These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6191#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 593 fasta sequence [ACAATATTAGGTGATTGTTGACTGTATTCACTTGTGATTATGCATTTTTCATTATATACAAATGAATTGGTTTTGCTAGTATTGTTATCAATATTATCTTTTATCATCTCAACTTGTTGCTGTTGATGTTCTAAAGCAGTCTCGTCAACATTTTCATTTTGTCTTATAATATGCTCCTGTTTGTCAGAATTATTATTATCGACACAAGATAGTTTAAATTCCTGACTTATTGATTGATTTATTGGTATTTGATCATCTTTGTAATATTCAAACGGTTTCAAAATCTGAATATCTTCTTCCATGGATTTTTCAGTAGTGTTATTACCAATATTATTGTTACCATTATTCGTAGAAATCTCATGTTCATATGACGACCAGTCATCATCATCATTCTCTTCTGATGCTTCATCAATTGTAGTTAATGAATGTCCATTATCATAGACTTTAAAATCTTCACTGTTTAGATTTCTACTATTCACATCATTGTTATTTTCAGTCAAATACTTATTACCGATTGATAATGTAATTGTGTCATTATTTGATATAATCATATTTTGTAATTTGATTTCGTCTGAGGCTAAATTACCGAATGT] [+] EMBL CD117409 [ACAATATTAGGTGATTGTTGACTGTATTCACTTGTGATTATGCATTTTTCATTATATACAAATGAATTGGTTTTGCTAGTATTGTTATCAATATTATCTTTTATCATCTCAACTTGTTGCTGTTGATGTTCTAAAGCAGTCTCGTCAACATTTTCATTTTGTCTTATAATATGCTCCTGTTTGTCAGAATTATTATTATCGACACAAGATAGTTTAAATTCCTGACTTATTGATTGATTTATTGGTATTTGATCATCTTTGTAATATTCAAACGGTTTCAAAATCTGAATATCTTCTTCCATGGATTTTTCAGTAGTGTTATTACCAATATTATTGTTACCATTATTCGTAGAAATCTCATGTTCATATGACGACCAGTCATCATCATCATTCTCTTCTGATGCTTCATCAATTGTAGTTAATGAATGTCCATTATCATAGACTTTAAAATCTTCACTGTTTAGATTTCTACTATTCACATCATTGTTATTTTCAGTCAAATACTTATTACCGATTGATAATGTAATTGTGTCATTATTTGATATAATCATATTTTGTAATTTGATTTCGTCTGAGGCTAAATTACCGAATGT] [+] EMBL CD117748 [ACAATATTAGGTGATTGTTGACTGTATTCACTTGTGATTATGCATTTTTCATTATATACAAATGAATTGGTTTTGCTAGTATTGTTATCAATATTATCTTTTATCATCTCAACTTGTTGCTGTTGATGTTCTAAAGCAGTCTCGTCAACATTTTCATTTTGTCTTATAATATGCTCCTGTTTGTCAGAATTATTATTATCGACACAAGATAGTTTAAATTCCTGACTTATTGATTGATTTATTGGTATTTGATCATCTTTGTAATATTCAAACGGTTTCAAAATCTGAATATCTTCTTCCATGGATTTTTCAGTAGTGTTATTACCAATATTATTGTTACCATTATTCGTAGAAATCTCATGTTCATATGACGACCAGTCATCATCATCATTCTCTTCTGATGCTTCATCAATTGTAGTTAATGAATGTCCATTATCATAGACTTTAAAATCTTCACTGTTTAGATTTCTACTATTCACATCATTGTTATTTTCAGTCAAATACTTATTACCGATTGATAATGTAAT ] [+] EMBL CD117777 [ACAATATTAGGTGATTGTTGACTGTATTCACTTGTGATTATGCATTTTTCATTATATACAAATGAATTGGTTTTGCTAGTATTGTTATCAATATTATCTTTTATCATCTCAACTTGTTGCTGTTGATGTTCTAAAGCAGTCTCGTCAACATTTTCATTTTGTCTTATAATATGCTCCTGTTTGTCAGAATTATTATTATCGACACAAGATAGTTTAAATTCCTGACTTATTGATTGATTTATTGGTATTTGATCATCTTTGTAATATTCAAACGGTTTCAAAATCTGAATATCTTCTTCCATGGATTTTTCAGTAGTGTTATTACCAATATTATTGTTACCATTATTCGTAGAAATCTCATGTTCATATGACGACCAGTCATCATCATCATTCTCTTCTGATGCTTCATCAATTGTAGTTAATGAATGTCCATTATCATAGACTTTAAAATCTTCACTGTTTAGATTTCTACTATTCACATCATTGTTATTTTCAGTCAAATACTTATTACCGATTGATAATGT ] [+] EMBL CD117770 [ACAATATTAGGTGATTGTTGACTGTATTCACTTGTGATTATGCATTTTTCATTATATACAAATGAATTGGTTTTGCTAGTATTGTTATCAATATTATCTTTTATCATCTCAACTTGTTGCTGTTGATGTTCTAAAGCAGTCTCGTCAACATTTTCATTTTGTCTTATAATATGCTCCTGTTTGTCAGAATTATTATTATCGACACAAGATAGTTTAAATTCCTGACTTATTGATTGATTTATTGGTATTTGATCATCTTTGTAATATTCAAACGGTTTCAAAATCTGAATATCTTCTTCCATGGATTTTTCAGTAGTGTTATTACCAATATTATTGTTACCATTATTCGTAGAAATCTCATGTTCATATGACGACCAGTCATCATCATCATTCTCTTCTGATGCTTCATCAATTGTAGTTAATGAATGTCCATTATCATAGACTTTAAAATCTTCACTGTTTAGATTTCTACTATTCACATCATTGTTATTTTCAGTCAAATACTTAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||