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Schistosoma mansoni
cluster # 6199 cluster # 6199       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6199#0 length = 841 sequences # 4  

consensusID : consensus_6199#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 841
fasta sequence
                              [GGAGGACACTGAGGCTAGTCAATCAGAGTGGAGCTTATGTAAATGAAATGGATATCACGAAAAGATGTTGAAGTTATAGAGAATGTAAAGTTTTAGAATGCTAACATCCGAACTGTATTATCCTAGACGTAATACTCTTAAAACAATCTCATTTCTCGACCTCATACATTCATTGCATATCGTTTCCTGACCACAACGACTTGAGATGCTCTTTTTCAATAATTGTTATCCGTTATTCTGGGATGTTTGTAAGAATATAAGCAAAGATGGATAGTGACTAGCAATGGAATTCAGGACGCGCGTTTCATCCTATTTGGGGCTCGTCAGCTGGATGTACTTGCATCTCAGAGTTAATGTTCACTCAGTGACTCGAACCTAGTACCCCTCGCTTTAGACGCCATCACGTTATCTGCTTAGATACTGAGTCCTGATAGTCAATTGCTTGTGCAATATGATATGCTCATACGCCAATAAGAGACTGACCAATTGCAGTCTGTTATGCCCCGATAAGGATA-ATGAATGGTAACTTTGGGATCCATTTGTAGACCAATAATATGCATATATATTTTTTATCGTATAATCGCTAAATAACTAAACTATTCATATTTGTGTCCCCCTTATTATAAGCTTTATTTTGACCCATATACTATTATTATACGATTTACCATTCATGAATTACGCCGTTTCCTAATTACTGTTTCCCCCTATTCATAGCTACATTTGGCTAAATCTTGTTATTTTCTATTTTATGGTACTATGTGGCCAGTTTGATAGGTATATAAACTCAGTATTTTTGAAATATAATGATTTACACCTCAGAG-ACTGAGATTGGTGTTCTGGA]

[+] EMBL CD113296             [GGAGGACACTGAGGCTAGTCAATCAGAGTGGAGCTTATGTAAATGAAATGGATATCACGAAAAGATGTTGAAGTTATAGAGAATGTAAAGTTTTAGAATGCTAACATCCGAACTGTATTATCCTAGACGTAATACTCTTAAAACAATCTCATTTCTCGACCTCATACATTCATTGCATATCGTTTCCTGACCACAACGACTTGAGATGCTCTTTTTCAATAATTGTTATCCGTTATTCTGGGATGTTTGTAAGAATATAAGCAAAGATGGATAGTGACTAGCAATGGAATTCAGGACGCGCGTTTCATCCTATTTGGGGCTCGTCAGCTGGATGTACTTGCATCTCAGAGTTAATGTTCACTCAGTGACTCGAACCTAGTACCCCTCGCTTTAGACGCCATCACGTTATCTGCTTAGATACTGAGTCCTGATAGTCAATTGCTTGTGCAATATGATATGCTCATACGCCAATAAGAGACTGACCAATTGCAGTCTGCTATGCCCCGATAAGGATA ATGAATGGTAACTTTGGGATCCATTTGTAGACCAATAATATGCATATATATTTTTTATCGTATAATCGCTAAATAACTAAACTATTCATATTTGTGTCCCCCTTATTATAAGCTTTATTTTGACCCATATACTATTATTATACGATT                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD113343             [                                                                                                                                                                                                                               TGTTATCCGTTATTCTGGGATGTTTGTAAGAGTATAAGCAAAGATGGATAGTGACTAGCAATGGAATTCAGGACGCGCGTTTCATCCTATTTGGGGCTCGTCAGCTGGATGTACTTGCATCTCAGAGTTAATGTTCACTCAGTGACTCGAACCTAGTACCCCTCGCTTTAGACGCCATCACGTTATCTGCTTAGATACTGAGTCCTGATAGTCAATTGCTTGTGCAATATGATATGCTCATACGCCAATAAGAGACTGACCAATTGCAGTCTGTTATGCCCCGATAAGGATA ATGAATGGTAACTTTGGGATCCATTTGTAGACCAATAATATGCATATATATTTTTTATCGTATAATCGCTAAATAACTAAACTATTCATATTTGTGTCCCCCTTATTATAAGCTTTATTTTGACCCATATACTATTATTATACGATTTACCATTCATGAATTACGCCGTTTCCTAATTACTGTTTCCCCCTATTCATAGCTACATTTGGCTAAATATTGTTATTTTCTATTTTATGGTACTATGTGGTCAGTTTGATAGGTATATAAACTCAGTATTTTTGAAATATAATGATTTACACCTCAGAG ACTGAGATTGGTGTTCTGGA]
[-] EMBL CD113399             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACGTTATCTGCTTAGATACTGAGTCCTGATAGTCAATTGCTTGTGCAATATGATATGCTCATACGCCAATAAGAGACTGACCAATTGCAGTCTGTTATGCCCCGATAAGGATACATGAATGGTAACTCTGGGATCCATTTGTAGACCAATAATATGCATATATATTTTTTATCGTATAATCGCTAAATAACTAAACTATTCATATTTGTGTCCCCCTTATTATAAGCTTTATTTTGACCCATATACTATTATTATACGATTTACCATTCATGAATTACGCCGTTTCCTAATTACTGTTTCCCCCTATTCATAGCTACATTTGGATAAATCTTGTTATTTTCTATTTTATGGTACTATGTGGCCAGTTTGATAGGTATATAAACTCAGTATTTTTGAAATATAATGATTTACACCTCAGAG ACTGAGATTGGTGTTATGGA]
[-] EMBL CD113433             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCCCCCTATTCATAGCTACATTTGGCTAAATCTTGTTATTTTCAAATANAAGGTACTATGTGGCCAGTTTGATAGGTATATAAACTCAGTATTTTTGAAATATAATGATTTACACCTCAGAGAACTGAc              ]


>consensus_6199#0 GGAGGACACTGAGGCTAGTCAATCAGAGTGGAGCTTATGTAAATGAAATGGATATCACGA AAAGATGTTGAAGTTATAGAGAATGTAAAGTTTTAGAATGCTAACATCCGAACTGTATTA TCCTAGACGTAATACTCTTAAAACAATCTCATTTCTCGACCTCATACATTCATTGCATAT CGTTTCCTGACCACAACGACTTGAGATGCTCTTTTTCAATAATTGTTATCCGTTATTCTG GGATGTTTGTAAGAATATAAGCAAAGATGGATAGTGACTAGCAATGGAATTCAGGACGCG CGTTTCATCCTATTTGGGGCTCGTCAGCTGGATGTACTTGCATCTCAGAGTTAATGTTCA CTCAGTGACTCGAACCTAGTACCCCTCGCTTTAGACGCCATCACGTTATCTGCTTAGATA CTGAGTCCTGATAGTCAATTGCTTGTGCAATATGATATGCTCATACGCCAATAAGAGACT GACCAATTGCAGTCTGTTATGCCCCGATAAGGATAATGAATGGTAACTTTGGGATCCATT TGTAGACCAATAATATGCATATATATTTTTTATCGTATAATCGCTAAATAACTAAACTAT TCATATTTGTGTCCCCCTTATTATAAGCTTTATTTTGACCCATATACTATTATTATACGA TTTACCATTCATGAATTACGCCGTTTCCTAATTACTGTTTCCCCCTATTCATAGCTACAT TTGGCTAAATCTTGTTATTTTCTATTTTATGGTACTATGTGGCCAGTTTGATAGGTATAT AAACTCAGTATTTTTGAAATATAATGATTTACACCTCAGAGACTGAGATTGGTGTTCTGG A



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)