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Schistosoma mansoni
cluster # 6149 cluster # 6149       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6149#0 length = 667 sequences # 4  

consensusID : consensus_6149#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 667
fasta sequence
                              [TGTGAAAGAGACTTCTAACGATGTGGTTTGGAAATATACTTAGTATTTAGAATGAACAATTTTGATGAAGTATATTTAACAGTAATAGGAGAATGAAGAAGCTTCATAATGTTGTAATCAAAACGGTGGGTGACCACATTGTATCTAACTAGTAGTATATCTTAAAAGAAGCTGTATATTCGATGGTGTTATTAAGGTATCAAATAAGGAGAGATATAACAGAAATGAGTTTACTCTTCATCTTATTCTAACTCAGCTAAAAAAAATGTATGTAAGCTTAAGTGTTGATTAGTGTTATCTATCAGACATTATTTCAATCTGAATAGTCAAAAACTATCCAGGTCGGTAGTTCATATATGAGTTCTTTAATAGTATAGAATGTCGTGCTTGTAGTTGGATGTTATTATTAGTCTAGAAACTGCCAACCAACCATACATACCGATCAATGGTATGCCTGATGAACTTTACAAATTTTATTTTAAATGAAGGTATGTGAAGTTTAAGATTAATTAAAGGTGATGAAAACAATAGAGAAGTATACGATACAAGACTGCTTGTGATTTACACAAAATTCATCAAATATAGAAAGGATTAAGTGTTTATTTGAAAAAATGACTAAGCTAATGTAAGAAAGACGTGACTTATTGTGACATATTTTAGGTAAATC]

[+] EMBL CD116826             [TGTGAAAGAGACTTCTAACGATGTGGTTTGGAAATATACTTAGTATTTAGAATGAACAATTTTGATGAAGTATATTTAACAGTAATAGGAGAATGAAGAAGCTTCATAATGTTGTAATCAAAACGGTGGGTGACCACATTGTATCTAACTAGTAGTATATCTTAAAAGAAGCTGTATATTCGATGGTGTTATTAAGGTATCAAATAGGGAGAGATATAACAGAAATGAGTTTACTCTTCATCTTATTCTAACTCAGCTAAAAAAAATGTATGTAAGCTTAAGTGTTGATTAGTGTTATCTATCAGACATTATTTCAATCTGAATAGTCAAAAACTATCCAGGTCGGTAGTTCATATATGAGTTCTTTAATAGTATAGAATGTCGTGCTTGTAGTTGGATGTTATTATTAGTCTAGAAACTGCCAACCAACCATACATACCGATCAATGGTATGCCTGATGAACTTTACAAATTTTATTTTAAATGAAGGTATGTGAAGTTTAAGATTAATTAAAGGTGATGAAAACAATAGAGAAGTATACGATACAAGACTGCTTGTGATTTACACAAAATTCACCANATATAGAAAGGATTAAGTGTTTATTTGAAAAAATGACTAAGCTAATGTAAGAAAGACGTGACTTATTGTGACATATTTTAGGTAAAT ]
[+] EMBL CD116875             [TGTGAAAGAGACTTCTAACGATGTGGTTTGGAAATATACTTAGTATTTAGAATGAACAATTTTGATGAAGTATATTTAACAGTAATAGGAGAATGAAGAAGCTTCATAATGTTGTAATCAAAACGGTGGGTGACCACATTGTATCTAACTAGTAGTATATCTTAAAAGAAGCTGTATATTCGATGGTGTTATTAAGGTATCAAATAAGGAGAGATATAACAGAAATGAGTTTACTCTTCATCTTATTCTAACTCAGCTAAAAAAAATGTATGTAAGCTTAAGTGTTGATTAGTGTTATCTATCAGACATTATTTCAATCTGAATAGTCAAAAACTATCCAGGTCGGTAGTTCATATATGAGTTCTTTAATAGTATAGAATGTCGTGCTTGTAGTTGGATGTTATTATTAGTCTAGAAACTGCCAACCAACCATACATACCGATCAATGGTATGCCTGATGAACTTTACAAATTTTATTTTAAATGAAGGTATGTGAAGTTTAAGATTAATTAAAGGTGATGAAAACAATAGAGAAGTATACGATACAAGACTGCTTGTGATTTACACAAAATTCATCAAATATAGAAAGGATTAAGTGTTTATTTGAAAAAATGACTAAGCTA                                            ]
[+] EMBL CD116711             [TGTGAAAGAGACTTCTAACGATGTGGTTTGGAAATATACTTAGTATTTAGAATGAACAATTTTGATGAAGTATATTTAACAGTAATAGGAGAATGAAGAAGCTTCATAATGTTGTAATCAAAACGGTGGGTGACCACATTGTATCTAACTAGTAGTATATCTTAAAAGAAGCTGTATATTCGATGGTGTTATTAAGGTATCAAATAAGGAGAGATATAACAGAAATGAGTTTACTCTTCATCTTATTCTAACTCAGCTAAAAAAAATGTATGTAAGCTTAAGTGTTGATTAGTGTTATCTATCAGACATTATTTCAATCTGAATAGTCAAAAACTATCCAGGTCGGTAGTTCATATATGAGTTCTTTAATAGTATAGAATGTCGTGCTTGTAGTTGGATGTTATTATTAGTCTAGAAACTGCCAACCAACCATACATACCGATCAATGGTATGCCTGATGAACTTTACAAATTTTATTTTAAATGAAGGTATGTGAAG                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD116716             [  gGAAAGAGACTTCTAACGATGTGGTTTGGAAATATACTTAGTATTTAGAATGAACAATTTTGATGAAGTATATTTAACAGTAATAGGAGAATGAAGAAGCTTCATAATGTTGTAATCAAAACGGTGGGTGACCACATTGTATCTAACTAGTAGTATATCTTAAAAGAAGCTGTATATTCGATGGTGTTATTAAGGTATCAAATAAGGAGAGATATAACAGAAATGAGTTTACTCTTCATCTTATTCTAACTCAGCTAAAAAAAATGTATGTAAGCTTAAGTGTTGATTAGTGTTATCTATCAGACATTATTTCAATCTGAATAGTCAAAAACTATCCAGGTCGGTAGTTCATATATGAGTTCTTTAATAGTATAGAATGTCGTGCTTGTAGTTGGATGTTATTATTAGTCTAGAAACTGCCAACCAACCATACATACCGATCAATGGTATGCCTGATGAACTTTACAAATTTTATTTTAAATGAAGGTATGTGAAGTTTAAGATTAATTAAAGGTGATGAAAACAATAGAGAAGTATACGATACAAGACTGCTTGTGATTTACACAAAATTCATCAAATATAGAAAGGATTAAGTGTTTATTTGAAAAAATGACTAAGCTAATGTAAGAAAGACGTGACTTATTGTGACATATTTTAGGTAAATC]


>consensus_6149#0 TGTGAAAGAGACTTCTAACGATGTGGTTTGGAAATATACTTAGTATTTAGAATGAACAAT TTTGATGAAGTATATTTAACAGTAATAGGAGAATGAAGAAGCTTCATAATGTTGTAATCA AAACGGTGGGTGACCACATTGTATCTAACTAGTAGTATATCTTAAAAGAAGCTGTATATT CGATGGTGTTATTAAGGTATCAAATAAGGAGAGATATAACAGAAATGAGTTTACTCTTCA TCTTATTCTAACTCAGCTAAAAAAAATGTATGTAAGCTTAAGTGTTGATTAGTGTTATCT ATCAGACATTATTTCAATCTGAATAGTCAAAAACTATCCAGGTCGGTAGTTCATATATGA GTTCTTTAATAGTATAGAATGTCGTGCTTGTAGTTGGATGTTATTATTAGTCTAGAAACT GCCAACCAACCATACATACCGATCAATGGTATGCCTGATGAACTTTACAAATTTTATTTT AAATGAAGGTATGTGAAGTTTAAGATTAATTAAAGGTGATGAAAACAATAGAGAAGTATA CGATACAAGACTGCTTGTGATTTACACAAAATTCATCAAATATAGAAAGGATTAAGTGTT TATTTGAAAAAATGACTAAGCTAATGTAAGAAAGACGTGACTTATTGTGACATATTTTAG GTAAATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)