTTCGTTCTAAATCTTAATTTAAAAGGTAAAATAATTATGATTCTCGCACGGATGGACAGAATAGTTTTT ] [+] EMBL BF936658 [GAACCACATAAGGGAACTAAAAGCAATCTGTTCAACTCAACATACATATAGATATTTATATTTTATATCGATGGCAAACAAACTTAAAGTGTGCGACAAGTGAGTGAGAATTTAAAAAACATAAAGCACATCCAAGGACAATAATAATAATCGTGAAAATATTAATTGTCAATGTGAAACAATGAAGATGACTAAAGAGACCCACTAGTTCTGAGAAATTTATTGATAACTATATATTGTGTATTTGTGTAGAAGGAAGAAT ] [+] EMBL CD159537 [ tATCGTGAAAATATTAATTGTCAATGTGAAACAATGAAGATGACTAAAGAGACCCACTAGTTCTGAGAAATTTATTGATAACTATATATTGTGTATTTGTGTATAAGGAGGAATATATATCACGTATCCATTTCGTTCTAAATCTTAATTTAAAAGGTAAAATAGTTATGATTCTCGCACGGATGGACAGAATAGTTTTTATTATTATTATTATATGACCGGATATAATTATATAAGGAAAAGAAACAACCAAATAATGATTATAATAATTTAATTGTTTAAGGAATAATTTCTCGATTAAATGCATCGGTATACTTTGTTGATTAATTAAATAATTAATTAGTTAATTTAGAATAAAATGCACATTCA ] [-] EMBL CD159532 [ GAAGATGACTAAAGAGACCCACTAGTTCTGAGAAATTTATTGATAACTATATATTGTGTATTTGTGTAGAAGGAAGAATATATAT AAGTATCCATTTCGTTCTAAATCTTAATTTAAAAGGTAAAATAATTATGATTCTCGCACGGATGGACAGAATAGTTTTTATTATTATTATTATATGACCGGATATAATTATATAAGGAAAAGAAACAACCAAATAATGATAATAATAATTTAATTGTTTAAGGAATAATTTCTCGATTAAATGCATCGGTATACTTTGTTGATTAATTAAATAATTAATTAGTTAATTTAGAATAAAATGCACATTCACAAAACACAATATTTACATAGATTATACA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||