cluster # 6200

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Schistosoma mansoni
cluster # 6200 cluster # 6200 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6200#0 length = 679 sequences # 4

consensusID : consensus_6200#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 679
fasta sequence

                              [TCGTACACCGATTATTAACGTGAGTTATCCATTTACAACTGGAAATTTAAGTACGAACCGCCTACCTATTATTGGACATTCTACATATACATCTGGTAAAAATAAAATAACATTTGGAAGTTTACCACTACCAATGTGTACTATTAATTCTACTGTGAAAAATTTAAATGGATCACAACAACAGGAGGGATTTCCCATTGCTCATTGTAGACGACAAAACAATAATAATAATAATATACCTTCAAACATTAGCAACATTTCAGTTTGTTCAGTGGGTAATTTAAATTCAGTAAAACAAGCAGGTCCGAATTCCCAACTGTCAGGTAATAAATCACGTTGTTGTACGAATGGTCAAATGGCATCGGGAGCAGTTACAACAATAACACCATCAGATTCATTATTATATCCAGGTACAGAATTAGTCAATGGGAAACCAGTTGTAGCTAAATGGCGTCGGGCATGCAGCTTCTACTTACGTGGACATTGTAAAAAAGAAGATTGTGAATTTGCGCATGATTTAACAAAAGTGACTTGTAAATTCTGGGAGATGGGTGAGTGTTTCAAAGGATCCACCTGTCCATTTCTACACGGTTATCCACCAGAATTGAATATTGAGCAGCAGCATTCATAAGTAATAAACTGAAATATGCATGTGTGTACATGGGCAGCTTTTAGTATG]

[+] EMBL CD124550             [TCGTACACCGATTATTAACGTGAGTTATCCATTTACAACTGGAAATTTAAGTACGAACCGCCTACCTATTATTGGACATTCTACATATACATCTGGTAAAAATAAAATAACATTTGGAAGTTTACCACTGCCAATGTGTACTATTAATTCTACTGCGAAAAATTTAAATGGATCACAACAACAGGAGGGATTTCCCATTGCTCATTGTAGACGACGAAACAATAATAATAATAATATACCTTCAAACATTAGCAACATTTCAGTTTGTTCAGTGGGTAATTTAAATTCAGTAAAACAAGCAGGTCCGAATTCCCAACTGTCAGGTAATAAATCACGTTGTTGGACGAATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AW017060             [                                                                                                               ATTTGGAAGTTTACCACTACCAATGTGTACTATTAATTCTACTGTGAAAAATTTAAATGGATCACAACAACAGGAGGGATTTCCCATTGCTCATTGTAGACGACAAAACAATAATAATAATAATATACCTTCAAACATTAGCAACATTTCAGTTTGTTCAGTGGGTAATTTAAATTCAGTAAAACAAGCAGGTCCGAATTCCCAACTGTCAGGTAATAAATCACGTTGTTGTACGAATGGTCAAATGGCATCGGGAGCAGTTACAACAATAACACCATCAGATTCATTATTATATCCAGGTACAGAATTAGTCAATGGGAAACCAGTTGTAGCTAAATGGCGTCGGGCATGCAGCTTCTACTTACGTGGACATTGTAAAAAAGAAGATTGTGAATTTGCGCATGATTTAACAAAAGTGACTTGTAAATTCTGGGAGATGGGTGAGTGTTTCAAAGGATCCACCTGTCCATTTCTACACGGTTATCCACCAGAATTGAATATTGAGCAGCAGCATTCATAAGTAATAAACTGAAATATGCATGTGTGTACATGGGCAGCTTTTAGTATG]
[+] EMBL AW017041             [                                                                                                               ATTTGGAAGTTTACCACTACCAATGTGTACTATTAATTCTACTGTGAAAAATTTAAATGGATCACAACAACAGGAGGGATTTCCCATTGCTCATTGTAGACGACAAAACAATAATAATAATAATATACCTTCAAACATTAGCAACATTTCAGTTTGTTCAGTGGGTAATTTAAATTCAGTAAAACAAGCAGGTCCGAATTCCCAACTGTCAGGTAATAAATCACGTTGTTGTACGAATGGTCAAATGGCATCGGGAGCAGTTACAACAATAACACCATCAGATTCATTATTATATCCAGGTACAGAATTAGTCAATGGGAAACCAGTTGTAGCTAAATGGCGTCGGGCATGCAGCTTCTACTTACGTGGACATTGTAAAAAAGAAGATTGTGAATTTGCGCATGATTTAACAAAAGTGACTTGTAAATTCTGGGAGATGGGTGAGTGTTTCAAAGGATCCACCTGTCCATTTCTACACGGTTATCCACCAGAATTGAATATTGAGCAGCAGCATTCATAAGTCATAAACTGAAATATGCATGTGTGT                     ]
[+] EMBL CD164805             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AACTGTCAGGTAATAAATCACGTTGTTGTACGAATGGTCAAATGGCATCGGGAGCAGTTACAACAATAACACCATCAGATTCATTATTATATCCAGGTACAGAATTAGTCAATGGGAAACCAGTTGTAGCTAAATGGCGTCGGGCATGCAGCTTCTACTTACGTGGACATTGTAAAAAAGAAGATTGTGAATTTGCGCATGATTTAACAAAAGTGACTTGTAAATTCTGGGAGATGGGTGAGTGTTTCAAAGGATCCACCTGTCCATTTCTACACGGTTATCCACCAGAATTGA                                                                       ]




>consensus_6200#0
TCGTACACCGATTATTAACGTGAGTTATCCATTTACAACTGGAAATTTAAGTACGAACCG
CCTACCTATTATTGGACATTCTACATATACATCTGGTAAAAATAAAATAACATTTGGAAG
TTTACCACTACCAATGTGTACTATTAATTCTACTGTGAAAAATTTAAATGGATCACAACA
ACAGGAGGGATTTCCCATTGCTCATTGTAGACGACAAAACAATAATAATAATAATATACC
TTCAAACATTAGCAACATTTCAGTTTGTTCAGTGGGTAATTTAAATTCAGTAAAACAAGC
AGGTCCGAATTCCCAACTGTCAGGTAATAAATCACGTTGTTGTACGAATGGTCAAATGGC
ATCGGGAGCAGTTACAACAATAACACCATCAGATTCATTATTATATCCAGGTACAGAATT
AGTCAATGGGAAACCAGTTGTAGCTAAATGGCGTCGGGCATGCAGCTTCTACTTACGTGG
ACATTGTAAAAAAGAAGATTGTGAATTTGCGCATGATTTAACAAAAGTGACTTGTAAATT
CTGGGAGATGGGTGAGTGTTTCAAAGGATCCACCTGTCCATTTCTACACGGTTATCCACC
AGAATTGAATATTGAGCAGCAGCATTCATAAGTAATAAACTGAAATATGCATGTGTGTAC
ATGGGCAGCTTTTAGTATG

clustalw multiple alignements is not computed in this case