These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6141#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1065 fasta sequence [TTGTAAGGCACATAATTTTACTGCCATCCATCAACTCTACGCTTCTACATGCTTGGGTGTGTATGAGTCAGTTAAATAAACAAAGAGTAAACGTACTCTTTGTAACGGTAATAATTTCGCTTCGGTGCTGTTGTTGTAAGTGCGATGACTTACTGTGCTACAGTGACATTTGTTGTTTTTCCAGTAGACATAAGCTTATTTTTTGATCATCTCAGTAGACTTTATTTCTCATTTTGTAGATATCTGAGTGCATGGAAGCCCTCAGACAGGCGGAAACAAAGCTTTGTAGATTTGTTCCAACAAATCAGTTAACAGTAAAAGGTGTGGGTAACTTCCACGGCCGAGTTTTATATGCAGCAGTTGAGTCCAATGAAAATTTGAATTTGTTTGTCGATCAGCTAAATCAGATTCTACATGTGGCCGGATTCCATACCGATGATCCGAAAAAGTTTAAACCTCATATCTCTCTGATGAAGATGAATCGTTCAGTATCAAAAAAAGTTGGTACGAAAAAAGTCGACCCCAATCTGTGTGGTGAATTTCTAGATACGGAGTTTGGAGTATTCACTCTAGATTCAATTTACCTGTGTGCAATGGGAAGACACCATGATGATGATGGTGGTTTCTATCGTACTATCGGAAATTTACATCTTGTAAATCCGATTTCTAAATAAGGTGATTTTTGTAAACTTACTGTATATTTCCCGTGATATTTTAATAACTTTTTCCTCGAGTCAACCAAATATTAGTGTTGTCCATTATTTTATTTCTCAAAATCTTGATTTCAGTAGCTATACAATGTATACTGTTAAATATTTTTCTGGTCGCAGTTTACTCACACGGTTACATTATCAGTTTTAATAATCACTGTTTTAGGGGTGGACAGTTTCGTCTACGAACAGTAGCAAAATATTGCCTACTTGCACGTCCCAAGAAGCTTTAAAACTCATATTGCTTGTCAGCAGCCCTCTTCATCTTTTGAGTTCCTCTTACATTTGTTGTTTTCATGTCGATATTGTGAATATGACTGCTATTACAACCATTTAATTTATAACTAACTAAAAA] [+] EMBL CD140338 [TTGTAAGGCACATAATTTTACTGCCATCCATCAACTCTACGCTTCTACATGCTTGGGTGTGTATGAGTCAGTTAAATAAACAAAGAGTAAACGTACTCTTTGTAACGGTAATAATTTCGCTTCGGTGCTGTTGTTGTAAGTGCGATGACTTACTGTGCTACAGTGACATTTGTTGTTTTTCCAGTAGACATAAGCTTATTTTTTGATCATCTCAGTAGACTTTATTTCTCATTTTGTAGATATCTGAGTGCATGGAAGCCCTCAGACAGGCGGAAACAAAGCTTTGTAGATTTGTTCCAACAAATCAGTTAACAGTAAAAGGTGTGGGTAACTTCCACGGCCGAGTTTTATATGCAGCAGTTGAGTCCAATGAAAATTTGAATTTGTTTGTCGATCAGCTAAATCAGATTCTACATGTGGCCGGATTCCATACCGATGATCCG ] [-] EMBL CD187337 [ GCTTTGTAGATTGGTTCCAACAAATCAGTTAACAGTAAAAGGTGTGGGTAACTTCCACGGCCGAGTTTTATATGCAGCAGTTGAGTCCAATGAAAATTTGAATTTGTTTGTCGATCAGCTAAATCAGATTCTACATGTGGCCGGATTCCATACAGATGATCAGAAAAAGTTTAAACCTCATATCTCTCTGATGAAGATGAATCGTTCAGTATCAAAAAAAGTTGGTACGAAAAAAGTCGACCCCAATCTGTGTGGTGAATTTCTAGATACGGAGTTTGGAGTATTCACTCTAGATTCAATTTACCTGTGTGCAATGGGAAGACACCATGATGATGATGGTGGTTTCTATCGTACTATCGGAAATTTACATCTTGTAAATCCGATTTCTAAATAAGGTGATTTTTGTAAACTTACTG ] [-] EMBL CD140390 [ GGAGTATTCACTCTAGATTCAATTGACCTGTGTGCAATGGGAAGACACCATGATGATGATGGTGGTTTCTATCGTACTATCGGAAATTTACATCTTGTAAATCCGATTTCTAAATAAGGTGATTTTTGTAAACTTACTGTATATTTCCCGTGATATTTTAATAACTTTTTCCTCGAGTCAACCAAATATTAGTGTTGTCCATTATTTTATTTCTCAAAATCTTGATTTCAGTAGCTATACAATGTATACTGTTAAATATTTTTCTGGTCGCAGTTTACTCACACGGTTACATTATCAGTTTTAATAATCACTGTTTTAGGGGTGGACAGTTTCGTCTACGAACAGTAGCAAAATATTGCCTACTTGCACGTCCCAAGAAGCTTTAAAACTCATATTGCTTGTCAGCAGCCCTCTTCATCT ] [-] EMBL CD183159 [ nATCAGTTTTAATAATCACTGTTTTAGGGGTGGACAGTTTCGTCTACGAACAGTAGCAAAGTATTGCCTACTTGCACGTCCCAAGAAGCTTTAAAACTCATATTGCTTGTCAGCAGCCCTCTTCATCTTTTGAGTTCCTCTTACATTTGTTGTTTTCATGTCGATATTGTGAATATGACTGCTATTACAACCATTTAATTTATAACTAACTAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||