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Schistosoma mansoni
cluster # 6141 cluster # 6141       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6141#0 length = 1065 sequences # 4  

consensusID : consensus_6141#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1065
fasta sequence
                              [TTGTAAGGCACATAATTTTACTGCCATCCATCAACTCTACGCTTCTACATGCTTGGGTGTGTATGAGTCAGTTAAATAAACAAAGAGTAAACGTACTCTTTGTAACGGTAATAATTTCGCTTCGGTGCTGTTGTTGTAAGTGCGATGACTTACTGTGCTACAGTGACATTTGTTGTTTTTCCAGTAGACATAAGCTTATTTTTTGATCATCTCAGTAGACTTTATTTCTCATTTTGTAGATATCTGAGTGCATGGAAGCCCTCAGACAGGCGGAAACAAAGCTTTGTAGATTTGTTCCAACAAATCAGTTAACAGTAAAAGGTGTGGGTAACTTCCACGGCCGAGTTTTATATGCAGCAGTTGAGTCCAATGAAAATTTGAATTTGTTTGTCGATCAGCTAAATCAGATTCTACATGTGGCCGGATTCCATACCGATGATCCGAAAAAGTTTAAACCTCATATCTCTCTGATGAAGATGAATCGTTCAGTATCAAAAAAAGTTGGTACGAAAAAAGTCGACCCCAATCTGTGTGGTGAATTTCTAGATACGGAGTTTGGAGTATTCACTCTAGATTCAATTTACCTGTGTGCAATGGGAAGACACCATGATGATGATGGTGGTTTCTATCGTACTATCGGAAATTTACATCTTGTAAATCCGATTTCTAAATAAGGTGATTTTTGTAAACTTACTGTATATTTCCCGTGATATTTTAATAACTTTTTCCTCGAGTCAACCAAATATTAGTGTTGTCCATTATTTTATTTCTCAAAATCTTGATTTCAGTAGCTATACAATGTATACTGTTAAATATTTTTCTGGTCGCAGTTTACTCACACGGTTACATTATCAGTTTTAATAATCACTGTTTTAGGGGTGGACAGTTTCGTCTACGAACAGTAGCAAAATATTGCCTACTTGCACGTCCCAAGAAGCTTTAAAACTCATATTGCTTGTCAGCAGCCCTCTTCATCTTTTGAGTTCCTCTTACATTTGTTGTTTTCATGTCGATATTGTGAATATGACTGCTATTACAACCATTTAATTTATAACTAACTAAAAA]

[+] EMBL CD140338             [TTGTAAGGCACATAATTTTACTGCCATCCATCAACTCTACGCTTCTACATGCTTGGGTGTGTATGAGTCAGTTAAATAAACAAAGAGTAAACGTACTCTTTGTAACGGTAATAATTTCGCTTCGGTGCTGTTGTTGTAAGTGCGATGACTTACTGTGCTACAGTGACATTTGTTGTTTTTCCAGTAGACATAAGCTTATTTTTTGATCATCTCAGTAGACTTTATTTCTCATTTTGTAGATATCTGAGTGCATGGAAGCCCTCAGACAGGCGGAAACAAAGCTTTGTAGATTTGTTCCAACAAATCAGTTAACAGTAAAAGGTGTGGGTAACTTCCACGGCCGAGTTTTATATGCAGCAGTTGAGTCCAATGAAAATTTGAATTTGTTTGTCGATCAGCTAAATCAGATTCTACATGTGGCCGGATTCCATACCGATGATCCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD187337             [                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCTTTGTAGATTGGTTCCAACAAATCAGTTAACAGTAAAAGGTGTGGGTAACTTCCACGGCCGAGTTTTATATGCAGCAGTTGAGTCCAATGAAAATTTGAATTTGTTTGTCGATCAGCTAAATCAGATTCTACATGTGGCCGGATTCCATACAGATGATCAGAAAAAGTTTAAACCTCATATCTCTCTGATGAAGATGAATCGTTCAGTATCAAAAAAAGTTGGTACGAAAAAAGTCGACCCCAATCTGTGTGGTGAATTTCTAGATACGGAGTTTGGAGTATTCACTCTAGATTCAATTTACCTGTGTGCAATGGGAAGACACCATGATGATGATGGTGGTTTCTATCGTACTATCGGAAATTTACATCTTGTAAATCCGATTTCTAAATAAGGTGATTTTTGTAAACTTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD140390             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGAGTATTCACTCTAGATTCAATTGACCTGTGTGCAATGGGAAGACACCATGATGATGATGGTGGTTTCTATCGTACTATCGGAAATTTACATCTTGTAAATCCGATTTCTAAATAAGGTGATTTTTGTAAACTTACTGTATATTTCCCGTGATATTTTAATAACTTTTTCCTCGAGTCAACCAAATATTAGTGTTGTCCATTATTTTATTTCTCAAAATCTTGATTTCAGTAGCTATACAATGTATACTGTTAAATATTTTTCTGGTCGCAGTTTACTCACACGGTTACATTATCAGTTTTAATAATCACTGTTTTAGGGGTGGACAGTTTCGTCTACGAACAGTAGCAAAATATTGCCTACTTGCACGTCCCAAGAAGCTTTAAAACTCATATTGCTTGTCAGCAGCCCTCTTCATCT                                                                                        ]
[-] EMBL CD183159             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 nATCAGTTTTAATAATCACTGTTTTAGGGGTGGACAGTTTCGTCTACGAACAGTAGCAAAGTATTGCCTACTTGCACGTCCCAAGAAGCTTTAAAACTCATATTGCTTGTCAGCAGCCCTCTTCATCTTTTGAGTTCCTCTTACATTTGTTGTTTTCATGTCGATATTGTGAATATGACTGCTATTACAACCATTTAATTTATAACTAACTAAAAA]


>consensus_6141#0 TTGTAAGGCACATAATTTTACTGCCATCCATCAACTCTACGCTTCTACATGCTTGGGTGT GTATGAGTCAGTTAAATAAACAAAGAGTAAACGTACTCTTTGTAACGGTAATAATTTCGC TTCGGTGCTGTTGTTGTAAGTGCGATGACTTACTGTGCTACAGTGACATTTGTTGTTTTT CCAGTAGACATAAGCTTATTTTTTGATCATCTCAGTAGACTTTATTTCTCATTTTGTAGA TATCTGAGTGCATGGAAGCCCTCAGACAGGCGGAAACAAAGCTTTGTAGATTTGTTCCAA CAAATCAGTTAACAGTAAAAGGTGTGGGTAACTTCCACGGCCGAGTTTTATATGCAGCAG TTGAGTCCAATGAAAATTTGAATTTGTTTGTCGATCAGCTAAATCAGATTCTACATGTGG CCGGATTCCATACCGATGATCCGAAAAAGTTTAAACCTCATATCTCTCTGATGAAGATGA ATCGTTCAGTATCAAAAAAAGTTGGTACGAAAAAAGTCGACCCCAATCTGTGTGGTGAAT TTCTAGATACGGAGTTTGGAGTATTCACTCTAGATTCAATTTACCTGTGTGCAATGGGAA GACACCATGATGATGATGGTGGTTTCTATCGTACTATCGGAAATTTACATCTTGTAAATC CGATTTCTAAATAAGGTGATTTTTGTAAACTTACTGTATATTTCCCGTGATATTTTAATA ACTTTTTCCTCGAGTCAACCAAATATTAGTGTTGTCCATTATTTTATTTCTCAAAATCTT GATTTCAGTAGCTATACAATGTATACTGTTAAATATTTTTCTGGTCGCAGTTTACTCACA CGGTTACATTATCAGTTTTAATAATCACTGTTTTAGGGGTGGACAGTTTCGTCTACGAAC AGTAGCAAAATATTGCCTACTTGCACGTCCCAAGAAGCTTTAAAACTCATATTGCTTGTC AGCAGCCCTCTTCATCTTTTGAGTTCCTCTTACATTTGTTGTTTTCATGTCGATATTGTG AATATGACTGCTATTACAACCATTTAATTTATAACTAACTAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)