Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6145 cluster # 6145       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6145#0 length = 442 sequences # 4  

consensusID : consensus_6145#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 442
fasta sequence
                              [ATAGCGCTGGGAA-ATAGAAGCAGATATGA-AA-GGGATGAATAACAACTAGAAAAAACTGGAAGGGAATGCACAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTAGTGGGCTGACTATGCTCCTTCACGAGGGGGTAACAAGCGTAAGAAAGTAATTTAACAAGGTAACTAATATAATGCTTTATAATCTGAAAATAATAAATATGAAACTCTCTTGCAATAGATTAATTGAGCGTACTATCTATATTAGATCTTCTCTATTGTACTAGTTACGCTATTTCTAAATCACTTCAATGATAATCATCACTTTTTCTCCTAATGCTTAATAATAGTACTTACAAGACATTGCTTGAATTTCTTGATAGATAAGTTGAAATCTCATAATTCACTTAAGCCAAAAATAATTTTAATGGTTGATATCATGATTCAATCGAAGCTAGAACATCATTG]

[+] EMBL CD160055             [ATAGCGCTGGGAA ATAGAAGCAGATATGA AA GGGATGAATAACAACTAGAAAAAACTGGAAGGGAATGCACAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTAGTGGGCTGACTATGCTCCTTCACGAGGGGGTAACAAGCGTAAGAAAGTAATTTAACAAGGTAACTAATATAATGCTTTATAATCTGAAAATAATAAATATGAAACTCTCTTGCAATAGATTAATTGAGCGTACTATCTATATTAGATCTTCTCTATTGTACTAGTTACGCTATTTCTAAATCACTTCAATGATAATCATCACTTTTTCTCCTAATGCTTAATAATAGTACTTACAAGACATTGCTTGAATTTCTTGATAGATAAGTTGAAATCTCATAATTCACTTAAGCCAAAAATAATTTTAATGGTTGATATCATGATTCAATCGAAGCTAGAACATCATTG]
[+] EMBL CD160354             [ATAGCGCTGGGAA ATAGAAGCAGATATGA AA GGGATGAATAACAACTAGAAAAAACTGGAAGGGAATGCACAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTAGTGGGCTGACTATGCTCCTTCACGAGGGGGTAACAAGCGTAAGAAAGTAATTTAACAAGGTAACTAATATAATGCTTTATAATCTGAAAATAATAAATATGAAACTCTCTTGCAATAGATTAATTGAGCGTACTATCTATATTAGATCTTCTCTATTGTACTAGTTACGCTATTTCTAAATCACTTCAATGATAATCATCACTTTTTCTCCTAATGCTTAATAATAGTACTTACAAGACATTGCTTGAATTTCTTGATAGATAAGTTGAAATCTCATAATTCACTTAAGCCAAAAATAATTTTAATGGTTGATATCATGATTCAATCGAAGCTAGACCA      ]
[+] EMBL CD160270             [ATAGCGCTGGGAA ATAGAAGCAGATATGA AA GGGATGAATAACAACTAGAAAAAACTGGAAGGGAATGCACAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTAGTGGGCTGACTATGCTCCTTCACGAGGGGGTAACAAGCGTAGGAAAGTAATTTAACAAGGTAACTAATATAATGCTTTATAATCTGAAAATAATAAATATGAAACTCTCTTGCAATAGATTAATTGAGCGTACTATCTATATTAGATCTTCTCTATTGTACTAGTTACGCTATTTCTAAATCACTTCAATGATAATCATCACTTTTTCTCCTAATGCTTAATAATAGTACTTACAAGACATTGCTTGAATTTCTTGATAGATAAGTTGAAATCTCATAATTCACTTAAGCCAAAAATAATTTT                                          ]
[+] EMBL CD160083             [ATAGCGCTGGGAATATAGAAGCAGATATGACAACGGGATGAATAACAACTAGAATAAACTGGAAGGGAATGCACAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTAGTGGGCTGACTATGCTCCTTCACGAGGGGGTAACAAGCGTAAGAAAGTAATTTAACAAGGTAACTAATATTATGCTTTATTATCTGAAAATAATAAATATTAAACTCTCTTGCAATAGATTAATTGAGCGTACTATCTATATTAGATCTTCTCTATTGTACTAGTTACGCTATTTCTA                                                                                                                                                                       ]


>consensus_6145#0 ATAGCGCTGGGAAATAGAAGCAGATATGAAAGGGATGAATAACAACTAGAAAAAACTGGA AGGGAATGCACAGGACAGGGTTGGATGGAGAATGCTAGTGGGCTGACTATGCTCCTTCAC GAGGGGGTAACAAGCGTAAGAAAGTAATTTAACAAGGTAACTAATATAATGCTTTATAAT CTGAAAATAATAAATATGAAACTCTCTTGCAATAGATTAATTGAGCGTACTATCTATATT AGATCTTCTCTATTGTACTAGTTACGCTATTTCTAAATCACTTCAATGATAATCATCACT TTTTCTCCTAATGCTTAATAATAGTACTTACAAGACATTGCTTGAATTTCTTGATAGATA AGTTGAAATCTCATAATTCACTTAAGCCAAAAATAATTTTAATGGTTGATATCATGATTC AATCGAAGCTAGAACATCATTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)